低出生体重大鼠肾组织中lncRNA表达谱的差异分析

论文摘要

目的应用长链非编码RNA（lncRNA）基因芯片技术分析低出生体重（LBW）大鼠肾组织中lncRNA的表达情况。方法通过妊娠和哺乳期给予22%常规饲料建立Control组和6%低蛋白饲料建立LBW组大鼠模型。酸消化法计数生后10 d大鼠的肾小球数目;lncRNA芯片技术对两组大鼠肾脏表达的lncRNA进行差异筛选,生物信息学技术对差异显著的lncRNA与肾脏发育密切相关的编码基因mRNA行相关性分析。实时定量PCR（qRT-PCR）验证芯片结果并检测其在生后1 d和10 d大鼠肾组织中的表达水平。结果 LBW组大鼠生后1和10 d的体重、生后10 d的肾小球数目均低于Control组（均P<0.01）,且肾小球数目与出生体重呈正相关（rs=0.73,P=0.003）。基因芯片和信息学分析显示两组差异表达的lncRNA 42个（折叠倍率≥2,P<0.05）,其中16种lncRNA与丝裂原活化蛋白激酶4（MAPK4）mRNA表达显著相关（r=0.90,P<0.05）。qRT-PCR结果显示lncRNA TCONS00014139和TCONS00014138在生后1 d LBW组大鼠肾组织中相对高表达,生后10 d相对低表达,与肾单位数目呈正相关（P<0.01）;lncRNA TCONS00017119在生后1和10 d LBW组肾组织持续高表达,与肾单位数目呈负相关（P=0.001）。结论两组大鼠肾组织中存在lncRNA的差异表达,且与肾脏发育密切相关的MAPK4 mRNA的表达有关,其中lncRNA TCONS00014139、TCONS00014138和TCONS00017119与肾单位数目显著相关,提示lncRNA在低出生体重大鼠肾脏发育障碍中可能发挥重要作用。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 实验动物
•   1.2 模型建立
•   1.3 标本采集
•   1.4 肾小球计数
•   1.5 基因芯片技术筛选差异表达的lncRNA
•   1.6 生物信息学分析
•   1.7 qRT-PCR
•   1.8 统计学处理
• 2 结果
•   2.1 两组大鼠体重和肾小球数目的比较
•   2.2 两组大鼠肾脏组织中差异表达的lncRNA
•   2.3 差异表达的lncRNA与肾脏发育有关编码基因的相关性分析
•   2.4 qRT-PCR验证芯片的结果
•   2.5 lncRNA在生后1 d和10 d两组大鼠肾脏组织中的表达
•   2.6 差异表达的lncRNA与肾小球数目的相关性
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 黄慧,王雪芹,孙云清,李根,李艳红

关键词: 长链非编码,低出生体重,肾发育,基因芯片

来源: 华中科技大学学报(医学版) 2019年06期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 儿科学

单位: 苏州大学附属儿童医院肾脏科,苏州大学附属儿童医院儿科临床研究院

基金: 国家自然科学基金资助项目(No.81741054),江苏省自然科学基金资助项目(No.BK20171217),苏州市临床重点病种诊疗技术专项基金资助项目(No.LCZX201611)

分类号: R722.6

页码: 644-649

总页数: 6

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