结合短肽论文_宋铱航,刘思雪,简嘉甫,黄花荣,钟英强

导读:本文包含了结合短肽论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:噬菌体,因子,受体,技术,肿瘤,绿叶,靶向。

结合短肽论文文献综述

宋铱航,刘思雪,简嘉甫,黄花荣,钟英强[1](2019)在《CCR5第一、二胞外环特异性结合短肽对大鼠损伤性结肠上皮细胞的重建作用与机制》一文中研究指出目的探究CC趋化因子受体5(CCR5)第一、二胞外环拮抗短肽对大鼠损伤性结肠上皮细胞的重建作用与机制。方法原代培养大鼠结肠上皮细胞并鉴定;建立由TNF-α诱导的损伤性结肠上皮细胞模型;CCK8法检测两短肽(分别简称GH和HY短肽)对损伤性上皮细胞生长的影响;实时荧光定量PCR和蛋白免疫印迹法检测各组(正常对照组、损伤模型组、各浓度GH短肽组、各浓度HY短肽组)黏蛋白2、occludin、CCR5、表皮生长因子(EGF)、叁叶因子3(TFF3)的mRNA和蛋白表达水平。结果 150 ng/ml TNF-α作用细胞48 h后可获得损伤性上皮细胞;GH和HY短肽在0.125~0.500 mg/ml浓度下均能促进损伤性上皮细胞增殖;0.125~0.500 mg/ml浓度的GH短肽组和HY短肽组occludin、EGF、TFF3的mRNA和蛋白水平均比损伤模型组高(P均<0.05);0.500 mg/ml浓度的GH短肽组和HY短肽组黏蛋白2的mRNA和蛋白的表达均比损伤模型组高(P均<0.05);0.250~1.000 mg/ml浓度的GH短肽组、0.500~1.000mg/ml浓度的HY短肽组CCR5的mRNA和蛋白表水平达均比损伤模型组低(P均<0.05)。结论CCR5第一、二胞外环特异性结合短肽在一定浓度范围内可促进损伤性上皮细胞的增殖,其机制可能与促进黏蛋白2、occludin、EGF、TFF3的表达有关。(本文来源于《新医学》期刊2019年05期)

宋杨达,刘思雪,宋铱航,沈溪明,黄花荣[2](2018)在《CCR5第一和第二胞外环特异性结合短肽对大鼠结肠炎的炎症细胞浸润及NF-κB/TNF-α信号通路的影响》一文中研究指出目的研究CC趋化因子受体5(CCR5)第一和第二胞外环特异性结合短肽对叁硝基苯磺酸(TNBS)诱导的SD大鼠结肠炎的炎症细胞浸润及NF-κB/TNF-α信号通路的影响。方法采用5%TNBS构建大鼠结肠炎模型,分别给予2种CCR5短肽干预,通过病理细胞学分析、蛋白免疫印迹法、PCR等方法分别评估其组织学、基因及蛋白质水平的变化。结果与模型组相比,2组给予CCR5拮抗短肽的大鼠均表现为结肠炎组织学损伤减轻(P均<0.05),镜下可见中性粒细胞、淋巴细胞及巨噬细胞浸润减少(P均<0.05)。同时,NF-κB/TNF-α信号通路相关的蛋白及mRNA表达水平也较之模型组明显下降(P均<0.05)。结论特异性结合CCR5第一和第二胞外环的短肽可明显抑制TNBS诱导的SD大鼠结肠炎症,其机制可能是通过抑制NF-κB/TNF-α信号通路的激活。(本文来源于《新医学》期刊2018年05期)

王帅帅[3](2016)在《MM/PBSA方法计算抗原短肽与HLA-A~*0201分子结合自由能》一文中研究指出以CTL (cytotoxic T cell)表位为基础制备表位疫苗,是目前对恶性肿瘤等影响人类健康的重要疾病进行免疫治疗的重要方法之一。在细胞免疫的内源性抗原提呈过程中,含有CTL表位的抗原需要首先与主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex, MHC)Ⅰ类分子结合才能被提呈到靶细胞表面,从而有机会被CTL细胞识别。因此,研究MHC Ⅰ类分子与抗原短肽的结合作用对CTL表位的鉴定具有重要意义。人类的MHC分子称为HLA分子,其中HLA Ⅰ类分子按基因编码位点的不同可分为HLA-A, HLA-B和HLA-C。研究表明,在HLA-A类分子中,HLA-A~*0201型别在各人种中具有最广泛的分布。因此,鉴定HLA-A~*0201分子的CTL限制表位对各人种的肿瘤等疾病的免疫治疗有重要作用。本文选择HLA-A~*0201分子和抗原结合肽(序列为LLFGYPVYV)分别作为蛋白质结合作用的受体与配体,计算二者的结合自由能。首先,使用分子动力学(molecular dynamics, MD)结合MM/PBSA (molecular mechanics/Poisson-Boltzmann surface area continuum solvation)方法对结合过程进行模拟,得到受体与配体间的结合自由能为-157.84 kJ·mokl-1,与实验值的相对误差为13.94%。为了提高使用MM/PBSA方法计算结合自由能的准确度,使用QM/MM (quantum mechanics/molecular mechanics)算法结合MM/PBSA方法对结合过程进行模拟,得到的结合自由能计算值为-173.68 kJ·mol-1,与实验值的相对误差为5.31%。最后,通过对结合自由能的各能量项进行分析,得出结论:范德华力与非极性溶剂化作用是HLA-A~*0201与抗原短肽结合过程中最重要的驱动力。(本文来源于《大连理工大学》期刊2016-05-01)

胡义,林山,李珣,戴淑惠,杨阳[4](2016)在《CCR9亲和短肽的筛选及其结合活性的鉴定》一文中研究指出目的获取与CC趋化因子受体9(CCR9)具有亲和力的特定短肽。方法以CCR9的第2个胞外环为靶蛋白,反复筛选Ph.D.-12噬菌体展示肽库获得阳性克隆,通过ELISA测定噬菌体阳性克隆短肽与CCR9的亲和力,共聚焦显微镜检测短肽与CCR9高表达细胞MOLT4结合能力。结果经过3轮淘选、富集,确定了8个噬菌体克隆有插入序列,其中克隆C-4与靶蛋白具有较高亲和力,表达的短肽P1(VHWDFRQWWQPS)可抑制相应C-4克隆与靶蛋白的结合,并可与CCR9高表达的MOLT4细胞结合。结论通过噬菌体肽库筛选出了能与细胞表面分子CCR9结合的短肽序列VHWDFRQWWQPS。(本文来源于《免疫学杂志》期刊2016年01期)

陈重,廉婕,郑金鑫,杨唯枝,王红燕[5](2015)在《采用噬菌体展示技术筛选肠致病性大肠埃希菌EspB蛋白结合短肽的实验研究》一文中研究指出目的探讨是否能够通过噬菌体展示技术筛选与肠致病性大肠埃希菌(EPEC)关键蛋白EspB结合的短肽。方法采用体外大肠埃希菌中表达和纯化EspB蛋白情况,Western blot验证蛋白的表达;Ph.D.12-蛋氨酸噬菌体展示技术用来筛选EspB特异结合蛋白;ELISA方法用来鉴定这些特异性结合蛋白与EspB的亲和力。结果 Western blot验证从pET21b-EspB转染质粒中提取的EspB蛋白。噬菌体展示技术筛选出了噬菌体6、7、8、12候选蛋白,ELISA检测结果显示这些候选蛋白与EspB蛋白的亲和力高于对照蛋白。结论我们的数据提供了一种潜在的研究策略即通过靶向结合EspB蛋白可抑制EPEC对上皮细胞的粘附。(本文来源于《中国微生态学杂志》期刊2015年12期)

林秋秋,姚祖杰,吴松青,刘昭霞,朱棚丽[6](2015)在《假眼小绿叶蝉中肠受体结合短肽的融合表达及其与叶蝉中肠刷状缘膜囊泡(BBMV)互作》一文中研究指出茶假眼小绿叶蝉(Empoasca vitis Gothe)是危害我国经济作物茶叶(Camellia sinensis)的优势种,其发生最广、危害最重。为寻找利用生物农药解决虫害问题,提高茶叶产量质量,同时初步探索苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,Bt)Crystal(Cry)毒素与叶蝉中肠的互作机制,本研究以前期噬菌体文库筛选得到的能与靶标昆虫中肠Cry潜在受体结合的短肽序列设计引物,通过PCR扩增大小为750 bp的短肽序列,与p MD-18T克隆载体连接,构建重组表达载体p T-egfp-32a并进行诱导表达,采用His-tag亲和层析技术对融合蛋白进行纯化,最后通过免疫印迹实验验证表达的短肽与叶蝉中肠刷状缘膜囊泡(brash border membrane vesicle,BBMV)的结合活性。本研究成功克隆了短肽序列,并诱导纯化目的蛋白,成功获得具有结合活性的短肽片段,为活性片段定向改造Cry domain获得对叶蝉有毒性作用的新型毒素提供了工作基础,为进一步了解毒素与受体间互作关系提供依据。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2015年11期)

汪静,高晓娟,吴秀丽[7](2015)在《噬菌体肽库筛选与SK-BR-3细胞表面HER2特异性结合的活性短肽》一文中研究指出目的利用噬菌体展示肽库技术筛选与人乳腺癌细胞表面HER2特异性结合的活性短肽。方法以过表达HER2的人乳腺癌细胞SK-BR-3为靶细胞,Herceptin作为竞争性洗脱剂,采用竞争结合实验,经四轮亲和筛选,获得阳性噬菌体富集;通过ELISA评价与SK-BR-3细胞高特异性结合的阳性噬菌体克隆;分析DNA测序结果并推导短肽序列;采用MTT法比较筛选短肽与Herceptin对SK-BR-3细胞生长的抑制率。结果随机挑选的16个克隆对SK-BR-3细胞具有特异性结合力,其中S-1阳性克隆与靶细胞特异结合活性最强,且其短肽序列对SK-BR-3细胞生长具有一定的抑制作用。结论通过噬菌体展示肽库对过表达HER2乳腺癌细胞进行筛选,获得与SK-BR-3细胞高特异性结合的活性短肽序列,为设计乳腺癌靶向药物与导向治疗提供参考数据。(本文来源于《宁夏医科大学学报》期刊2015年07期)

王乐丹,李文桔,胡越[8](2015)在《卵巢癌细胞SKOV3特异性结合短肽的筛选》一文中研究指出目的:利用噬菌体7肽库进行体外快速差减筛选(biopanning and rapid analysis of selective interactive ligands,BRASIL),从而获得卵巢癌细胞株SKOV3细胞表面特异性结合短肽。方法:以中国仓鼠卵巢细胞株CHO为吸附细胞,卵巢癌细胞株SKOV3为靶细胞,利用噬菌体展示技术联合差减筛选策略,经过连续5轮生物淘洗,随机挑选100个噬菌体单克隆进行ELISA检测,选取读数>0.6的单克隆进行DNA测序并序列分析,选择并合成相应短肽,经细胞免疫荧光验证短肽和卵巢癌细胞SKOV3结合的亲和性及特异性。结果:筛选出的短肽AFSGSLP与卵巢癌细胞株SKOV3有较高的亲和性及特异性。结论:阳性噬菌体表面展示的多肽AFSGSLP可能为卵巢癌的早期诊断和转移复发监测提供新思路。(本文来源于《中国妇幼保健》期刊2015年16期)

钟嘉莉,康佳丽,廖花,刘启才,周聪[9](2014)在《人卵巢癌细胞特异性结合短肽的原核表达及靶向性分析》一文中研究指出目的通过原核表达的方式制备人卵巢癌HO8910细胞株特异性结合短肽(ovarian cancer specific binding peptide 1,OSBP-1)和氨基酸顺序重排的短肽(scrambled peptide,OSBP-S),探讨其对卵巢癌HO8910细胞的靶向特异性。方法构建pGEX-6P-3/OSBP-1与pGEX-6P-3/OSBP-S原核表达载体,转化大肠埃希菌BL21(DE3),进行GST融合蛋白的诱导表达和纯化,纯化后的融合蛋白经SDS-PAGE和蛋白质印迹法分析无误后,进行融合蛋白的酶切及小分子肽Tricine-SDS-PAGE电泳鉴定,N端进行FITC标记。通过细胞免疫荧光和竞争性结合实验分析OSBP-1对人卵巢癌HO8910细胞株的靶向性,以及这种靶向性是否与特定的氨基酸顺序有关;通过亲和性试验研究OSBP-1与其他卵巢癌细胞、不同组织来源的肿瘤细胞及正常细胞的亲和性。结果成功构建了pGEX-6P-3/OSBP-1与pGEX-6P-3/OSBP-S原核表达载体;纯化后的融合蛋白经SDS-PAGE分析显示,出现单一的GST-OSBP-1和GST-OSBP-S蛋白条带;蛋白质印迹法分析证明,融合蛋白能被GST单克隆抗体识别;小分子肽Tricine-SDS-PAGE表明,成功获得OSBP-1和OSBP-S;标记后的FITC-OSBP-1与FITC-OSBP-S经高效液相色谱技术和质谱分析,纯度均>95%。细胞免疫荧光实验显示,FITC-OSBP-1对HO8910细胞有很强的结合能力,能进入细胞内显示很强的绿色荧光,但其与正常卵巢上皮细胞仅个别细胞显示绿光荧光,而FITC-OSBP-S与HO8910细胞和正常卵巢上皮细胞均显示很弱的绿色荧光。另外,随着FITC-OSBP-1浓度的增加,HO8910细胞的荧光强度增强;竞争性结合实验显示,FITC-OSBP-1与HO8910细胞的结合能力随着OSBP-1浓度的增加而下降,平均荧光强度(mean fluorescent intensity,MFI)递减,分别为0.140±0.002 1、0.062±0.001 5、0.027±0.002 0和0.009±0.001 5,差异有统计学意义(F=3 111,P<0.001),而加入不同浓度OSBP-S的MFI无明显变化,分别为0.142±0.004 2、0.142±0.005 7、0.139±0.002 5和0.138±0.001 5,差异无统计学意义,F=0.874,P=0.494;亲和性试验结果显示,FITC-OSBP-1与人卵巢癌HO8910细胞的MFI为0.157 4±0.001 1,明显大于FITC-OSBP-S阴性对照组0.006 2±0.000 5(t=219,P<0.001),与正常卵巢上皮细胞的MFI0.002±0.000 3,明显小于FITC-OSBP-S阴性对照组0.006 3±0.000 5(t=13.462,P<0.001),而与其他卵巢癌细胞OVCAR3、SKOV3、不同组织来源的肿瘤细胞LOVO、HepG2及正常细胞293T的MFI与FITC-OSBP-S阴性对照组分别比较,差异均无统计学意义,P>0.05。结论通过原核表达的方式成功制备OSBP-1和OSBP-S,证实OSBP-1对卵巢癌HO8910细胞具有浓度依赖性和氨基酸序列特异性靶向结合能力,且OSBP-1对正常卵巢上皮细胞几乎没有亲和力,对其他肿瘤细胞及正常细胞293T仅有很弱的亲和力,为卵巢癌的靶向治疗提供了理想的载体。(本文来源于《中华肿瘤防治杂志》期刊2014年22期)

薛琳[10](2014)在《GEBP11短肽对胃癌转移的抑制作用及其结合受体的筛选鉴定》一文中研究指出【背景】肿瘤血管靶向治疗具有诸多优点,如不易产生耐药性、肿瘤抑制谱广、药物易于到达靶部位和毒性较低等,已经成为肿瘤治疗研究领域的热点。当前,肿瘤血管抑制治疗的突出问题是缺乏特异性的针对肿瘤血管的靶分子,小分子短肽因其具有免疫原性低、与配体亲和力高、毒性低、容易合成修饰等优势而成为关注的焦点。前期,我们课题组利用噬菌体肽库筛选技术获得与胃癌血管内皮细胞特异结合的短肽GEBP11,并证实其具有良好的肿瘤血管靶向性和抑制肿瘤血管生成的作用,研究还发现短肽可调控肿瘤血管内皮细胞分子群的表达,影响肿瘤血管内皮细胞的凋亡、增殖、基质降解、迁移和粘附等,所以我们推测短肽可能通过调控肿瘤血管内皮细胞的分子群表达,影响肿瘤血管内皮细胞的凋亡、增殖、基质降解、迁移和粘附能力,进而影响肿瘤血管的生成,最终抑制肿瘤的生长和转移。但是短肽发挥此抑制作用的机制是什么,最初与肿瘤血管表面的什么分子结合发挥此作用,即短肽在肿瘤血管表面的受体分子是什么,这些都不清楚。所以,本课题拟探讨短肽对胃癌细胞迁移、侵袭、运动和增殖能力的影响;分离、纯化并鉴定与GEBP11短肽特异性结合的受体,为研究短肽及其受体抑制肿瘤的分子机制奠定理论基础。【目的】1.探讨GEBP11对胃癌细胞迁移、侵袭、运动和增殖的影响,分析其抑制肿瘤的机制。2.筛选GEBP11的结合受体,为探讨其抑制血管生成的机制奠定基础。【方法】1.体外迁移、侵袭、划痕实验和体内裸鼠实验检测不同浓度短肽对胃癌细胞迁移侵袭能力的影响。2.体外高内涵筛选实验和MTT实验检测不同浓度短肽对胃癌细胞运动和增殖能力的影响。3. Western blot方法检测GEBP11对Co-HUVECs中MMP1和MMP10分子表达的影响。4.质谱法、高效液相色谱法和免疫细胞荧光染色法鉴定生物素标记的GEBP11叁聚体短肽。5. Western blot方法检测GEBP11叁聚体短肽结合受体的理化性质。6.免疫共沉淀-质谱法分离、纯化和鉴定GEBP11叁聚体短肽的结合受体。【结果】1.探讨GEBP11短肽对胃癌肿瘤细胞转移的影响(1)体外迁移、侵袭和划痕实验的结果显示,与不加短肽对照组相比较,当短肽的浓度达到20μg/ml时,就可明显的抑制MKN28M细胞的迁移、侵袭能力;当短肽的浓度增加到50μg/ml和100μg/ml时,该抑制效果仍较明显;但当短肽的浓度继续增大时,抑制效果并不再随短肽浓度的增加而增加。(2)体内裸鼠实验的结果显示短肽可以抑制胃癌MKN28M细胞的肺脏转移能力。(3)体外高内涵筛选实验和MTT实验的结果显示,与不加短肽对照组相比较,当短肽的浓度达到20μg/ml时,就可明显的抑制MKN28M细胞的运动和增殖能力;当短肽的浓度增加到50μg/ml和100μg/ml时,该抑制效果仍较明显;但当短肽的浓度继续增大时,抑制效果并不再增加,与迁移、侵袭和划痕实验的结果类似。(4) Western blot实验证实短肽可降低肿瘤血管内皮细胞中MMP1和MMP10的表达。2.分离纯化并鉴定GEBP11短肽结合的受体(1)质谱和高效液相色谱法和免疫细胞荧光染色法结果证实多聚体短肽为Bio-2PEG-(GEBP11)3和2PEG-(GEBP11)3。(2) Western blot方法证实短肽所结合受体的位置约在36KD处。(3)免疫共沉淀-质谱法结果显示,GEBP11短肽结合的受体可能为蛋白激酶C受体1,即RACK1。【结论】1. GEBP11短肽可抑制胃癌MKN28M细胞的体外迁移、侵袭、运动和增殖能力,并可抑制胃癌MKN28M细胞在祼鼠体内转移瘤灶的形成。2.成功制备生物素标记的GEBP11叁聚体短肽Bio-2PEG-(GEBP11)3。通过免疫沉淀、质谱分析等方法,初步鉴定GEBP11短肽的结合受体为蛋白激酶C受体1(RACK1)。3. GEBP11短肽对胃癌转移的抑制作用可能部分通过以下机制实现:GEBP11短肽与Co-HUVECs中RACK1结合后,通过某些机制直接或间接下调MMP1、MMP10和其他分子的表达,从而抑制胃癌细胞的侵袭转移。(本文来源于《第四军医大学》期刊2014-05-01)

结合短肽论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的研究CC趋化因子受体5(CCR5)第一和第二胞外环特异性结合短肽对叁硝基苯磺酸(TNBS)诱导的SD大鼠结肠炎的炎症细胞浸润及NF-κB/TNF-α信号通路的影响。方法采用5%TNBS构建大鼠结肠炎模型,分别给予2种CCR5短肽干预,通过病理细胞学分析、蛋白免疫印迹法、PCR等方法分别评估其组织学、基因及蛋白质水平的变化。结果与模型组相比,2组给予CCR5拮抗短肽的大鼠均表现为结肠炎组织学损伤减轻(P均<0.05),镜下可见中性粒细胞、淋巴细胞及巨噬细胞浸润减少(P均<0.05)。同时,NF-κB/TNF-α信号通路相关的蛋白及mRNA表达水平也较之模型组明显下降(P均<0.05)。结论特异性结合CCR5第一和第二胞外环的短肽可明显抑制TNBS诱导的SD大鼠结肠炎症,其机制可能是通过抑制NF-κB/TNF-α信号通路的激活。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

结合短肽论文参考文献

[1].宋铱航,刘思雪,简嘉甫,黄花荣,钟英强.CCR5第一、二胞外环特异性结合短肽对大鼠损伤性结肠上皮细胞的重建作用与机制[J].新医学.2019

[2].宋杨达,刘思雪,宋铱航,沈溪明,黄花荣.CCR5第一和第二胞外环特异性结合短肽对大鼠结肠炎的炎症细胞浸润及NF-κB/TNF-α信号通路的影响[J].新医学.2018

[3].王帅帅.MM/PBSA方法计算抗原短肽与HLA-A~*0201分子结合自由能[D].大连理工大学.2016

[4].胡义,林山,李珣,戴淑惠,杨阳.CCR9亲和短肽的筛选及其结合活性的鉴定[J].免疫学杂志.2016

[5].陈重,廉婕,郑金鑫,杨唯枝,王红燕.采用噬菌体展示技术筛选肠致病性大肠埃希菌EspB蛋白结合短肽的实验研究[J].中国微生态学杂志.2015

[6].林秋秋,姚祖杰,吴松青,刘昭霞,朱棚丽.假眼小绿叶蝉中肠受体结合短肽的融合表达及其与叶蝉中肠刷状缘膜囊泡(BBMV)互作[J].农业生物技术学报.2015

[7].汪静,高晓娟,吴秀丽.噬菌体肽库筛选与SK-BR-3细胞表面HER2特异性结合的活性短肽[J].宁夏医科大学学报.2015

[8].王乐丹,李文桔,胡越.卵巢癌细胞SKOV3特异性结合短肽的筛选[J].中国妇幼保健.2015

[9].钟嘉莉,康佳丽,廖花,刘启才,周聪.人卵巢癌细胞特异性结合短肽的原核表达及靶向性分析[J].中华肿瘤防治杂志.2014

[10].薛琳.GEBP11短肽对胃癌转移的抑制作用及其结合受体的筛选鉴定[D].第四军医大学.2014

论文知识图

六株新型Cry蛋白与褐飞虱中肠BBMV结...、SBQ和GBQ在37oC运输比较短肽Pep作用于GABAB受体再循环(A)细...λ能够在PI3K下游促进AMPA受体Glu...透射电镜观察Cry1Ab-2S对褐飞虱中肠...参与MHCII呈递抗原示意图(引自文献[...

标签:;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  

结合短肽论文_宋铱航,刘思雪,简嘉甫,黄花荣,钟英强
下载Doc文档

猜你喜欢