猪流行性腹泻病毒CH-HeNXX-2017株全基因组序列测定与分析

论文摘要

为了解猪流行性腹泻病毒在河南流行毒株全基因组遗传进化水平,应用RT-PCR方法从疑似猪流行性腹泻病毒感染的病料中扩增出全基因组序列,并将PCR产物纯化后连接pMD20-T载体,转化JM109感受态细胞,挑选单克隆进行测序,获得的序列经过DNA STAR中Edit Sequence软件对全基因组序列进行拼接。结果表明,猪流行性腹泻病毒CH-He NXX-2017株全长28 038 nt（除去poly A）;进化树分析显示,该毒株与IA1,USA Colorado2013,MN和PC22A等毒株亲缘关系较为接近,与国内外早期分离株如CV777,LZC,DR13等毒株亲缘关系较远。揭示猪流行性腹泻病毒一直处于不断的进化中,需要一直密切监控病毒进化趋势,为临床诊断以及疫苗研发等提供理论参考。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 材料
•     1.1.1 病料来源
•     1.1.2 试剂
•   1.2 方法
•     1.2.1 猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒和猪轮状病毒的检测
•     1.2.2 猪流行性腹泻病毒的分离
•     1.2.3 PEDV CH-He NXX-2017株基因组全长的扩增
•     1.2.4 PEDV CH-He NXX-2017株遗传进化分析
• 2 结果与分析
•   2.1 猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒 （TGE） 和猪轮状病毒 （RV） 的RT-PCR检测
•   2.2 猪流行性腹泻病毒的分离
•   2.3 PEDV CH-HeNXX-2017株基因组全长的扩增
•   2.4 PEDV CH-HeNXX-2017株遗传进化分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 焦文强,许峰,徐引弟,王治方,张青娴,王克领,朱文豪,李海利,张立宪,郎利敏

关键词: 猪流行性腹泻病毒,全基因组序列

来源: 山西农业科学 2019年01期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 河南省农业科学院畜牧兽医研究所,河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室

基金: 河南省农业科学院自主创新项目(2018ZC49)

分类号: S852.651

页码: 113-116+120

总页数: 5

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