长江干流浮游细菌群落结构及影响因素

论文摘要

为研究长江干流浮游细菌群落结构的空间分布规律及其环境影响因素,针对细菌16S rRNA基因,采用定量PCR和高通量测序技术,对2015年和2016年采集的长江干流自四川泸州到上海吴淞口共计40个样点进行分析。结果表明:水体中浮游细菌16S rRNA基因丰度为2.64×106～1.44×109copies/L。上游（泸州至秭归）、中游（宜昌至湖口）和下游水体（湖口至上海入海口）的α多样性在3组间都没有呈现出显著差异性。长江干流浮游细菌在门水平上主要由变形菌门（Proteobacteria,7.49%～86.53%）、放线菌门（Actinobacteria,0.27%～54.72%）、厚壁菌门（Firmicutes,0.03%～90.95%）、拟杆菌门（Bacteroidetes,0.50%～45.36%）和异常球菌-栖热菌门（Deinococcus-Thermus,0.00%～23.96%）构成。在属或科水平上主要由丛毛单胞菌科（Comamonadaceae,0.03%～65.67%）、CL500-29marinegroup（0.00%～24.23%）、hgcIclade（0.00%～28.82%）、芽孢杆菌属（Bacillus,0.00%～90.88%）和氢噬胞菌属（Hydrogenophaga,0.03%～38.55%）组成。从上中下游水体的浮游细菌群落组成来看,上游水体相对丰度最高的类群为Bacillus（0.00%～90.88%）,中游和下游为Comamonadaceae（分别为0.60%～65.67%和2.87%～50.64%）。造成上中下游水体中浮游细菌群落组成差异的环境因子各不相同:影响上游的主要为pH和悬浮颗粒物（SS）,影响中游的主要为溶解氧（DO）,影响下游的主要为DO、水温（WT）和总磷（TP）。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 样品采集
•   1.2 理化指标测定
•   1.3 DNA提取、定量PCR扩增及Illumina高通量测序
•   1.4 数据分析
• 2 结果
•   2.1 理化指标空间分布
•   2.2 细菌丰度的空间分布
•   2.3 群落多样性
•   2.4 浮游细菌群落组成
•   2.5 群落组成与环境因子的关系
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 吴晓冰,叶飞,姜毅,吴胜军,刘鸿,王川,张炜,王雨

关键词: 高通量测序,细菌多样性,环境因子

来源: 长江流域资源与环境 2019年07期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 中国科学院重庆绿色智能技术研究院,中国科学院水库水环境重点实验室,中国科学院大学,广州大学大湾区环境研究院

基金: 国家自然科学基金(41303053,41571497),重庆市科学技术委员会社会民生重点研发项目(cstc2017shms-zdyfX0074)

分类号: Q938.8

页码: 1652-1662

总页数: 11

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