铝胁迫下金沙柚3个WRKY基因的生物信息学与表达分析

铝胁迫下金沙柚3个WRKY基因的生物信息学与表达分析

论文摘要

WRKY是植物中特有的具有锌指结构的转录因子家族之一,在植物非生物逆境胁迫应答中起着重要的调控作用。为研究金沙柚WRKY在铝胁迫条件下的作用,研究在前期构建的金沙柚铝胁迫转录组数据基础上,利用生物信息学方法从金沙柚根中得到了能显著响应铝胁迫的3个WRKY基因(Cg4g001470、Cg7g003890和Cg6g010690),开放阅读框长度分别为966、933和993 bp,各编码321、310和330个氨基酸,分别命名为CgWRKY40、CgWRKY70-1和CgWRKY70-2,氨基酸序列和结构分析显示,这3个基因编码的蛋白分别属于WRKY蛋白的IIa、III a和III a类型,PSORT亚细胞定位预测均定位于细胞核。实时荧光定量PCR分析表明,3个WRKY基因在金沙柚的嫩根、老根、茎和叶的表达量存在较大差异,在老根的表达量均最高;在铝胁迫处理后,均能出现不同程度的上调表达,相对表达量分别为处理前的4.58、1.52和12.06倍。在铝胁迫条件下,水杨酸能较大幅度的调控3个WRKY基因的上调表达,分别为对照的133.80、33.39和114.23倍;过氧化氢调控3个WRKY基因出现显著上调表达,分别为对照的86.40倍、7.93倍和102.32倍;水杨酸与过氧化氢共同作用下能调控3个WRKY基因出现不同程度的上调表达,分别为对照的51.81倍、1.51倍、37.72倍。上述研究表明,3个WRKY基因均能参与铝胁迫响应,且均可以被水杨酸、过氧化氢、水杨酸与过氧化氢调控上调表达。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与处理
  •   1.2 WRKY基因的生物信息学分析
  •   1.3 RNA提取及实时荧光PCR分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 WRKY基因的生物信息学分析
  •   2.2 WRKY基因同源性比较
  •   2.3 系统进化分析
  •   2.4 WRKY基因在不同组织中的表达
  •   2.5 在铝胁迫条件下的WRKY表达
  •   2.6 铝胁迫条件下小分子信号物质对金沙柚WRKY表达的影响
  • 3结论与讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘召亮,万水林,闫承璞,王雨亭,胡钟东

    关键词: 金沙柚,生物信息学,表达分析

    来源: 江西农业大学学报 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,工程科技Ⅰ辑

    专业: 环境科学与资源利用,植物保护,园艺

    单位: 江西省农业科学院园艺研究所

    基金: 国家自然科学基金项目(31501718),国家国际科技合作专项(2015DFA31060),江西省农科院创新基金(2013CJJ009,2016CJJ002),国家柑橘产业技术体系(CARS-26),江西省柑橘产业技术体系(JXARS-07)~~

    分类号: X503.23;S666.3

    DOI: 10.13836/j.jjau.2019021

    页码: 163-173

    总页数: 11

    文件大小: 1671K

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