胶孢炭疽菌黑色素合成途径中漆酶蛋白生物信息学分析

论文摘要

胶孢炭疽菌可以侵染桃、核桃等诸多重要农林植物,它可引起生产上诸多经济树种的炭疽病,严重威胁着各国农林业的健康生产。植物病原丝状真菌中黑色素合成途径中关键环节漆酶已经在稻瘟病菌、玉米大斑病菌等进行了较为深入的研究,然而尚未见有关胶孢炭疽菌黑色素合成途径中关键环节漆酶的生物信息学分析报道。本研究以胶孢炭疽菌中漆酶Cg14LAC氨基酸序列为基础,通过TargetP、SignalP、ProtComp、Phyre、big-PI Fungal Predictor、SMART、TMHMM等生物信息学分析工具对上述序列开展蛋白质亚细胞定位、细胞信号肽、二级结构、锚定位点、保守结构域、跨膜结构域等进行分析,同时对上述序列开展与炭疽菌属不同真菌遗传进化关系分析。研究结果为进一步深入开展该蛋白在致病过程中所具有的功能研究打下坚实的理论基础。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
•     1.2.1 蛋白质转运肽及信号肽预测
•     1.2.2 亚细胞定位及锚定位点分析
•     1.2.3 蛋白质疏水性预测及理化性质分析
•     1.2.4 蛋白质保守结构域及跨膜结构域预测
•     1.2.5 二级结构预测
•     1.2.6 系统进化树构建
• 2 结果与分析
•   2.1 序列分析
•   2.2 转运肽、信号肽以及亚细胞定位、锚定位点预测
•   2.3 疏水性及理化性质分析预测
•   2.4 保守结构域及跨膜结构域分析
•   2.5 二级结构预测及组成情况分析
•   2.6 遗传关系分析
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 祝友朋,陈摇,韩长志

关键词: 农林植物,胶孢炭疽菌,黑色素,漆酶,生物信息学,遗传进化

来源: 江苏农业科学 2019年06期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农业基础科学,植物保护

单位: 西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

基金: 国家自然科学基金(编号:31560211),国家级大学生创新创业训练计划(编号:201610677001),云南省高等学校大学生创新创业训练计划,云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金(编号:ZK150004),云南省高校优势特色重点学科(生物学)建设项目(编号:50097505)

分类号: S432.44

DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.06.011

页码: 48-51

总页数: 4

文件大小: 124K

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