论文摘要
本研究旨在探究草原红牛酰基辅酶A硫酯酶2（Acot2）的基因功能,并对其进行生物信息学分析,检测Acot2基因在草原红牛不同组织中的表达差异。根据GenBank中公布的牛Acot2基因序列（登录号:NM001101938.1）设计引物,PCR扩增获得草原红牛Acot2基因的完整CDS并进行测序,利用分析软件进行序列同源性比对并构建系统进化树;获得对应的氨基酸序列并分析蛋白理化特性及蛋白亚细胞结构、亲疏水性和磷酸化位点,预测蛋白二级结构并构建蛋白质三级结构模型;利用实时荧光定量PCR方法检测Acot2基因在不同组织中的表达差异。结果显示,草原红牛Acot2基因CDS大小为1 395 bp,编码464个氨基酸,其核苷酸序列与亚洲水牛的同源性较高（98.3%）,与猕猴和黑猩猩的同源性较低（80.5%和80.4%）。Acot2蛋白分子式为C2317H3606N640O628S14,分子质量为50.924 ku,理论等电点为8.84。蛋白质不稳定指数为37.50,氨基酸残基多数为亲水性残基,总平均亲水性为-0.094。亚细胞定位分析表明,Acot2蛋白分布在内质网（30.4%）、线粒体（26.1%）、高尔基体（17.4%）、细胞质（17.4%）、液泡（4.3%）和细胞质（4.3%）中;磷酸化位点分析发现,Acot2蛋白存在20个磷酸化位点。二级结构主要形式有α-螺旋（21.8%）、β-转角（33.4%）、β-折叠（18.4%）和无规则卷曲（26.4%）,三级结构预测结果与其相一致。实时荧光定量结果显示,Acot2基因在草原红牛胃中表达量最高,在肺脏中表达量极少。Acot2基因在生物进化过程中具有低保守性,其编码氨基酸组成的蛋白质结构稳定,属于水溶性蛋白,在线粒体和内质网中发挥作用,在草原红牛不同组织的表达量有明显差异。本研究结果为进一步探究Acot2基因对家畜脂代谢的影响和筛选草原红牛肉质候选基因提供资料。
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 刘理想,高一,吕阳,薛佳佳,胡忠昌,张国梁
关键词: 草原红牛,基因,克隆,生物信息学分析,表达差异
来源: 中国畜牧兽医 2019年11期
年度: 2019
分类: 农业科技,基础科学
专业: 生物学,畜牧与动物医学
单位: 吉林农业大学动物科学技术学院,吉林省农业科学院畜牧分院
基金: 国家重点研发计划(2018YFD0501802),国家肉牛牦牛产业技术体系(CARA-37),吉林省农业科学院创新工程项目(C92072001)
分类号: S823;Q78
DOI: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2019.11.003
页码: 3154-3162
总页数: 9
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- [1].哺乳动物Acot2基因的研究进展[J]. 中国畜牧杂志 2019(10)