导读:本文包含了基因标记论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,标记,分子,根肿病,荧光,叶斑病,家蚕。
基因标记论文文献综述
刘燕玲,吴美玲,胡莹,王旭景,陈卓[1]（2019）在《基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨龙葵抗肺腺癌功能基因模块及生物标记识别研究》一文中研究指出目的采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)法探讨龙葵抗肺腺癌的潜在生物靶标。方法基于中药系统药理学技术平台(TCMSP)及文献检索,以口服利用度(OB)、类药性(DL)构建龙葵活性成分数据库,采用DRAR-CPI服务器反向模拟分子-靶蛋白对接龙葵预测成分可能的作用靶标,并结合WGCNA挖掘在美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GEO数据库中的GSE10072数据集得到共表达基因模块,并与龙葵预测靶标匹配映射,得到龙葵潜在抗肺腺癌靶点。将预测靶标与抗肺腺癌基因分别利用生物学信息注释数据库(Metascape)进行GO生物学过程富集分析和KEGG通路富集分析,并用STRING数据库结合Cytoscape软件可视化龙葵潜在抗肺腺癌靶点蛋白相互作用网络并进行网络拓扑学分析,同时构建龙葵活性成分-抗癌靶点-通路网络,探讨龙葵抗癌作用的机制。并通过UALCAN及KaplanMeierplotter数据库分析关键基因在肺腺癌组织中转录水平的变化,通过KM plotter分析关键基因与肺腺癌患者预后的关系。结果共收集龙葵活性成分9个,包括皮树脂醇、谷甾醇、薯蓣皂苷元、辣茄碱、槲皮素、α-茄碱、澳洲茄碱、澳洲茄边碱、澳洲茄胺,预测成分作用靶标271个,筛选龙葵潜在抗癌靶点41个,其潜在调控通路包括癌症通路、PI3K-Akt信号通路、化学物致癌作用、癌症的中心碳代谢等通路。由蛋白互作网络分析可得关键基因为EGFR、CASP8、HPGDS、FYN,且证实高表达的EGFR和CASP8、低表达的HPGDS及FYN与肺腺癌患者不良预后紧密相关。结论龙葵抗肺腺癌具有多成分、多靶点、多途径作用的特点,为其抗癌物质基础及作用机制的阐明提供了科学依据。(本文来源于《中草药》期刊2019年24期）
刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健[2]（2019）在《家蚕抗核型多角体病毒(BmNPV)相关基因的表达分析及其实用性分子标记的筛选》一文中研究指出家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus, BmNPV)是一种对家蚕具有高致病性的病毒,会导致蚕业生产上的严重经济损失。迄今已在家蚕中发现了几种对BmNPV有抑制作用的蛋白,但各基因的表达水平与家蚕不同遗传类型材料BmNPV抗性的相关程度仍不清晰。本研究以高抗材料(highly resistant parent, R)和高感材料(highly susceptible parent, S)组配成F1、F2及回交等不同遗传类型材料,利用添毒实验与荧光定量PCR技术,检测家蚕不同遗传类型材料在不同感染条件下对BmNPV的抵抗能力及其相应的5个抗性相关基因(家蚕脂肪酶Ⅰ基因(Bmlipase-1),家蚕丝氨酸蛋白酶Ⅱ基因(serine proteaseⅡ, BmSP-2),家蚕核糖体蛋白S3A基因(ribosomal protein S3A, BmS3A),家蚕抑制蛋白酶Ⅱ基因(suppressor of profilin 2, BmSop2),家蚕烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化还原酶基因(nicotinamide adenine dinucleotide phosphate oxidoreductase, BmNOX)的相对表达量,分析其与抗性的关联性。结果表明:Bmlipase-1和BmSP-2在家蚕中肠特异表达,其他基因没有组织表达特异性;Bmlipase-1、BmSP-2、BmNOX和BmSop2四个基因在不同遗传类型材料中肠的相对表达量之间均存在明显差异,且抗性越强的遗传类型材料的相对表达量也越高,各基因的相对表达量与材料抗性呈正相关性。而BmS3A基因的表达差异在各遗传类型材料间没有呈现出一定的相关性;Bmlipase-1在不同遗传类型材料的相对表达量与其抗性水平的一致性最高,该基因的相对表达水平可以在家蚕育种过程中作为抗核型多角体病毒材料选择与鉴定的依据之一。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年12期）
高存,宋建军,杜朝[3]（2019）在《番茄灰叶斑病抗病基因Sm分子标记的建立》一文中研究指出以抗病纯合体(Sm/Sm)、抗病杂合体(Sm/sm)和感病纯合体(sm/sm)番茄为试验材料,以提取的基因组DNA为模板,根据与抗病基因Sm紧密连锁的RFLP标记设计特异引物进行PCR扩增,对扩增产物进行序列分析寻找酶切位点,采用限制性内切酶酶切的方法,创建新的与番茄灰叶斑病抗病基因Sm紧密连锁的CAPS标记,以期为今后番茄抗病育种工作提供技术支撑。结果表明:创建的T050标记稳定、可靠,是一个共显性分子标记,可用于番茄抗病育种的辅助选择中。(本文来源于《北方园艺》期刊2019年22期）
李江丽,李成凤,王超,张晓烜,姜凯旋[4]（2019）在《结球甘蓝抗黑腐病基因SSR标记转CAPS标记》一文中研究指出以结球甘蓝抗病亲本材料A21与感病亲本材料D12杂交的杂种F_1自交得F_3为试验材料,采用分子标记的方法,研究课题组所设计的结球甘蓝抗黑腐病基因QTL连锁距离为5.1 cmol·L~(-1)的OL9A03引物,经3次重复,SSR标记结果在785株中532株出现目的条带,253株未扩增出目的条带,再根据该标记测序,得到1条93 bp的序列,运用该序列设计共3对CAPS引物,其中2对CAPS引物均出现了目的条带,多态性消失。结果表明:SSR标记成功转化为序列特意扩展区域(CAPS)标记C001,用400株F_3代群体进行黑腐病侵染验证,侵染植株中283株表现为抗性,117株表现为感病性,原SSR标记和新CAPS标记结果一致,可达到分子标记辅助育种的目的。(本文来源于《北方园艺》期刊2019年21期）
吴果果,宋淑婷,岳荣,张晶,关莹[5]（2019）在《反向筛选标记基因upp在杀真菌链霉菌遗传改造中的应用》一文中研究指出为进一步简化放线菌的遗传操作流程,缩短重组菌株的筛选周期,在对杀真菌链霉菌(Streptomyces fungicidicus ATCC 21013)进行遗传操作的过程中引入了一个反向筛选标记基因——尿嘧啶磷酸核糖转移酶基因(upp)。并通过原始菌株中upp基因的敲除,以及带有upp基因的自杀型基因敲除载体的构建,开发了一套完整的针对杀真菌链霉菌的无痕敲除系统。通过载体的整合、二次交换及反向筛选实现了杀真菌链霉菌基因组中StrR基因的快速无痕敲除。upp反向筛选标记基因的引入使得链霉菌重组菌株的平均筛选周期缩短了2周左右,并进一步减少了假阳性重组菌株出现的概率,可实现放线菌中目的基因的连续无痕敲除,因此值得进一步推广和应用。(本文来源于《中国生物工程杂志》期刊2019年11期）
倪深,夏春,应建成,孙红伟,陈红旗[6]（2019）在《利用分子标记技术聚合2个白叶枯病基因改良华占的白叶枯病抗性》一文中研究指出以镇084和IRBB5为白叶枯病抗性基因的供体亲本,华占为受体亲本,通过杂交、二次回交,再进行一次复交,在分离世代利用分子标记辅助选择技术、白叶枯病菌接种鉴定和农艺性状筛选等措施,育成携带xa5、Xa7和xa5+Xa7基因的改良株系各1个,并对改良株系进行了抗白叶枯病鉴定。结果表明,分别携带xa5、Xa7基因的改良株系B1和B2对菌株PXO99均表现为高感,对其他4个菌株都表现为高抗或抗;携带xa5+Xa7基因的株系B3对PXO99表现为中感,对其他4个菌株都表现为高抗,抗性水平明显好于仅携带单基因的B1和B2。(本文来源于《中国稻米》期刊2019年06期）
刘东让,侯喜林,肖栋[7]（2019）在《白菜类作物开花时间相关基因CCA1的克隆及功能标记开发》一文中研究指出以1年生的油用型品种Yellow sarson(YS-143)与2年生的芜菁品种Vegetable turnip(VT-044)的cDNA为模板,克隆出CCA1基因cDNA全长序列,分析其核苷酸多态性。在这2份材料构建的200株F_2分离群体中,选取极早和极晚开花的单株各24株,对在亲本上鉴定到的4个多态性位点进行PCR扩增,采用Pearson相关性分析研究基因型与开花时间表现型的关系。构建pEZS-NL-CCA1载体,利用亚细胞定位技术,分析CCA1基因在真核细胞中的表达情况。序列分析表明,YS-143与VT-044分别有1 665、1 647个核苷酸,分别编码了554、548个氨基酸。亲本之间核苷酸序列分析鉴定到12个差异位点,氨基酸同源进化树分析表明,十字花科的不结球白菜、大白菜、萝卜、油菜、拟南芥、亚麻芥聚集在同一分支中,而禾本科的大麦、玉米、水稻聚集在另一分支中。在F_2分离群体上,Pearson相关性鉴定到位于亲本第727至第732个碱基处的1个多态性位点(ACCCTT/ACCCTT),有该位点的群体单株平均开花时间为39 d,极显着早于缺失该位点的群体单株平均开花时间104 d(P<0.01),表明白菜类作物CCA1基因的第727至第732个碱基的缺失(A05:472204-472209)与开花时间呈极显着相关,影响开花时间,可为光周期敏感的白菜类作物晚抽薹育种研究提供一定的理论依据。开发的该Insert/Delete(InDel)标记,可以作为功能分子标记进行辅助育种工作,以加快育种进程。亚细胞定位结果表明,CCA1基因主要在细胞核上表达。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年20期）
刘畅,李楚楚,李智洋[8]（2019）在《基于荧光素酶报告基因的细菌外膜囊泡标记方法的建立》一文中研究指出目的建立一种基于荧光素酶报告基因的细菌外膜囊泡标记方法。方法利用细菌外膜囊泡表面携带高丰度细菌外膜蛋白A(OmpA)的特点,构建OmpA-NanoLuc荧光素酶融合蛋白,根据荧光素酶活性评估样品中的细菌外膜囊泡数量。结果成功构建OmpA-NanoLuc融合蛋白表达载体,受试菌株在表达该融合蛋白后所分泌的外膜囊泡具有稳定的荧光素酶活性。可通过检测荧光素酶活性的方式对细菌外膜囊泡进行半定量检测。结论建立了一种基于荧光素酶标记的细菌外膜囊泡半定量检测方法,可用于评估特定菌株的细胞外膜囊泡分泌水平。(本文来源于《临床检验杂志》期刊2019年10期）
甘彩霞,崔磊,于校青,邓晓辉,戴照义[9]（2019）在《萝卜抗根肿病基因定位及分子标记开发》一文中研究指出根肿病(Clubrootdisease)是十字花科作物的主要病害之一。人们对芸薹种种质资源的CR基因进行了挖掘,并开展了抗根肿病连锁分子标记辅助育种研究。目前萝卜抗根肿病的研究以及开发的分子标记很少,对根肿病的抗性遗传规律还不明确。利用F2代作图群体,并通过对F2:3家系的抗病性鉴定初步定位了5个与萝卜抗根肿病相关的QTL,即RsCr1、RsCr2、RsCr3、RsCr4和RsCr5。根据萝卜参考基因组信息和定位结果,挖掘区间内的候选基因,利用CLC Main Workbench 7.7.1分析比对候选基因的重测序结果;利用NCBI中的OpenReadingFrameFinder工具预测候选基因的CDS序列和氨基酸序列,再利用NCBI中的CD-search预测结构类型,结合基因结构特征在定位的区间内筛选出最终的抗病基因。在定位区间内挖掘出来的抗病基因所在物理位置上下游各200 bp的区间内开发标记,并筛选在双亲间具有多态性的标记,利用多态性标记鉴定F2作图群体的基因型,结合F2:3家系的表型鉴定结果,确定与抗根肿病性状连锁的分子标记。在5个定位区间内,通过与参考基因组比对分析以及进行基因KEGG和KOG_class注释分析,共挖掘到38个与抗病性相关的基因。含有LRR结构类型的抗病基因共有15个,其中有1个基因为NBS-LRR类型,其它基因功能注释为抗病(disease resistance)。根据抗病基因所在区间的标记序列共获得20对SSR标记。用20对SSR标记筛选抗病亲本、感病亲本和F1,筛选出具有多态性的标记共5对。利用5对SSR标记筛选F2作图群体130个单株的DNA样本,结合表型鉴定结果,获得一个可用于分子标记辅助育种的SSR标记,该标记为fold92946_4806。(本文来源于《中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集》期刊2019-10-21）
孙保娟,李植良,李涛,黎振兴,衡周[10]（2019）在《茄子果色上位P基因紧密连锁的InDel分子标记及其应用》一文中研究指出茄子的果色遗传是由多基因控制的。在育种实践中发现2对上位基因控制茄子果色遗传现象,即2个纯合的白果色茄子杂交后,F1代果色为紫红色,F2代紫红果色和白果色植株分离比为9︰7,说明其果皮着色受到具有上位性的2个基因位点控制,2个白果色茄子是由于控制花青素生物合成的2个独立而又互补的基因位点分别失活引起的。前人报道茄子果色主要受到3个上位性基因位点(命名为D、P和Y)控制,但尚未开展相关分子标记及定位研究。因此,开展茄子果色上位性基因的分子标记和定位研究,可以为茄子果色分子标记辅助选择育种及基因克隆奠定基础。在前期采用SLAF-Seq与BSA关联分析技术结合将控制茄子果色上位性遗传的2个基因(D和P)分别定位到相应的两个较小的区域的基础上,基于父、母本基因组重测序结果,在关联区域所在的Scaffold附近寻找InDel标记,在关联Scaffold序列的第5 513位点找到了1个插入/缺失(InDel),其具有长度为50bp和35bp两处特异插入/缺失(InDel)片段,其在父本中比母本中多了85个碱基。根据InDel 5513两端序列设计了1对特异性引物,可在母本中扩增出长度为207 bp的片段(基因型pp),可在父本中扩增出长度为292 bp的片段(基因型PP)。在F1同时有292 bp和207 bp两个片段扩增,基因型为Pp。对F2代白果色单株的扩增带型分两种情况考虑:一种情况是绿茎白果色单株,其可能基因型有DDpp、Ddpp、ddpp,因此P基因分子标记InDel 5513扩增结果仅有1种情况,207 bp(基因型pp);另一种情况是紫红茎白果色单株,其可能基因型有ddPP、ddPp,因此P基因分子标记InDel5513扩增结果为292 bp(基因型PP)单条带、292 bp和207 bp(基因型Pp)杂合带。F2代紫红果色单株可能基因型有DDPP、DDPp、DdPP和DdPp,因此P基因分子标记InDel 5513扩增结果有2种情况,既仅有292 bp(基因型PP)、292 bp和207 bp杂合(基因型Pp)。该InDel标记在父本和母本中相差85个碱基,PCR产物可以在琼脂糖凝胶完成快速检测。通过对1 200株F2分离世代单株检验分析,计算出InDel 5513标记距离目标基因P的遗传距离为0.5 cM。本研究中获得的InDel 5513分子标记及分子标记扩增引物可以简便、快速、高通量地应用于茄子果色上位性基因P的辅助选择育种,同时为克隆该基因及其功能研究奠定了良好的基础。(本文来源于《中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集》期刊2019-10-21）
基因标记论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus, BmNPV)是一种对家蚕具有高致病性的病毒,会导致蚕业生产上的严重经济损失。迄今已在家蚕中发现了几种对BmNPV有抑制作用的蛋白,但各基因的表达水平与家蚕不同遗传类型材料BmNPV抗性的相关程度仍不清晰。本研究以高抗材料(highly resistant parent, R)和高感材料(highly susceptible parent, S)组配成F1、F2及回交等不同遗传类型材料,利用添毒实验与荧光定量PCR技术,检测家蚕不同遗传类型材料在不同感染条件下对BmNPV的抵抗能力及其相应的5个抗性相关基因(家蚕脂肪酶Ⅰ基因(Bmlipase-1),家蚕丝氨酸蛋白酶Ⅱ基因(serine proteaseⅡ, BmSP-2),家蚕核糖体蛋白S3A基因(ribosomal protein S3A, BmS3A),家蚕抑制蛋白酶Ⅱ基因(suppressor of profilin 2, BmSop2),家蚕烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化还原酶基因(nicotinamide adenine dinucleotide phosphate oxidoreductase, BmNOX)的相对表达量,分析其与抗性的关联性。结果表明:Bmlipase-1和BmSP-2在家蚕中肠特异表达,其他基因没有组织表达特异性;Bmlipase-1、BmSP-2、BmNOX和BmSop2四个基因在不同遗传类型材料中肠的相对表达量之间均存在明显差异,且抗性越强的遗传类型材料的相对表达量也越高,各基因的相对表达量与材料抗性呈正相关性。而BmS3A基因的表达差异在各遗传类型材料间没有呈现出一定的相关性;Bmlipase-1在不同遗传类型材料的相对表达量与其抗性水平的一致性最高,该基因的相对表达水平可以在家蚕育种过程中作为抗核型多角体病毒材料选择与鉴定的依据之一。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因标记论文参考文献
[1].刘燕玲,吴美玲,胡莹,王旭景,陈卓.基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨龙葵抗肺腺癌功能基因模块及生物标记识别研究[J].中草药.2019
[2].刘勇,艾均文,唐芸,薛宏,何行健.家蚕抗核型多角体病毒(BmNPV)相关基因的表达分析及其实用性分子标记的筛选[J].农业生物技术学报.2019
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[9].甘彩霞,崔磊,于校青,邓晓辉,戴照义.萝卜抗根肿病基因定位及分子标记开发[C].中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集.2019
[10].孙保娟,李植良,李涛,黎振兴,衡周.茄子果色上位P基因紧密连锁的InDel分子标记及其应用[C].中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集.2019
论文知识图
