离子相互作用模型论文_郭冰冰,乔国富,欧进萍,刘军龙

导读:本文包含了离子相互作用模型论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:离子,相互作用,氢键,电荷,模型,光谱,杏仁。

离子相互作用模型论文文献综述

郭冰冰,乔国富,欧进萍,刘军龙[1](2018)在《耦合离子与水化产物间相互作用的水泥基材料氯离子传输模型》一文中研究指出钢筋混凝土结构为土木工程领域应用最广泛的结构形式,而氯离子诱发的钢筋锈蚀为降低混凝土结构耐久性的主要原因之一。在以往的研究中,基于Nernst-Planck方程的数值模型通常被用来模拟混凝土中离子的传输,进一步预测混凝土结构的服役寿命,然而这些数值模型并未考虑传输过程中离子与水化产物之间的热力学作用。因此,本文基于离子传输的物理化学作用的本质过程,建立了饱水状态下水泥基材料中多离子传输的数值模型。首先,采用表面络合模型和相平衡模型,建立了孔溶液中离子与水化产物间的热力学数值模型;然后,借助于算子分裂算法,求解了耦合热力学作用的Nernst-Planck方程多离子传输的有限元模型,得到了水化产物中各相成分、孔隙率及孔溶液中各自由离子浓度的演化规律。最后,通过已有文献的试验研究验证了本文建立的数值模型的准确性。(本文来源于《复合材料学报》期刊2018年12期)

熊贵[2](2017)在《离子—聚电解质相互作用:从泊松—玻尔兹曼理论到紧束缚离子模型》一文中研究指出RNA是带有很强负电性的分子,溶液中的金属离子,尤其是高价离子,对RNA结构、动力学性质有着非常重要的作用。其中,非线性泊松-玻尔兹曼理论是处理离子与RNA分子与溶液离子相互作用的经典理论之一。由于平均场的近似,非线性泊松-玻尔兹曼理论很难定量预测高价离子与RNA分子的相互作用。本文主要采用非线性泊松-玻尔兹曼理论、蒙特卡罗模拟和TBI模型深入研究离子与带电胶体球和RNA的相互作用。主要研究内容如下:1.利用蒙特卡罗模拟和非线性泊松-玻尔兹曼理论两种方法,对半径10A,15A,20A,25A,30A表面带不同电荷的胶体球在广泛盐离子条件下,统计得到了盐离子的径向分布。通过广泛的对比蒙特卡洛模拟和非线性泊松-玻尔兹曼理论的结果,表明当带电胶体球被溶液中的离子中和到某一“临界”值,非线性泊松-玻尔兹曼理论可以定量的描述高价盐离子的径向分布。通过大量对比蒙特卡罗模拟和非线性泊松-玻尔兹曼理论的结果,我们总结出了一个经验公式来描述不同条件下的“临界”值。有趣的是,通过胶体球系统总结出的经验公式对真实的核酸分子也是适用的。2.拓展并利用紧束缚离子模型和蒙特卡罗模拟方法,对带电胶体球处在盐离子溶液环境下的盐离子的径向分布和同种电荷胶体球间的平均力势进行的计算和对比,发现两种方法吻合很好。进一步利用拓展的紧束缚离子模型,研究了带有高电荷密度的同种电荷胶体球处在盐离子浓度下之间平均力势的性质。(本文来源于《武汉大学》期刊2017-10-29)

李蕾[3](2017)在《快速计算离子型非键复合物相互作用的经验模型》一文中研究指出非键作用是自然界中普遍存在的分子间相互作用,在化学、材料科学以及生命科学等领域发挥着举足轻重的作用,准确计算这些非键作用的结构和强度具有十分重要的科学意义。本课题组提出了一种可极化偶极-偶极作用模型,并将之成功地应用于计算中性非键作用。本论文将此模型进一步发展,将其推广到离子型非键复合物中,用以计算这些复合物的分子间平衡距离和相互作用能。本文的主要研究内容包括:1.基于对离子型非键作用本质的理解,本文在可极化偶极-偶极作用模型的基础上,加入电荷-偶极相互作用项,使之发展成为可以计算离子型非键作用的经验模型。本文选取了 18个复合物作为模型分子,确定了相关的参数。2.将本文模型应用于包含卤素离子的阴离子-π复合物的分子间平衡距离和相互作用能的计算中,并与从头算方法的计算结果进行比较。计算结果表明,本文模型计算得到的分子间平衡距离和相互作用能与高精度从头算方法的结果符合很好。3.将本文模型应用于包含带电精氨酸侧链的离子氢键复合物的平衡氢键距离和相互作用能的计算中,并与从头算方法的计算结果进行比较。计算结果表明,本文模型计算的平衡氢键距离与MP2/6-31+G(d,p)方法的计算结果符合很好。本文模型计算的相互作用能与MP2.5/CBS方法计算结果有较好相关性,其线性相关系数为0.9687,均方根偏差为2.57 kcal/mol;而与MP2.5/CBS方法的计算结果相比,AMBER99力场和AMOEBA力场计算相互作用能的线性相关系数分别为0.9370和0.4444,均方根偏差分别为6.84和6.30 kcal/mol。4.将本文模型应用于包含带电组氨酸侧链的离子氢键复合物的平衡氢键距离和相互作用能的计算中,并与从头算方法的计算结果进行比较。计算结果表明,本文模型计算的平衡氢键距离与MP2/6-31+G(d,p)方法的计算结果符合很好。本文模型计算的相互作用能与MP2.5/CBS方法计算结果有较好相关性,线性相关系数为0.9562,均方根偏差为2.12 kcal/mol;而与MP2.5/CBS方法的计算结果相比,AMBER99力场和AMOEBA力场计算相互作用能的线性相关系数分别为0.8083和0.6963,均方根偏差分别为11.22和6.84 kcal/mol。5.将本文模型应用于包含带电赖氨酸侧链的离子氢键复合物的平衡氢键距离和相互作用能的计算中,并与从头算方法的计算结果进行比较。计算结果表明,本文模型计算的平衡氢键距离与MP2/6-31+G(d,p)方法的计算结果符合较好。本文模型计算的相互作用能与MP2.5/CBS方法计算结果有较好相关性,线性相关系数为0.9549,均方根偏差为3.60 kcal/mol;而而与MP2.5/CBS方法的计算结果相比,AMBER99力场和AMOEBA力场计算相互作用能的线性相关系数分别为0.9033和0.7630,均方根偏差分别为15.86和5.18 kcal/mol。6运算效率的比较表明,本文模型比MP2.5/CBS方法快叁个数量级以上;且随着体系的增大,本文模型的运算优势更为明显。表明本文模型比MP2.5/CBS方法更为快捷高效。本文研究结果表明:本文模型简洁快速,可以较准确地预测离子氢键和阴离子—π复合物的相互作用。本文模型可望在生物大分子体系的分子模拟领域得到应用。(本文来源于《辽宁师范大学》期刊2017-06-01)

李蕾,王长生[4](2014)在《一种可用于快速计算离子氢键型复合物相互作用能的模型》一文中研究指出离子型氢键在氨基酸、多肽、核酸以及蛋白质中扮演着重要的角色,所以快速准确地计算离子型氢键复合物的作用能十分重要。我们提出了一种可以快速预测离子型氢键复合物的氢键键长和氢键强度的模型。此模型包含电荷-固有偶极作用、固有偶极-固有偶极作用、极化作用、范德华作用和共价作用。在离子型氢键复合物中,我们把分子中的原子电荷和化学键分别看作点电荷和键偶极,键偶极矩的大小会随环境变化而发生改变。我们将此模型应用到一系列的由带电氨基酸侧链与酰胺、碱基形成的离子型N-H…O=C氢键复合物中,计算了氢键复合物的氢键键长和相互作用能,并与从头算方法得到的结果进行了比较。结果表明:使用我们模型得到的氢键键长与MP2/6-31+G(d,p)方法得到的结果符合的很好;氢键相互作用能与包含基组重迭误差校正的MP2/aug-cc-pVTZ方法的计算结果符合的很好。(本文来源于《中国化学会第29届学术年会摘要集——第15分会:理论化学方法和应用》期刊2014-08-04)

叶树集[5](2012)在《离子通道蛋白质模型物质丙甲甘肽与细胞仿生膜相互作用机理的实时原位表征》一文中研究指出离子通道蛋白质在细胞膜上的结构与人类疾病以及大众健康息息相关。电压门控离子通道蛋白质通过膜电位的作用来控制通道的开放与关闭过程,从而实现细胞膜内外的离子平衡,同时保持对某种离子具有高度选择性。现在虽然已经有很多与离子通道蛋白质相关的研究,但对其如何在膜中形成离子通道的分子(本文来源于《中国化学会第28届学术年会第3分会场摘要集》期刊2012-04-13)

于艳丽,赵孔双,白伟,程玲[6](2008)在《金属离子及CTAB对酵母细胞介电行为的影响——相互作用的模型化解析》一文中研究指出利用介电谱方法详细研究了Cu2+、Zn2+、Cd2+、Pb2+、Al3+、Ni2+等金属离子以及阳离子表面活性剂CTAB(十六烷基叁甲基溴化铵)对典型的真核细胞——酵母细胞介电性质的影响。在时间变化和浓度变化的情况下,对上述体系在40Hz~110MHz宽频范围进行了介电测量,Cole-Cole拟合确定了介电参数,定性讨论了不同试剂的时间和浓度的各种作用效果。通过无作用的对照细胞和有离子作用的作用组细胞10小时内的介电谱图比较发现,Cu2+、Pb2+及CTAB对酵母细胞介电行为的影响是以孵化时间依赖的方式发生;对有时间作用的叁者选用不同的浓度进行作用,结果发现Cu2+及CTAB对酵母细胞的作用同样是以浓度依赖的方式进行,而不同浓度的Pb2+的作用效果接近。进一步,根据酵母细胞的结构特点采用双壳介电模型,理论计算了相参数,并结合细胞生理学知识对细胞受金属离子或特殊试剂作用后的相参数变化原因给予了解释;给出了金属离子,特别是Cu2+以及CTAB与酵母细胞作用的可能机制。此外,模拟了实验条件下细胞悬浮液中各组成相参数对介电谱的依存关系,给出了一些有益的暗示:介电增量主要受细胞膜介电常数和细胞体积分数影响;特征频率f0与液泡膜介电常数以及细胞质的电导率等物理参数有关;而液泡内电导率支配高频的弛豫行为。这些模拟将对酵母细胞介电实时监测技术的实现提供基础参考。(本文来源于《生物物理学报》期刊2008年05期)

常好会,苏涛,孙卫文,赵绮华,秦兵[7](2006)在《钾离子通道Kv4.2、Kv4.3及其相互作用蛋白KChIP1在电点燃癫模型中的表达变化》一文中研究指出目的探讨钾离子通道Kv4.2、KV4.3及其相互作用蛋白KChIP1在杏仁核电点燃模型中的表达变化及可能的作用。方法刺激SD大鼠右侧杏仁核7d以建立电点燃模型,提取杏仁核总RNA进行RT-PCR,研究致后KChIP1、Kv4.2和Kv4.3在mRNA水平表达变化;同时提取杏仁核全细胞蛋白进行Western印迹,观察KChIP1和Kv4.2在蛋白水平表达变化。结果在mRNA表达水平,双侧杏仁核KChIP1在模型组[包括Racine分级的高发作级别组(47.0±3.6)和低发作级别组(41.3±10.2)]明显高于假手术组(20.0±10.6)(P高=0.000,P低=0.001),Kv4.2和Kv4.3在模型组亦升高,在高发作级别组有升高更明显倾向。双侧KChIP1和Kv4.2的蛋白表达水平变化与mRNA表达变化相似。各组点燃刺激侧与非刺激侧相比mRNA及蛋白表达差异均无统计学意义。结论Kv4.2、Kv4.3及KChIP1在电点燃癫模型双侧杏仁核都有不同程度的升高(KChIP1升高更明显,Kv4.2和Kv4.3的变化在发作级别高时升高较明显),这提示钾通道的改变不是癫灶点燃的原因,而可能是机体对发作的保护性反应。(本文来源于《中华医学杂志》期刊2006年47期)

常好会,廖卫平,苏涛,孙卫文,赵绮华[8](2006)在《钾离子通道Kv4.2、Kv4.3及其相互作用蛋白KChIP1在电点燃癫痫模型中的表达变化》一文中研究指出目的:癫痫是一种常见的神经系统慢性疾病,现已证明大多数遗传性特发性癫痫与离子通道基因突变有关。电压门控型钾通道(Kv)在调节神经元的兴奋性方面起着很重要的作用,大脑中A型钾电流主要由Kv4通道介导,它能通过阻止动作电位在树突处的产生并限制动作电位的反向传播,延长神经冲动发放的间隔时间等来降低神经元的兴奋性。Kv 包括多种亚单位,其中Kv4.2和Kv4.3亚单位在脑内分布最广,很多Kv还有一些辅助单位,钾通道相互作用蛋白1(Kv channel-interacting protein 1,KChIP1)就是最重要的一种。本课题研究钾离子通道Kv4.2、KV4.3及相互作用蛋白KChIP1 在杏仁核电点燃模型中的表达变化及可能的作用。方法:选用成年健康雌性清洁级Sprague-Dawley(SD)大鼠,利用立体定位技术将双极电极插入杏仁核,再用牙科水泥固定。实验结束后,需对电极的尖端进行组织学证实。大鼠术后一周后接受电刺激,每天刺激一次,连续七天。根据发作情况分为3个组,分别是:对照组、低发作级别组(电刺激后发作达到Racine分级 1-3级)、高发作级别组(电刺激后发作达到Racine分级4-5级),并分别进行病灶侧与非病灶侧对照研究。后处死大鼠后, 提取杏仁核RNA进行RT-PCR,研究致痫后KChIP1、Kv4.2和Kv4.3在mRNA水平表达变化;同时提取杏仁核蛋白进行 Western blot,研究致痫后KChIP1和Kv4.2在蛋白水平表达变化。结果:在mRNA水平,双侧KChIP1在高发作级别组和低发作级别组中较对照组均显着升高(P<0.01),Kv4.2和Kv4.3在高发作级别组较对照组显着升高(P<0.01),而低发作级别组升高(P<0.05),各组病灶侧与非病灶侧相比无明显差别(P>0.05)。高发作级别组与低发作级别组之间相比无明显差别(P> 0.05)。蛋白表达水平的变化与mRNA水平相似,即双侧KChIP1在高发作级别组和低发作级别组中较对照组均显着升高 (P<0.01),Kv4.2和Kv4.3在高发作级别组较对照组显着升高(P<0.01),而低发作级别组升高(P(0.05)。各组病灶侧与非病灶侧相比无明显差别(P>0.05)。结论:大鼠脑内KChIP1、Kv4.2和Kv4.3的表达不受植入电极后手术损伤及电极本身的影响。叁者在杏仁核电点燃癫痫模型中都有不同程度的升高,KChIP1对刺激的反应更明显,Kv4.2和Kv4.3升高是受 KChIP1的调节所致,Kv4.2和Kv4.3的变化与痫性发作级别有关,发作级别高时其升高更明显。Kv4.2和Kv4.3表达水平增高后能增强A-型钾电流,对神经元兴奋性起到抑制作用,从而限制异常放电扩散,起到抗痫性发放作用。(本文来源于《第九次全国神经病学学术大会论文汇编》期刊2006-09-01)

张爱芸,姚燕[9](2006)在《298.15K Li_2B_4O_7-MgCl_2-H_2O体系热力学性质的电动势法测定及离子相互作用模型的研究》一文中研究指出测定了298.15K下,无液接电池Li-ISE│Li2B4O7(mA)(aq.),MgCl2(mB)(aq.)│AgCl/Ag的电动势,利用测定结果计算了Li2B4O7-MgCl2-H2O体系离子强度在0.05~3mol?kg-1范围内,不同MgCl2离子强度分数的溶液中LiCl的平均活度系数,并给出了其随离子强度I,B4O72-和Mg2+浓度的变化规律.结合以往关于该体系和Li2B4O7-LiCl-H2O,Li2B4O7-H2O体系的等压研究结果,用迭代和多元线性回归方法对Li+-Mg2+-Cl--B4O72--H2O体系的离子相互作用模型进行了研究.具体方法为考虑了该体系在不同的总硼浓度范围H3BO3,B(OH)-4,B3O3(OH)-4和B4O5(OH)42-四种含硼化合物的存在以及各硼化合物间的化学平衡,以修正了的Pitzer渗透系数方程和活度系数方程为基础,对该体系的等压法和电动势法研究结果进行最小二乘拟合,拟合的标准偏差为0.0167,用该模型计算的该体系的渗透系数、活度系数与实验值基本一致.(本文来源于《化学学报》期刊2006年06期)

张爱云,姚燕,宋彭生[10](2004)在《298.15K下Li_2B_4O_7-H_2O体系水蒸汽分压及渗透系数的等压测定和离子相互作用模型》一文中研究指出Isopiestic molalities, vapor pressures and osmotic coefficients of aqueous Li 2B 4O 7 solutions from 0.027 5 to 2.939 7 mol/kg were determined at 298.15 K by using an improved apparatus. The rule of the changes in vapor pressure over aqueous Li 2B 4O 7 solutions was revealed, which indicated that the bond of borate anions with water are better than that of NaCl. The different formation reaction equilibria for the species containing boron of boric acid and borate anions B(OH) - 4, B 3O 3(OH) - 4 and B 4O 5(OH) 2- 4 in Li 2B 4O 7(aq) solutions were taken into account. The stoichiometric equilibrium constants for the formation reactions of the boron species and the ion-interaction parameters were estimated simultaneously by using Pitzer equations of osmotic coefficient with minor modifications. Sixteen parameters were obtained with a standard deviation 0.005 5 for the ion-interaction model.(本文来源于《高等学校化学学报》期刊2004年10期)

离子相互作用模型论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

RNA是带有很强负电性的分子,溶液中的金属离子,尤其是高价离子,对RNA结构、动力学性质有着非常重要的作用。其中,非线性泊松-玻尔兹曼理论是处理离子与RNA分子与溶液离子相互作用的经典理论之一。由于平均场的近似,非线性泊松-玻尔兹曼理论很难定量预测高价离子与RNA分子的相互作用。本文主要采用非线性泊松-玻尔兹曼理论、蒙特卡罗模拟和TBI模型深入研究离子与带电胶体球和RNA的相互作用。主要研究内容如下:1.利用蒙特卡罗模拟和非线性泊松-玻尔兹曼理论两种方法,对半径10A,15A,20A,25A,30A表面带不同电荷的胶体球在广泛盐离子条件下,统计得到了盐离子的径向分布。通过广泛的对比蒙特卡洛模拟和非线性泊松-玻尔兹曼理论的结果,表明当带电胶体球被溶液中的离子中和到某一“临界”值,非线性泊松-玻尔兹曼理论可以定量的描述高价盐离子的径向分布。通过大量对比蒙特卡罗模拟和非线性泊松-玻尔兹曼理论的结果,我们总结出了一个经验公式来描述不同条件下的“临界”值。有趣的是,通过胶体球系统总结出的经验公式对真实的核酸分子也是适用的。2.拓展并利用紧束缚离子模型和蒙特卡罗模拟方法,对带电胶体球处在盐离子溶液环境下的盐离子的径向分布和同种电荷胶体球间的平均力势进行的计算和对比,发现两种方法吻合很好。进一步利用拓展的紧束缚离子模型,研究了带有高电荷密度的同种电荷胶体球处在盐离子浓度下之间平均力势的性质。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

离子相互作用模型论文参考文献

[1].郭冰冰,乔国富,欧进萍,刘军龙.耦合离子与水化产物间相互作用的水泥基材料氯离子传输模型[J].复合材料学报.2018

[2].熊贵.离子—聚电解质相互作用:从泊松—玻尔兹曼理论到紧束缚离子模型[D].武汉大学.2017

[3].李蕾.快速计算离子型非键复合物相互作用的经验模型[D].辽宁师范大学.2017

[4].李蕾,王长生.一种可用于快速计算离子氢键型复合物相互作用能的模型[C].中国化学会第29届学术年会摘要集——第15分会:理论化学方法和应用.2014

[5].叶树集.离子通道蛋白质模型物质丙甲甘肽与细胞仿生膜相互作用机理的实时原位表征[C].中国化学会第28届学术年会第3分会场摘要集.2012

[6].于艳丽,赵孔双,白伟,程玲.金属离子及CTAB对酵母细胞介电行为的影响——相互作用的模型化解析[J].生物物理学报.2008

[7].常好会,苏涛,孙卫文,赵绮华,秦兵.钾离子通道Kv4.2、Kv4.3及其相互作用蛋白KChIP1在电点燃癫模型中的表达变化[J].中华医学杂志.2006

[8].常好会,廖卫平,苏涛,孙卫文,赵绮华.钾离子通道Kv4.2、Kv4.3及其相互作用蛋白KChIP1在电点燃癫痫模型中的表达变化[C].第九次全国神经病学学术大会论文汇编.2006

[9].张爱芸,姚燕.298.15KLi_2B_4O_7-MgCl_2-H_2O体系热力学性质的电动势法测定及离子相互作用模型的研究[J].化学学报.2006

[10].张爱云,姚燕,宋彭生.298.15K下Li_2B_4O_7-H_2O体系水蒸汽分压及渗透系数的等压测定和离子相互作用模型[J].高等学校化学学报.2004

论文知识图

(a)在100ns分子动力学模拟过程中,...实验组所得的通道蛋白KCNQ1的相关生...本工作提出的多尺度微观模型(深灰区)、...等压平衡浓度和水活度方解石与氢离子相互作用模型Li2B4O7-MgCl2(B)-H2O体系在298.15 K...

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