荆芥、防风治疗溃疡性结肠炎的网络药理学研究

论文摘要

对荆芥、防风采用网络药理学方法筛选其治疗溃疡性结肠炎的作用靶点,探讨治疗溃疡性结肠炎作用机制。利用TCMSP数据平台,以口服利用度（OB）≥30%,类药性（DL）≥0. 18为阈值,筛选得到荆芥、防风的主要化学成分,并根据相应的作用靶点,构建靶点PPI网络。利用Uniprot数据库检索中药靶点对应的人类基因182个,从Genecard数据库中检索溃疡性结肠炎对应的基因3 874个,将疾病基因与中药基因取交集共115个,使用String工具对疾病与中药的基因交集进行PPI互作分析。采用Cytoscape软件绘制疾病靶点PPI网络,建立药物成分-靶点基因-疾病关系网络,发现共有108个节点,1 882个连接,并进行网络合并,筛选核心网络,进行基因GO功能和KFGG通路富集分析。采用动物实验进行机制验证。基因GO功能分析提示涉及生物过程、分子功能、细胞组成3个方面,发现溃疡性结肠炎可能与转录因子活性、细胞因子受体结合等有关。基因KEGG通路富集分析发现溃疡性结肠炎发病机制可能与TNF及Toll样受体信号通路介导细胞炎性因子IL-1及IL-6有关。荆芥、防风治疗溃疡性结肠炎机制可能与其有效成分干预TNF信号通路及TLRs信号通路中细胞因子受体结合、降低核转录因子-κB（NF-κB）转录、抑制肠道炎症因子IL-1及IL-6的分泌等具有相关性。

论文目录

• 1 资料与方法
•   1.1 荆芥、防风化学成分虚拟筛选
•   1.2 阈值筛选
•   1.3 荆芥、防风候选化合物基因靶点预测
•   1.4 溃疡性结肠炎基因靶点预测
•   1.5 网络合并
•   1.6 PPI互作分析计算核心基因和绘制Cytoscape药理网络图
•   1.7 基因富集分析
•   1. 8采用动物实验验证网络药理学
• 2 结果
•   2.1 荆芥、防风化学成分虚拟筛选
•   2.2 中药和疾病基因靶点预测
•   2.3 网络合并及PPI网络构建、核心基因筛选
•   2.4 绘制Cytoscape药理网络图
•   2.5 GO富集分析
•   2.6 KEGG通路富集分析
•   2.7 各组大鼠血清细胞因子水平测定
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 屈映,张书信,周璐,傅丽元,刘子号,李诗莹,戴亭亭,杨向阳,姬慧茹,曹敏然

关键词: 荆芥防风,网络药理学,溃疡性结肠炎,核转录因子

来源: 中国中药杂志 2019年24期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 中药学

单位: 北京中医药大学

基金: 国家自然科学基金面上项目(81473689)

分类号: R285

DOI: 10.19540/j.cnki.cjcmm.20190929.402

页码: 5465-5472

总页数: 8

文件大小: 197K

下载量: 1320