微卫星多态性标记论文_王春林

导读:本文包含了微卫星多态性标记论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:标记,文库,日本,生长激素,多态性,特异性,多样性。

微卫星多态性标记论文文献综述

王春林[1](2015)在《微卫星DNA多态性标记在生长激素缺乏症家系中的定位研究》一文中研究指出基金项目研究成果为推动和促进儿童生长发育相关的临床和基础研究,提高中青年儿科内分泌医师的学术水平,《中国实用儿科杂志》编委会和长春金赛药业有限责任公司于2007年10月联合设立"共助成长,共创未来"——金赛儿科中青年内分泌医师科(本文来源于《中国实用儿科杂志》期刊2015年08期)

秦海峰,龙宁,吴建国,石春海[2](2014)在《甜叶菊微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选》一文中研究指出甜叶菊是我国一种重要特种经济作物,其分子标记相关遗传背景研究甚少。本研究基于生物素与链霉亲和素的强亲和性原理,用链霉亲和素顺磁颗粒捕捉人工合成的标记有生物素的寡核苷酸探针(AG)15,间接筛选出含有甜叶菊基因组微卫星序列的DNA酶切片段,将筛选得到的片段连接到pUC-T载体中,构建甜叶菊微卫星序列的富集文库。挑取354个克隆进行菌落PCR检验,从中筛选出158个阳性克隆进行测序。结果表明,134个(84.81%)克隆中含有微卫星序列,其中完美型85个(63.43%)、非完美型15个(11.19%)、复合型34个(25.38%)。根据微卫星序列共设计出71对微卫星引物,其中62对能扩增出稳定的条带。利用24个甜叶菊品系对这62对引物的遗传多样性的分析表明,有16个位点表现出多态性,等位基因数为2~8个,平均每个位点扩增得到4.5个等位基因,多态性信息含量在0.3163~0.7595之间,观测杂合度(Ho)与期望杂合度(He)的范围分别为0.2174~0.9167与0.3555~0.8076。通过聚类分析,将甜叶菊分为大小叶两大类。本研究开发出的微卫星标记可为甜叶菊的分子遗传育种提供有效的遗传标记。(本文来源于《作物学报》期刊2014年03期)

田盛君,李晓东,姜玉声,刘胥,杨红威[3](2013)在《“光合1号”中华绒螯蟹微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选》一文中研究指出采用磁珠富集法(Fast isolation by AFLP sequences containing repeats,FIASCO)构建"光合1号"新品种中华绒螯蟹Eriocheir sinensis基因组微卫星文库。用PCR法对225个单菌落进行鉴定,共获得168个阳性克隆,测序发现有94个含有微卫星座位,其准确率为55.95%,其中单元重复次数为5~10的序列占34.04%,重复次数为10~20的序列占20.21%,重复次数大于20的序列占45.75%,重复次数最高达到92次;完美型微卫星座位69个(占73.40%),非完美型微卫星座位17个(占18.09%),混合型微卫星座位8个(占8.51%);根据微卫星侧翼序列设计并合成53对引物,检测结果显示,有31对(占58.50%)引物能够扩增出特异性条带;选择其中14对多态性良好的引物用于中华绒螯蟹辽河野生群体的遗传多样性分析,共检测到148个等位基因,单个位点等位基因数为7~13个,平均为10.6个,观测杂合度为0.214 3~0.666 7,期望杂合度为0.825 4~0.910 1,多态性信息含量为0.766 3~0.865 4。(本文来源于《大连海洋大学学报》期刊2013年03期)

贾舒雯,刘萍,韩智科,李健,潘鲁青[4](2011)在《脊尾白虾微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选》一文中研究指出采用人工合成的生物素标记(AG)15探针及磁珠富集法构建了脊尾白虾基因组微卫星富集文库。将脊尾白虾基因组DNA经HaeⅢ酶切后,收集400~1 200 bp片段,连接特定接头,与生物素标记(AG)15探针杂交并捕获含有微卫星的DNA片段,然后连接到pMD18-T载体中,构建脊尾白虾微卫星富集文库。随机挑取947个克隆,经菌落PCR检验,其中667个为阳性克隆。从阳性克隆中随机选取184个克隆进行测序,有150个克隆含有微卫星序列,共获得199个微卫星序列,其中完美型158个(79.4%),非完美型27个(13.6%),复合型14个(7.0%)。根据微卫星序列,设计了119对微卫星引物,64对扩增出稳定的具有特异性的条带,经30个脊尾白虾个体进行多样性评价后,有26个位点表现出多态性。26个微卫星位点获得的等位基因数从3~16个不等,平均每个位点扩增得到6.5个等位基因。观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态性信息含量值(PIC)的范围分别为0.111~0.929、0.246~0.932、0.231~0.909。本研究开发的微卫星位点将为脊尾白虾种群多样性研究、家系识别和种质鉴定提供有效的工具。(本文来源于《水产学报》期刊2011年12期)

宋春妮,李健,刘萍,陈萍,高保全[5](2011)在《日本蟳微卫星富集文库的建立与多态性标记的筛选》一文中研究指出采用磁珠富集法筛选日本蟳微卫星分子标记。日本蟳基因组DNA经Sau3 AⅠ酶切后,收集400~1 200 bp大小的片段并纯化,利用生物素标记的寡核苷酸探针(AC)15从中筛选出含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体中,构建富集微卫星序列的基因组文库,经PCR检测筛选出阳性克隆进行测序。从随机挑选的970个菌落中筛选出369个阳性克隆进行测序,结果86.99%(321个)含有微卫星序列,其中完美型占80.54%,非完美型占15.95%,混合型占4.28%。除使用的探针AC重复外,还得到GA、CT等重复序列。共设计出102对微卫星引物,其中65对能扩增出清晰条带,27对具有多态性。同时筛选出的微卫星标记可为今后研究日本蟳的分子遗传育种提供有效的遗传标记。(本文来源于《水产学报》期刊2011年01期)

董徐辉[6](2010)在《日本鬼鲉同工酶组织差异、基于Cytb,COII的系统发育分析及微卫星多态性标记筛选》一文中研究指出日本鬼鲉是一种有较高经济价值的的鱼类。本文从日本鬼鲉不同组织同工酶差异,基于Cyt b,COII基因序列的系统发育地位分析和多态性微卫星引物的筛选等叁方面进行了研究。采用垂直聚丙烯酰胺平板电泳技术,对象山港野生日本鬼鲉的9种组织器官的8种同工酶进行研究,并分析了其酶谱表型。结果表明,琥珀酸脱氢酶在所有组织中均存在,组织间差异较小;乳酸脱氢酶、苹果酸脱氢酶、苹果酸酶、酯酶、醇脱氢酶、过氧化物酶、超氧化物歧化酶则具有明显的组织特异性,且这些酶在表型、分布和活性上均表现出高度的组织特异性。根据鲉行目鱼类cyt b和COⅡ上下游保守序列各自设计引物,对日本鬼鲉的线粒体DNA进行PCR扩增,克隆并测定了cyt b和COⅡ因的全序列, COⅡ基因为691 bp和cyt b为1141 bp。从GenBank下载鲉形目28种鱼类的cytb部分或全序列和10种鱼类的COⅡ部分或全序列,然后进行比对分析,用NJ法和ML法构建分子系统发育树。系统发育树结果显示:线粒体cytb和COⅡ基因序列构建的分子系统树,和传统分类方法的结果基本一致;毒鲉科的日本鬼鲉和鲉科的关系最近;在飞角鱼科(Dactylopteridae)是否属于鲉形目还是单独成飞角鱼目的问题上,本研究比较支持飞角鱼科(Dactylopteridae)独立归成飞角鱼目(Dactylopteriformes)。鲉形目的COⅡ与昆虫类的COⅡ不同,鲉形目的COⅡ基因比cyt b基因保守,即COⅡ基因比cyt b基因进化慢。COⅡ基因进化树相应的节点上数值稍微较高。用磁珠富集法构建的日本鬼鲉基因组微卫星文库中共有近1000个单菌落。随机挑选352个克隆用载体引物进行第二次筛选,获得阳性候选克隆262个并随机选择了174个克隆进行测序。测序结果表明,156个克隆含有明显(重复次数大于5次)的微卫星重复单元,共含有181个微卫星结构域。两碱基重复次数大于12或叁碱基重复次数大于8的克隆共67个。所获得含微卫星的序列总长度范围是152-854bp,平均长度在330 bp左右。其中两碱基重复单元出现的次数最多,占所有分离的微卫星数目的79.0%,叁碱基重复单元出现的次数居次,10.5%,此外还发现一碱基重复,四碱基重复,五碱基重复等多种重复类型,共占分离微卫星数目的10.5%,在获得的181个微卫星位点中,完美型微卫星序列共有98个,占54.1% ;非完美型的66个,占36.5% ;复合型的17个,占9.4%。对两碱基复次数大于12或叁碱基重复次数大于8的克隆的67个克隆,用Primer premier 5.0引物设计软件设计65对引物,并随机挑选32个合成。用32对引物在厦门日本鬼鲉群28个个体进行PCR扩增,筛选出25对有效扩增的微卫星引物,其中19对微卫星引物在此群体有高度多态性。每个位点等位基因个数(A)在4-14之间,观察杂合度在0.500–0.892之间,期望杂合度0.521–0.914之间。有两个位点(J004, IJ014)严重偏离Hardy-Weinberg平衡。本文首次报道了日本鬼鲉微卫星DNA标记的多态性筛选,在毒鲉科鱼类中也尚属第一次。(本文来源于《宁波大学》期刊2010-11-19)

李军林,加建斌,魏泓,张耀光[7](2000)在《微卫星DNA多态性标记研究现状》一文中研究指出通过对微卫星标记特征 ,生物基因序列中的功能和产生遗传机制的论述 ,着重分析了微卫星多态性标记在小鼠遗传监测中遗传作图、种群关系研究、人类疾病基因诊断和人类疾病遗传机理等方面的应用 ,从而进一步推广微卫星重复序列在真核生物中的广泛应用(本文来源于《榆林高等专科学校学报》期刊2000年04期)

微卫星多态性标记论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

甜叶菊是我国一种重要特种经济作物,其分子标记相关遗传背景研究甚少。本研究基于生物素与链霉亲和素的强亲和性原理,用链霉亲和素顺磁颗粒捕捉人工合成的标记有生物素的寡核苷酸探针(AG)15,间接筛选出含有甜叶菊基因组微卫星序列的DNA酶切片段,将筛选得到的片段连接到pUC-T载体中,构建甜叶菊微卫星序列的富集文库。挑取354个克隆进行菌落PCR检验,从中筛选出158个阳性克隆进行测序。结果表明,134个(84.81%)克隆中含有微卫星序列,其中完美型85个(63.43%)、非完美型15个(11.19%)、复合型34个(25.38%)。根据微卫星序列共设计出71对微卫星引物,其中62对能扩增出稳定的条带。利用24个甜叶菊品系对这62对引物的遗传多样性的分析表明,有16个位点表现出多态性,等位基因数为2~8个,平均每个位点扩增得到4.5个等位基因,多态性信息含量在0.3163~0.7595之间,观测杂合度(Ho)与期望杂合度(He)的范围分别为0.2174~0.9167与0.3555~0.8076。通过聚类分析,将甜叶菊分为大小叶两大类。本研究开发出的微卫星标记可为甜叶菊的分子遗传育种提供有效的遗传标记。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

微卫星多态性标记论文参考文献

[1].王春林.微卫星DNA多态性标记在生长激素缺乏症家系中的定位研究[J].中国实用儿科杂志.2015

[2].秦海峰,龙宁,吴建国,石春海.甜叶菊微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J].作物学报.2014

[3].田盛君,李晓东,姜玉声,刘胥,杨红威.“光合1号”中华绒螯蟹微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J].大连海洋大学学报.2013

[4].贾舒雯,刘萍,韩智科,李健,潘鲁青.脊尾白虾微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J].水产学报.2011

[5].宋春妮,李健,刘萍,陈萍,高保全.日本蟳微卫星富集文库的建立与多态性标记的筛选[J].水产学报.2011

[6].董徐辉.日本鬼鲉同工酶组织差异、基于Cytb,COII的系统发育分析及微卫星多态性标记筛选[D].宁波大学.2010

[7].李军林,加建斌,魏泓,张耀光.微卫星DNA多态性标记研究现状[J].榆林高等专科学校学报.2000

论文知识图

分子标记的进一步定位注:(a,b)TNA...个性状Box-cox转换QQ图Fig.5-1Qplot...微卫星标记PCR扩增产物琼脂糖电泳检测F...部分基因组DNA琼脂糖电泳检测Fig.1Par...部分基因组DNA琼脂糖电泳检测结果引物SEG3(A)、SEG18(B)在蛇鳄龟群体中的...

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微卫星多态性标记论文_王春林
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