论文摘要
为了解广东省蚊媒病毒的种类和分子特征,本研究对从蚊子中分离的三株黄病毒提取病毒核酸并进行二代测序,经序列拼接和比对,基因组序列中缺失的gap通过RT-PCR进行扩增填补。用MEGA软件登录GenBank下载黄病毒代表株序列并绘制进化树,同时用ClustalW2软件与新毒株进行氨基酸同源性比对和编码框序列的分析。结果显示利用二代测序技术获得了三株病毒基因组序列的96.35%～98.26%,并用RT-PCR成功补齐所有gap,序列比对显示其中一株与黄斑库蚊病毒核苷酸和氨基酸同源性98.51%,两株病毒与广平病毒的核苷酸同源性分别为97.30%和89.78%。三株病毒都属于黄病毒家族中的未分类黄病毒或昆虫特异性黄病毒,编码区序列中C蛋白的同源性最低,NS5的同源性最高。本研究发现的三株蚊媒黄病毒中,库蚊黄斑病毒在国内为首次鉴定;两株广平病毒核苷酸同源性存在较大差异,可能存在不同基因亚型。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 吴德,李柏生,谈琦琪,张欣,张欢,曹玉玺,王环宇,梁国栋
关键词: 致倦库蚊,黄斑库蚊病毒,广平病毒,系统进化分析
来源: 病毒学报 2019年02期
年度: 2019
分类: 基础科学,医药卫生科技
专业: 生物学,基础医学
单位: 广东省疾病预防控制中心病原微生物检验所,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
基金: 广东省医学科学技术研究基金项目(项目号:C2018007),题目:广东省蚊媒病毒调查研究,广东省医学科学技术研究基金项目(项目号:A2017482),题目:基于高通量测序的未知病原体快速鉴定研究~~
分类号: R373
DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003519
页码: 240-246
总页数: 7
文件大小: 1158K
下载量: 131
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