导读:本文包含了富集文库论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:红砂(Reaumuria,soongarica),微卫星,磁珠,富集文库
富集文库论文文献综述
殷恒霞,石勇,张雯,燕霞,马小飞[1]（2016）在《荒漠植物红砂(Reaumuria soongarica)基因组微卫星富集文库的构建及特性》一文中研究指出采用磁珠富集法构建了红砂(Reaumuria soongarica)基因组微卫星富集文库,通过测序结果对文库的特性进行了分析。结果表明:在获得的13 922条微卫星序列中完美型占88%,非完美型10%,混合型2%。微卫星重复基元显示5种类型,以叁碱基基元(GGT)n、(TGG)n、(ACC)n最多,占总数的60.7%;其次为二碱基基元,主要是(AC)n、(GT)n、(CA)n,占38.6%;这5种微卫星重复基元的重复次数多集中在5~10。通过对随机挑选的100条微卫星序列设计引物,并以遗传距离和地理距离较远个体的基因组为模板进行扩增筛选,可有效扩增的引物为62对,并进一步测序筛选获得了12对多态性微卫星引物。磁珠富集法是开发红砂基因组微卫星序列的一种高效、可行的方法,构建的微卫星文库效率较高,富集量大,重复基元类型丰富,为红砂遗传进化和种质资源保护提供了可靠的数据支持和高效的分子遗传标记。(本文来源于《中国沙漠》期刊2016年02期）
油九菊,范嗣刚,黄桂菊,郝博飞,陈飞飞[2]（2015）在《合浦珠母贝基因组微卫星富集文库的构建与分析》一文中研究指出采用生物素标记的(AC)_(15)探针和磁珠富集法构建合浦珠母贝(Pinctada fucata)基因组DNA微卫星富集文库。随机挑选2097个克隆进行筛选,得到483个候选克隆(23.03%),对其中135个阳性克隆测序分析发现122个克隆含有微卫星重复单元(90.37%)。进一步通过序列比对,最终得到65个具有特异微卫星序列的阳性克隆(53.28%),其中包含85个微卫星DNA结构域,其中完美型(perfect)70个,占82.36%;非完美型(imperfect)7个,占8.24%;混合型(compound)8个,占9.41%,重复次数主要分布在5~20(95.74%),平均重复次数为7.83,(AC/GT)n重复所占比例最高(75.53%)。基于微卫星两端的侧翼序列,利用Primer Premier 5.0设计引物,获得11对具有多态性的微卫星引物。本研究为开展合浦珠母贝分子育种及资源评价分析提供了基础资料。(本文来源于《海洋科学》期刊2015年10期）
宁晔凤,黎中宝,戴刚,上官静波,李清荟[3]（2015）在《中国鲎基因组微卫星富集文库的构建及分析》一文中研究指出本研究旨在从DNA分子水平上研究中国鲎(Tachypleus tridentatus)种群遗传多样性及种群结构等相关信息,以期为保护其野生群体种质资源提供科学依据。本研究通过生物素—磁珠富集法筛选微卫星标记,构建中国鲎基因组微卫星文库。基因组DNA经Fast Digest Tru1I酶切后,选取400 bp~1000 bp片段,用生物素标记的(GT)15、(CT)15混合探针与其杂交,杂交复合物与链霉亲和素磁珠结合,捕获含有重复序列的微卫星片段,纯化后连接PMD19-T载体克隆,构建基因组微卫星文库。从334个阳性克隆中随机选取196个片段大于400 bp的阳性克隆进行测序,共获得127个微卫星序列,其中完美型占69.3%、非完美型占11.0%、复合型占19.7%。除探针使用的GT和CT的重复序列外,还筛选到多碱基GCT、TGG、AAAC、ACAA、GATTT、TTTTA的重复序列。根据微卫星序列设计选择合成40对引物,结果显示其中3对具有较高多态性,可作为进一步评价中国鲎野生种质资源等遗传信息的有效遗传标记。(本文来源于《海洋科学》期刊2015年04期）
裴宋雨,任志勇,焦振彬,程月琴,王红卫[4]（2015）在《香椿(Toona sinensis)微卫星富集文库构建及特性分析》一文中研究指出采用Dynal磁珠富集法构建了香椿微卫星富集文库,通过测序结果对文库的特性进行了分析。实验使用改良CTAB法提取香椿基因组DNA,用(AC)8、(AG)8和(ATG)123种带有生物素标记的探针与香椿基因组DNA的酶切片段进行杂交,将磁珠捕获的含有微卫星序列的DNA片段插入p MD 18-T载体,并转入感受态细胞Trans 5α构建克隆,经筛选后得到含356个克隆的香椿基因组微卫星富集文库。从富集文库中挑选插入片段长度为400~800 bp的128个克隆进行测序,其中含有SSR的序列77条,得率达60.16%,其中完美型占82.69%,非完美型8.65%,混合型8.65%。上述结果为SSR位点的进一步开发奠定了基础。(本文来源于《种子》期刊2015年02期）
王书珍,金卫斌,项俊,郑永良,方元平[5]（2015）在《杜鹃基因组微卫星富集文库的构建》一文中研究指出利用FIASCO方法(Fast Isolation by AFLP Sequences COntaining repeats)构建杜鹃(Rhododendron simsii Planch.)的(AG)n微卫星富集文库。通过菌液PCR检测,从(AG)n微卫星富集文库的356个阳性菌落中筛选了233个进行测序分析。结果表明,202个序列富含SSR位点,阳性比率达86.7%。去除杂峰、迭峰、信号弱的序列,最终筛选39个供后续引物开发使用,其中完美型SSR有22个,不完美型5个,混合型12个。磁珠富集法构建杜鹃基因组微卫星文库是一条高效可行的途径,为微卫星位点的分离、杜鹃种群遗传多样性和遗传结构的研究奠定了基础。(本文来源于《湖北农业科学》期刊2015年03期）
张川,郭宝英,吴常文[6]（2014）在《曼氏无针乌贼微卫星DNA富集文库构建与鉴定》一文中研究指出曼氏无针乌贼是我国四大海产之一,开发其微卫星标记具有重要的科研与应用价值。本研究采用FIASCO法(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)构建了曼氏无针乌贼的(CA)n微卫星富集文库,通过PCR检测出640个阳性克隆,占所有克隆的87%,从阳性克隆中随机选取118个进行测序,序列分析发现,103个克隆含有7次以上的重复序列,其中完全的为67(65%)个,不完全的23个(22.3%),复合的为13(12.7%)个,重复次数范围为7~59次,平均为38次。在103个序列中共42条可以设计引物,所筛选出的引物可以用于评估曼氏无针乌贼种质资源遗传多样性、遗传结构、亲子鉴定以及放流效果评估等。(本文来源于《浙江海洋学院学报(自然科学版)》期刊2014年06期）
许玉兰,白青松,张瑞丽,田斌,王大玮[7]（2014）在《云南松基因组微卫星富集文库的序列特征分析》一文中研究指出目的:分析基因组微卫星富集文库的序列特征,探索云南松基因组微卫星的分布特征或变异规律。方法:采用磁珠富集法,从云南松基因组DNA的RsaⅠ酶切产物中富集微卫星片段,富集片段经洗脱分离、载体连接及转化等环节,对富集文库鉴定和测序,分析序列特征。结果:在测序获得的159条序列中,有143条序列含有重复次数不少于3次的微卫星序列,序列长度为135~1 138 bp,平均520 bp,克隆比例为89.94%。在这些序列中,以二核苷酸重复类型最多(56.64%),其次是叁核苷酸,有51条(35.66%),此外,出现少量(7.70%)重复类型为4~6 bp的微卫星序列;各重复单元的碱基组成以探针及其互补序列为主,并出现少量的非探针类型;重复次数介于3~15,随着重复单元长度的增加而出现的频率降低。结论:分析了云南松基因组微卫星富集文库微卫星重复类型、重复单元碱基组成及其序列长度变异,为进一步分析云南松基因组微卫星的分布特征或变异规律奠定基础,进而为开发SSR引物提供基础信息。(本文来源于《生物技术》期刊2014年04期）
徐永涛[8]（2014）在《藏羚羊微卫星富集文库构建与引物筛选》一文中研究指出本研究利用分子生物学技术进行了藏羚羊微卫星富集文库构建和引物筛选，筛选出一套多态性较高的微卫星分子标记，为探讨藏羚羊种群间基因流以及遗传多样性保持机制奠定了基础。本文通过FIASCO (Fast isolation by AFLP of sequences containing repeats)法对青海、西藏、新疆叁个地理单元的4只藏羚羊DNA样品（青海118号、132号；西藏14号；新疆62号）进行微卫星富集文库的构建与引物开发。将4只藏羚羊的基因组DNA等比例混合，经限制性内切酶MseⅠ酶切获得300-1000bp DNA片段，经接头连接和变性使DNA双链解成单链，使用7种生物素标记的寡核苷酸探针（AG)12、(AC)12、(GC)12、(AT)12、（AAC）8、（TGC）8和（AGT）8与单链DNA片段中含有微卫星的序列进行杂交。根据生物素与链霉亲和素的亲和性原理，用链霉亲和素包被的磁珠亲和捕捉含有微卫星序列的DNA片段。对富集片段通过PCR扩增恢复成双链，纯化PCR产物连接到pCR@2.1载体，DH5α感受态细胞转化培养，通过菌液检测，将条带数等于2的阳性克隆进行测序分析。主要研究结果如下：1、以生物素标记的寡核苷酸探针(AG)12、(AC)12、(TGC)8、(AGT)8、(AAC)8构建的藏羚羊微卫星富集文库，经载体连接和克隆转化，阳性克隆率分别为50.7%、40.7%、50%、41.6%、31.1%，说明构建的藏羚羊基因组微卫星富集文库为质量较好的文库。2、利用磁珠富集法共得到微卫星序列144个，重复次数范围为5-39次。所选择的7种生物素探针中，未富集到(GC)n、(AT)n类型的微卫星序列。3、依据得到的微卫星序列，用Primer5软件在线设计并合成引物107对，对3个地理单元（青海、新疆、西藏）的24个藏羚羊基因组DNA扩增，成功筛选出22个具有多态性的藏羚羊微卫星位点。4、首次构建了藏羚羊基因组微卫星富集文库，并将部分序列提交至GenBank（GenBank Accession Number:KC422272-KC422315）。(本文来源于《青海师范大学》期刊2014-05-01）
王亚平,焦振彬,裴宋雨,叶永忠,王红卫[9]（2014）在《磁珠富集法构建播娘蒿SSR文库及特性分析》一文中研究指出为构建播娘蒿SSR文库,通过Dynal磁珠富集法富集生物素标记的(AC)8,(AG)8和(ATG)12探针与播娘蒿基因组的酶切片段杂交的片段,捕获含有SSR位点的DNA序列,连接到pMD 18-T载体上,并转入感受态细胞DH 5α,共获得778个克隆.挑选阳性克隆,利用SuperSNX 24-F引物对菌液克隆进行PCR检测.利用M13F,M13R载体引物和探针结合的方法对文库进行2次筛选,获得93个长度为400~1 000 bp的克隆并测序.结果表明,82条序列含有SSR位点,占测序条数的88.17%.共有SSR位点数127个.其中完全型SSR位点102个,不完全型SSR位点10个,混合型SSR位点15个,分别占SSR位点总数的80.31%,7.87%,11.81%.SSR重复基元中,以二核苷酸(CT)n,(AC)n,(GT)n,叁核苷酸(GAT)n最为常见,得率分别为20.47%,26.77%,21.26%和15.75%.(本文来源于《河南农业大学学报》期刊2014年02期）
徐永涛,马建滨,周智红,谭春敏,张湑泽[10]（2014）在《藏羚羊(AAC)_n微卫星富集文库构建与引物筛选》一文中研究指出基于磁珠富集法,利用生物素标记的寡核苷酸探针(AAC)8从藏羚羊(Tibetan antelope)基因组酶切的300~1000bp片段中筛选微卫星位点,纯化的富集片段连接到pCR@2.1载体和转化到Trans5α感受态细胞.随机挑取180个白斑克隆,PCR检测到条带数大于或等于2的阳性克隆为56个,阳性率为31.1%.对阳性克隆测序,获得43条含微卫星座位的序列,微卫星重复次数在5~20次之间.舍弃不适宜设计引物的微卫星座位,试验设计并合成了20对微卫星引物;以3个样点(青海、新疆、西藏)的24个藏羚羊基因组为模板进行PCR扩增,获得8对可得到稳定扩增产物的微卫星引物,其中4对引物的扩增产物具有多态性,座位分别为AAC050、AAC056、AAC165和AAC477.上述引物可用于藏羚羊及近缘物种的遗传多样性、种群遗传结构等研究.(本文来源于《青海师范大学学报(自然科学版)》期刊2014年01期）
富集文库论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
采用生物素标记的(AC)_(15)探针和磁珠富集法构建合浦珠母贝(Pinctada fucata)基因组DNA微卫星富集文库。随机挑选2097个克隆进行筛选,得到483个候选克隆(23.03%),对其中135个阳性克隆测序分析发现122个克隆含有微卫星重复单元(90.37%)。进一步通过序列比对,最终得到65个具有特异微卫星序列的阳性克隆(53.28%),其中包含85个微卫星DNA结构域,其中完美型(perfect)70个,占82.36%;非完美型(imperfect)7个,占8.24%;混合型(compound)8个,占9.41%,重复次数主要分布在5~20(95.74%),平均重复次数为7.83,(AC/GT)n重复所占比例最高(75.53%)。基于微卫星两端的侧翼序列,利用Primer Premier 5.0设计引物,获得11对具有多态性的微卫星引物。本研究为开展合浦珠母贝分子育种及资源评价分析提供了基础资料。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
富集文库论文参考文献
[1].殷恒霞,石勇,张雯,燕霞,马小飞.荒漠植物红砂(Reaumuriasoongarica)基因组微卫星富集文库的构建及特性[J].中国沙漠.2016
[2].油九菊,范嗣刚,黄桂菊,郝博飞,陈飞飞.合浦珠母贝基因组微卫星富集文库的构建与分析[J].海洋科学.2015
[3].宁晔凤,黎中宝,戴刚,上官静波,李清荟.中国鲎基因组微卫星富集文库的构建及分析[J].海洋科学.2015
[4].裴宋雨,任志勇,焦振彬,程月琴,王红卫.香椿(Toonasinensis)微卫星富集文库构建及特性分析[J].种子.2015
[5].王书珍,金卫斌,项俊,郑永良,方元平.杜鹃基因组微卫星富集文库的构建[J].湖北农业科学.2015
[6].张川,郭宝英,吴常文.曼氏无针乌贼微卫星DNA富集文库构建与鉴定[J].浙江海洋学院学报(自然科学版).2014
[7].许玉兰,白青松,张瑞丽,田斌,王大玮.云南松基因组微卫星富集文库的序列特征分析[J].生物技术.2014
[8].徐永涛.藏羚羊微卫星富集文库构建与引物筛选[D].青海师范大学.2014
[9].王亚平,焦振彬,裴宋雨,叶永忠,王红卫.磁珠富集法构建播娘蒿SSR文库及特性分析[J].河南农业大学学报.2014
[10].徐永涛,马建滨,周智红,谭春敏,张湑泽.藏羚羊(AAC)_n微卫星富集文库构建与引物筛选[J].青海师范大学学报(自然科学版).2014
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