高通量测序结合传统方法分析4℃下鲜切菠菜的菌群变化

论文摘要

采用Illumina MiseqTM高通量测序技术结合传统检测方法,对4℃下贮藏的鲜切菠菜在贮藏过程中存在的腐败菌进行研究。结果表明:在科的分类标准下,在贮存初期,假单胞菌科和肠杆菌科为优势菌科,丰度分别占比48. 99%、48. 62%,从菌群变化的角度来看,随着贮藏时间的推移,假单胞菌科的丰度从初始丰度的48. 99%到贮藏末期的70. 27%;而肠杆菌科则从初始丰度的48. 62%不断递减至21. 75%。此时,假单胞菌科为贮藏末期的优势菌科;在属的分类标准下,假单胞菌属、泛菌属为贮存初期的优势菌属,丰度分别占比47. 84%、30. 7%,欧文氏菌属、布丘氏菌为次优势菌,丰度为8. 09%和4. 64%;贮存中期,假单胞菌属为优势菌属,其丰度上升至58. 25%,而泛菌属丰度下降至13. 94%,欧文氏菌属丰度基本保持不变达8. 69%、布丘氏菌属丰度小幅上升至9. 73%;在贮存末期,假单胞菌属占绝对优势,丰度占比68. 97%,而泛菌属丰度仅占5. 4%,欧文氏菌属占比10. 7%,布丘氏菌属占比4%,假单胞菌属成为优势腐败菌属。高通量检测技术和传统检测方法相比,在鉴定样品DNA组成成分时可精确定量,提高了精度,节约了时间。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 菠菜的鲜切处理及分组
•   1.2 实验试剂及仪器
•     1.2.1 实验试剂
•     1.2.2 实验仪器
•   1.3 实验方法
•     1.3.1 感官评定
•     1.3.2 腐败菌的分离纯化
•     1.3.3 菌悬液的制备及保种
•     1.3.4 菌种的初步鉴定及计数
•     1.3.5 总DNA的提取
•     1.3.7 生物信息学分析
• 2 结果与分析
•   2.1 感官评定及总菌
•   2.2 腐败菌的初步鉴定
•     2.2.1 形态学观察及生理生化实验
•     2.2.2 腐败菌的计数
•   2.3 高通量测序鉴定
•     2.3.1 数据质控及稀释度曲线
•     2.3.2 Alpha多样性分析
•     2.3.3 细菌群落分析
•       2.3.3. 1 基于科分类水平上的分析
•       2.3.3. 2 基于属分类水平上的样品菌群分布图
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 郁杰,谢晶

关键词: 鲜切菠菜,高通量测序技术,传统检测方法,菌群演替

来源: 食品与发酵工业 2019年09期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 轻工业手工业

单位: 上海海洋大学食品学院,上海冷链装备性能与节能评价专业技术服务平台,农业农村部冷库及制冷设备质量监督检验测试中心(上海),上海海洋大学食品科学与工程国家级实验教学示范中心

基金: 上海市绿叶菜产业体系建设项目,上海市科委公共服务平台建设项目(17DZ2293400)

分类号: TS255.1

DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.019261

页码: 183-189

总页数: 7

文件大小: 480K

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