从作物基因组分析到整合组学知识库建设

从作物基因组分析到整合组学知识库建设

论文摘要

高通量技术的广泛应用使得各类组学数据的产出速度越来越快,由此产生的海量数据蕴藏着大量的基因组变异和相关功能信息。如何对这些数据进行深度整合和利用将会是一个长期而艰巨的任务,这需要具备高效的数据存储、分析和挖掘的能力。在过去几年中,本课题组通过与所内外课题组的合作,在多个植物的基因组的组装、注释、比较基因组和群体基因组分析等方面进行了探索,同时也将大量的水稻种质信息和组学数据进行了整合,存储于结构化数据库中并开发了一些相应的网络查询展示和数据挖掘工具。本文对相关的研究成果及其进展进行了概括性介绍,并展望了下一步的目标:构建一个用于支持作物功能基因组学和分子设计育种研究的整合组学知识库。

论文目录

  • 1 研究成果及进展
  •   1.1 基因组组装和注释
  •   1.2 比较基因组和群体基因组分析
  •   1.3 数据库建设
  • 2 作物多组学大数据整合知识库建设展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 梁承志

    关键词: 基因组分析,数据库,组学大数据,分子设计育种,作物,组学知识库

    来源: 遗传 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,农业基础科学

    单位: 中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室种子创新研究院,中国科学院大学

    基金: 中国科学院重点部署项目(编号:ZDRW-ZS-2019-2-0105)资助~~

    分类号: S188

    DOI: 10.16288/j.yczz.19-121

    页码: 875-882

    总页数: 8

    文件大小: 2033K

    下载量: 167

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