4个绵羊品种FSHR基因多态性与生物信息学分析

论文摘要

旨在探究4个绵羊品种的多胎性状分子遗传机制,以高山美利奴羊、青海细毛羊、中国美利奴羊和敖汉细毛羊为研究对象,通过分析全基因组测序结果对4个绵羊品种FSHR基因外显子单核苷酸多态性进行筛选,利用专门软件预测单核苷酸多态性对FSHR基因mRNA二级结构、蛋白质二级结构和三级结构的影响。研究发现,高山美利奴羊、中国美利奴羊、敖汉细毛羊FSHR基因在外显子上分别存在3个SNPs(T904G、C975T、G1572A)、7个SNPs(G149A、G813A、T817C、T904G、C975T、T1234C、G1572A)、6个SNPs(G813A、T817C、T904G、C975T、T1234C、G1572A),青海细毛羊FSHR基因在外显子上不存在突变位点。生物信息学分析发现,试验所检测到的7个SNPs中T817C、T904G、T1234C导致mRNA的二级结构和最小自由能发生改变,G813A引起最小自由能改变,而未引起mRNA二级结构发生改变,G149A、C975T与G1572A未引起最小自由能与mRNA的二级结构发生改变。5个错义突变位点(G149A、G813A、T904G、C975T、G1572A)均导致编码蛋白质二级结构与三级结构发生改变。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
•     1.2.1 全基因组测序
•     1.2.2 FSHR基因多态位点筛选
•     1.2.3 FSHR基因多态位点遗传多样性分析
•     1.2.4 生物信息学分析
• 2 结果与分析
•   2.1 4个绵羊品种FSHR基因外显子SNPs筛选
•   2.2 4个绵羊品种多态位点统计学分析
•   2.3 FSHR基因的RNA二级结构分析
•   2.4 FSHR基因多态位点蛋白质二级结构预测
•   2.5 FSHR基因多态位点蛋白质三级结构预测
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陈来运,袁超,孙晓萍,刘建斌,牛春娥,杨博辉

关键词: 绵羊,基因,多态性,生物信息学分析

来源: 江苏农业科学 2019年22期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 畜牧与动物医学

单位: 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所/羊育种工程技术研究中心

基金: 国家绒毛用羊产业技术体系建设专项(编号:CARS-39-02),中国农业科学院创新工程项目(编号:CAAS-ASTIP-2015-LIHPS),甘肃省重点研发计划-农业类(编号:17YF1NA069)

分类号: S826

DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.22.009

页码: 47-51

总页数: 5

文件大小: 1219K

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