两种HLA分型方法对比

论文摘要

对比两种HLA分型方法的准确率,通过使用polysolver方法和研究出的新方法这两种方法对100个个体的全基因组外显子测序数据(WES)进行分型,然后将两种方法的分型结果与这100个个体的sanger一代测序结果进行比较,找到新方法的优点和不足,并且为动物MHC基因研究提供算法基础。经过新方法的开发以及优化,最终与polysolver方法的结果进行比较,得出结论,发现研究的新方法与polysolver分型方法相比准确率相对较高,且运行时间相对较短。两种方法均只能对HLA一类分子进行分型,这一点在将来实验中会进一步改进。

论文目录

• 1 两种方法介绍
•   1.1 背景介绍及方法来源
•   1.2 方法介绍
•     1.2.1 数据来源
•     1.2.2 Polysolver方法介绍
•     1.2.3 新方法介绍
•   1.3 相关软件环境介绍
•   1.4 两种方法的简单使用
• 2 两种方法比较
• 3 结论与讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 原应博,方铭

关键词: 分型,分型新方法,高通量测序数据

来源: 现代畜牧科技 2019年08期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 黑龙江八一农垦大学,集美大学

基金: 国家自然科学基金面上项目(31672399和31872560)

分类号: Q811.4

DOI: 10.19369/j.cnki.2095-9737.2019.08.001

页码: 1-6

总页数: 6

文件大小: 610K

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