中华绒螯蟹IAG基因的克隆及生物信息学分析

中华绒螯蟹IAG基因的克隆及生物信息学分析

论文摘要

采用RACE-PCR技术,获得中华绒螯蟹胰岛素样促雄激素腺基因(Es-IAG)全长cDNA序列,并利用相关生物信息学软件对该基因及其蛋白质的结构、理化特性进行生物信息学分析。结果发现,Es-IAG基因序列全长1 392 bp,编码151个氨基酸,Es-IAG多肽的相对分子量为16.61 kD,理论等电点pI为5.08,前体多肽中存在分泌型信号肽,存在两个糖基化位点和16个磷酸化位点,存在两个典型的R**R蛋白酶酶切位点,未发现跨膜结构域。Es-IAG为分泌性蛋白,蛋白需要通过结合细胞膜上的受体而发挥性别调控等作用。对22个近缘物种的IAG基因序列系统进化分析显示,中华绒螯蟹与蓝蟹、拟穴青蟹的亲缘关系较近。为深入研究Es-IAG基因及其蛋白的结构和功能提供了相关依据。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 中华绒螯蟹IAG基因的特征
  •   1.2 Es-IAG蛋白理化性质分析
  •   1.3 Es-IAG蛋白信号肽、跨膜结构域和亚细胞定位
  •   1.4 Es-IAG的酶切位点及磷酸化、糖基化位点预测
  •   1.5 Es-IAG蛋白的二、三级结构预测
  •   1.6 IAG氨基酸序列的系统进化分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 实验材料
  •   3.2 实验方法
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 付春鹏,于杰伦,李法君,王慧

    关键词: 中华绒螯蟹,基因,生物信息学分析

    来源: 基因组学与应用生物学 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

    专业: 生物学,水产和渔业

    单位: 潍坊科技学院山东半岛卤水资源高值化绿色化综合利用工程技术研发中心,山东农业大学动物科技学院

    基金: 山东半岛卤水资源高值化绿色化综合利用工程技术研发中心资助项目(2018LS015,2018LS009),山东省“双一流”奖补资金,山东省海洋与渔业科技创新计划项目(2017YY27),山东省研究生教育创新计划项目(SDYY11083,SDYC12048)共同资助

    分类号: S917.4

    DOI: 10.13417/j.gab.038.003946

    页码: 3946-3951

    总页数: 6

    文件大小: 2413K

    下载量: 106

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