导读:本文包含了引物筛选论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:引物,标记,钱塘江,西昌,叶绿体,玉米,体系。
引物筛选论文文献综述
张智,俞丹,刘飞,刘焕章[1]（2019）在《西昌华吸鳅的微卫星引物筛选及赤水河四个地理种群的遗传多样性分析》一文中研究指出采用高通量测序法对西昌华吸鳅(Sinogastromyzon sichangensis)基因组进行随机测序并筛选出符合条件的微卫星位点,设计可用于PCR扩增的引物,筛选出29对具有多态性的引物,平均等位基因数为14.5,观测杂合度(H_o)和期望杂合度(H_e)分别为0.620和0.882,多态信息含量(PIC)为0.859。选取其中多态性较高的20对引物在赤水河及其支流的4个地理种群中进行扩增,分析不同地理种群的遗传多样性和种群分化情况。结果表明,赤水镇种群观测杂合度最高(0.669),茅台镇种群观测杂合度最低(0.520);习水河多态信息含量最高(0.868),茅台镇种群多态信息含量最低(0.841)。赤水河干流的几个种群未出现显着分化,而习水河种群与其他3个种群的遗传分化程度较高。AMOVA分析显示遗传变异主要发生在群体内,群体间遗传变异仅占3.33%,群体内遗传变异占96.67%。种群遗传结构分析表明,赤水河干流整体遗传背景趋于一致,而习水河种群则单独聚为一个亚类群。研究为西昌华吸鳅的资源保护和种群遗传学研究提供了基础资料。(本文来源于《水生生物学报》期刊2019年06期）
张丽华,韩浩章,王晓立,李素华,王芳[2]（2019）在《香樟SRAP分子标记引物筛选》一文中研究指出以香樟嫩叶为试验材料,采用SRAP-PCR分子标记体系对420对引物组合进行了筛选。结果表明:共选出19对引物组合,扩增出367条带,平均19.3条,范围在15～25条。其中,多态性带230条,平均12.11条,范围在6～17条;多态性的比例62.16%,范围在40%～81%。SRAP-PCR分子标记体系稳定,筛选出的引物组合可用于不同种源香樟遗传多样性及品种鉴定的研究。(本文来源于《安徽农学通报》期刊2019年20期）
周俐宏,石慧,王志刚,蔡忠杰[3]（2019）在《百合荧光SSR标记体系构建及引物筛选》一文中研究指出为了确定百合荧光SSR-PCR反应的最佳体系,对反应体系和程序中的模板DNA、酶量和退火温度进行了优化筛选。结果表明,适用于百合的荧光SSR-PCR反应体系为:总体系为20μl,10×PCR buffer(Mg~(2+))2μl,2.5 mM dNTP 1μl,正、反引物各0.5μl,模板DNA 40 ng,Taq酶1 U,用ddH_2O补足。反应程序为:94℃预变性5 min,94℃(30 s)/58℃(45 s)/72℃(45 s)35个循环,最后72℃延伸10 min。利用优化后的反应体系对百合SSR引物进行筛选,从50对引物中筛选出6对多态性高的SSR引物,并通过合成荧光标记引物对77个百合品(野生)种进行复选,验证了6对引物的稳定性。该研究为百合的遗传多样性分析、分子标记辅助育种等方面的进一步研究提供了技术支持。(本文来源于《辽宁农业科学》期刊2019年05期）
张爱菊,郝雅宾,郭爱环,刘金殿,练青平[4]（2019）在《基于高通量测序技术的鱼类环境DNA研究中通用引物的筛选验证》一文中研究指出为了筛选出一个或多个适宜研究环境DNA(environmental DNA,eDNA)的鱼类通用引物,本实验选取了5对引物,分别对鱼类线粒体细胞色素b(Cytochrome b,Cyt b)基因、16S rDNA和细胞色素c氧化酶Ⅰ(COⅠ)基因部分片段进行扩增。在对两个水样eDNA进行扩增后发现,引物CY45M和1634M均扩增出目的条带,且扩增产物质量适用于后续的高通量测序,而引物CYFM、16ACM和COⅠM均没有扩增出目的条带。继续对另外7个水样eDNA扩增后发现,引物CY45M和1634M在所有水样eDNA中均取得良好的扩增效果。对目的产物进行Illumina Miseq测序后发现,引物CY45M和1634M扩增产物注释上的鱼类物种均为11种,二者获得的鱼类种类既存在差异也存在重复。综上所述,引物CY45M和1634M都可作为鱼类群落结构eDNA研究的通用引物。(本文来源于《浙江农业学报》期刊2019年10期）
江毅,姜立娜,周俊国[5]（2019）在《南瓜MSAP体系的优化及引物筛选》一文中研究指出以南瓜自交系北观(Cucurbita maxima)为材料,利用正交设计L16(45)优化南瓜MSAP预扩增和选择性扩增体系的主要因素。结果表明,第一步最佳酶切时间2 h,HapⅡ(HpaⅡ,MspⅠ)用量0.5μL;第二步酶切时间6 h,Eco RⅠ用量0.4μL;连接体系包括酶切产物21μL,Eco RⅠ接头(5μmol·L-1)、HapⅡ接头(5μmol·L-1)各1.0μL,连接时间12h,T4 DNA Ligase用量为0.5μL;最佳预扩增反应体系(25μL)包含2.0μL连接产物,1.5μL 10×PCR Buffer(Mg2+plus),2.0μL dNTP(2.5 mmol·L-1),0.6μL Taq酶(5 U·μL-1),0.4μL上下游引物(10μmol·L-1);最佳选择性扩增反应体系为预扩增产物稀释120倍的模板4.0μL,其他同预扩增体系。最后,利用建立好的MSAP体系进行6%聚丙烯酰胺凝胶电泳验证并筛选出适于南瓜MSAP分析的36对引物,表明优化后的MSAP体系多态性好,体系稳定,可重复,为后续进行南瓜MSAP分析奠定了基础。(本文来源于《中国蔬菜》期刊2019年09期）
李超,孙玉萍,杨英,郑贺云,陈伟[6]（2019）在《厚皮甜瓜品种组合种子纯度鉴定SSR引物的筛选》一文中研究指出为了筛选适合鉴定甜瓜种子纯度的SSR标记,本研究以18份厚皮甜瓜品种组合为研究材料,从73对SSR (Simple sequence repeats)引物中筛选出适合各自品种纯度鉴定的SSR引物,并结合大田传统鉴定方法对其种子纯度进行了对比分析。结果表明,适合‘西州密1号’、‘西州密3号’、‘西州密25号’、‘西州密17号’、‘西州密21号’和‘西州密29号’种子纯度鉴定的具有双显性且条带清晰SSR引物分别有4对、4对、10对、9对、3对和2对;引物MU5499可作为以上品种纯度鉴定的通用引物。选择引物C30用于‘西州密25号’F1代种子纯度鉴定,使用该标记共检测191株,其中4株为异株,种子纯度为97.91%。试验用的‘西州密25号’种子田间鉴定纯度为98.99%,鉴定结果与SSR标记鉴定结果一致。SSR分子标记方法更能准确鉴别出甜瓜杂种一代中的不纯株,且大大缩短纯度鉴定周期,为西州密系列甜瓜杂交种纯度室内快速检测提供技术支撑。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年16期）
王世杰,王雪婷,杜向前,陈洪刚,张会恰[7]（2019）在《基于SSR标记的杨树新品种鉴定及核心引物筛选》一文中研究指出【目的】利用经过长期筛选的11对SSR引物对50份杨树新品种(系)进行扩增,探究11对引物的品种鉴定能力和核心引物的筛选依据,为杨树新品种的鉴定、育种工作和核心引物的筛选工作奠定基础。【方法】使用毛细管电泳技术对扩增结果进行检测,计算等位重复序列数、Shannon信息指数和引物多态性信息指数等。按0/1矩阵记录扩增条带的有无,并通过非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析。计算单个引物和11对引物组合的遗传相似系数,分析遗传相似系数之间的相关性,剔除相关性较低的引物,再对剩余的引物组合进行聚类分析。【结果】11对引物共扩增出122个DNA片段,平均每对引物扩增的等位重复序列数为11.091个;不同引物PIC值的变化范围是0.530～0.908,平均值为0.803。11对引物的聚类结果显示,当支距为0.40时,参试样品可以分为2个大类;当支距为0.37时,可分为4个亚类,聚类结果与品种(系)的谱系来源基本吻合。在11对现有引物的基础上,通过分析单个引物和11对引物的遗传相似系数之间的相关性,优化得到9对核心引物。相关性分析和聚类分析表明,优化后的9对引物具有高效鉴定能力和亲缘关系聚类效果。【结论】本研究证实SSR分子标记可以有效鉴定杨树新品种,并较好反映品种之间的亲缘关系;同时,利用遗传相似系数的相关性可优化现有的引物,为杨树的育种及核心引物的筛选工作提供了参考。(本文来源于《北京林业大学学报》期刊2019年07期）
代玉立,甘林,阮宏椿,杨静民,石妞妞[8]（2019）在《福建省玉米大斑病菌ISSR-PCR反应体系的优化和引物的筛选》一文中研究指出【目的】明确适用于福建省玉米大斑病菌ISSR分子标记的反应体系和引物。【方法】采用单因素水平优化法对ISSR-PCR扩增反应中的Taq聚合酶用量、dNTPs浓度、Mg~(2+)浓度、模板DNA浓度、PCR反应循环数以及引物的最佳退火温度等重要参数进行优化。【结果】适合福建省玉米大斑病菌群体遗传多样性分析的ISSR-PCR反应体系(25μL)为:Taq聚合酶0.55 U、dNTPs 0.30 mmol·L~(-1)、Mg~(2+) 1.30 mmol·L~(-1)、DNA模板100 ng、引物10 pmol。ISSR-PCR扩增程序为:94℃预变性4 min;94℃变性45 s,51.2～56.0℃退火45 s,72℃延伸1.5 min,35个循环;72℃延伸10 min。利用优化的反应体系从56条ISSR引物中筛选出稳定性好、多态性高的引物10条:UBC117、UBC118、UBC808、UBC835、UBC847、UBC855、UBC856、UBC857、UBC866和UBC887,其最佳退火温度分别为55.6、53.1、51.2、51.2、56.0、53.1、53.1、51.2、51.2和51.2℃。利用优化的ISSR-PCR反应体系对21株供试菌株进行PCR扩增,结果表明,相同地理来源以及不同地理来源菌株间的DNA多态性均不同,表明福建省玉米大斑病菌群体存在丰富的遗传多样性。【结论】本研究优化的ISSR-PCR反应体系和筛选的引物可用于福建省玉米大斑病菌群体遗传多样性和遗传结构的研究。(本文来源于《福建农业学报》期刊2019年07期）
马晓辉,晋玲,朱田田[9]（2019）在《中麻黄叶绿体DNA序列不同引物扩增条件的筛选》一文中研究指出目的:对16个不同居群的中麻黄从23对叶绿体编码区及非编码区DNA片段中筛选具有变异的叶绿体DNA片段。方法:通过试剂盒法提取DNA并梯度优化筛选扩增条件,PCR扩增产物经生物工程有限公司测序获得产物序列。结果:引物[trnS(GCU)-trnG(UCC)、atpB-rbcL、psbA-trnH、F71-R1516]能扩增出清晰、单一的条带。结论:16个不同居群中30个麻黄个体的叶绿体DNA扩增成功,初步筛选出具有变异的叶绿体DNA片段F71-R1516。(本文来源于《中兽医医药杂志》期刊2019年03期）
安佰义,王迦,王嫚,于慧颖,范爱淇[10]（2019）在《李种质资源ISSR反应体系引物筛选》一文中研究指出以李18个品种种质资源为试验材料,对其开展ISSR反应体系引物筛选,结果表明,从41个随机引物中筛选出25个多态性引物用于PCR扩增,每个多态性引物扩增出的条带数在8～23条之间,扩增出的DNA片段长度大多在150～2 400 bp之间;共扩增出条带数为385条,其中,样品间相同的条带数有53条;所选引物的多态位点百分率为86.23%。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年10期）
引物筛选论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
以香樟嫩叶为试验材料,采用SRAP-PCR分子标记体系对420对引物组合进行了筛选。结果表明:共选出19对引物组合,扩增出367条带,平均19.3条,范围在15～25条。其中,多态性带230条,平均12.11条,范围在6～17条;多态性的比例62.16%,范围在40%～81%。SRAP-PCR分子标记体系稳定,筛选出的引物组合可用于不同种源香樟遗传多样性及品种鉴定的研究。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
引物筛选论文参考文献
[1].张智,俞丹,刘飞,刘焕章.西昌华吸鳅的微卫星引物筛选及赤水河四个地理种群的遗传多样性分析[J].水生生物学报.2019
[2].张丽华,韩浩章,王晓立,李素华,王芳.香樟SRAP分子标记引物筛选[J].安徽农学通报.2019
[3].周俐宏,石慧,王志刚,蔡忠杰.百合荧光SSR标记体系构建及引物筛选[J].辽宁农业科学.2019
[4].张爱菊,郝雅宾,郭爱环,刘金殿,练青平.基于高通量测序技术的鱼类环境DNA研究中通用引物的筛选验证[J].浙江农业学报.2019
[5].江毅,姜立娜,周俊国.南瓜MSAP体系的优化及引物筛选[J].中国蔬菜.2019
[6].李超,孙玉萍,杨英,郑贺云,陈伟.厚皮甜瓜品种组合种子纯度鉴定SSR引物的筛选[J].分子植物育种.2019
[7].王世杰,王雪婷,杜向前,陈洪刚,张会恰.基于SSR标记的杨树新品种鉴定及核心引物筛选[J].北京林业大学学报.2019
[8].代玉立,甘林,阮宏椿,杨静民,石妞妞.福建省玉米大斑病菌ISSR-PCR反应体系的优化和引物的筛选[J].福建农业学报.2019
[9].马晓辉,晋玲,朱田田.中麻黄叶绿体DNA序列不同引物扩增条件的筛选[J].中兽医医药杂志.2019
[10].安佰义,王迦,王嫚,于慧颖,范爱淇.李种质资源ISSR反应体系引物筛选[J].江苏农业科学.2019
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