导读:本文包含了序列分析技术论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:序列,时间,条形码,多维,技术,宏基,湘西。
序列分析技术论文文献综述
张伟铮,关文苑,李松,赵婵静,邓光远[1]（2019）在《ITS序列分析与MALDI-TOF MS质谱技术在丝状真菌鉴定中的应用》一文中研究指出丝状真菌常用的鉴定方法为形态方法和基因鉴定方法,前者限于检验人员的知识和技能,后者操作繁琐,费用略昂贵,不适合常规开展。因此,寻找丝状真菌快速鉴定方法势在必行。本文采用VITEK MALDI-TOF MS(基质辅助激光解析电离时间飞行质谱)IVD数据库(3.0版本)对临床分离的254株丝状真菌进行鉴定,并以ITS(internal transcribed spacer内转录间隔区)序列分析为标准,验证MALDI-TOF MS质谱技术鉴定丝状真菌的准确性。结果表明MALDI-TOFMS质谱技术可以对大部分丝状真菌实现快速、准确的鉴定,其中对毛癣菌属(100%)、毛孢子菌属(100%)、毛霉菌属(100%)、曲霉菌属(96.5%)准确率很高,对犬小孢子菌(75%)、镰刀菌属(50%)、新月弯孢霉(46.2%)准确率较低,对丝状真菌鉴定的总体准确率为86.36%,与ITS测序分析符合率为83.97%。(本文来源于《菌物学报》期刊2019年08期）
董碧麟,刘伟,陈瑶,童中胜,李东升[2]（2019）在《ITS/CHS1靶位序列分析结合SRAP分子标记技术鉴定Nannizzia incurvata临床分离株》一文中研究指出以转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和几丁质合成酶1(chitinase synthase 1,CHS1)为鉴定靶位,结合种系进化分析将2007年至2016年分离自头癣或面癣患儿的12株石膏样小孢子菌复合体成员(现被归入Nannizzia菌属)鉴定到种水平,其中5株为Nannizzia gypsea(Microsporum gypseum),另7株为Nannizzia incurvata(Microsporum incurvatum)。在此基础上,通过序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记进一步证实二者在DNA多位点存在扩增多态性。本研究证实在我国湖北地区存在Nannizzia incurvata,为我国开展Nannizzia菌属的分子流行病学研究提供了实验室依据和支持。(本文来源于《菌物学报》期刊2019年08期）
李敏[3]（2019）在《柑橘鳞皮病毒RT-LAMP检测技术研究及其全基因组序列分析》一文中研究指出柑橘是世界上种植最广泛的水果之一,中国是主要的柑橘生产国,面积和产量均居世界第一。柑橘鳞皮病毒(Citrus psorosis virus,CPsV)引起的柑橘鳞皮病是一种世界性分布的病毒类病害,主要通过嫁接进行传播。CPsV是蛇形病毒属典型的种,是叁分体负单链RNA病毒。CPsV具有两种类型鳞皮病A和鳞皮病B,其中鳞皮病A比较常见,其引起的典型症状为:嫩叶叶脉间出现褪绿斑纹,主干树皮出现鳞片状开裂;鳞皮病B会引起更严重的症状,嫩叶出现橡形叶症状,老叶出现环斑症状,主干和嫰枝出现鳞片状开裂,但是感染鳞皮病A的柑橘植株可以保护植株在次感染鳞皮病B时,不出现鳞皮病B的症状。目前已经公布了一组CPsV的基因组序列,为西班牙的P-121株系。本研究根据NCBI数据库中CPsV外壳蛋白(Coat protein,CP)的基因序列设计了4组特异性检测引物,通过一系列反应条件的优化,筛选并获得1组特异性的检测引物。以感染CPsV的柑橘叶片总RNA为模板,采用一步法RT-LAMP(One-step reverse transcription loop-mediated isothermal amplification),在60℃下反应60 min,扩增产物利用琼脂糖电泳分析,同时对其特异性和灵敏度进行测定。结果表明,建立的RT-LAMP检测体系能特异性扩增CPsV,灵敏度为RT-PCR的10倍。用建立的RT-LAMP方法对258个田间样品进行检测,发现5个样品感染了CPsV,其检测结果与RT-PCR法一致。RT-LAMP法具有灵敏度高、特异性强、操作简单、反应快速等特点,适合对CPsV样品的快速检测与鉴定。运用转录组测序、RT-PCR和RACE验证,获得了CPsV的5个分离物CHN-1、CHN-2、CHN-3、CHN-HN和CHN-UN21的全基因组。序列分析结果表明,CHN-1、CHN-2、CHN-3、CHN-HN和CHN-UN21的基因组全长大小分别为11282 nt、11279nt、11278 nt、11283 nt和11305 nt,均包含4个开放阅读框。CHN-1、CHN-2、CHN-3、CHN-HN和CHN-UN21之间的MP基因的核苷酸相似性为80.78%~99.37%,编码氨基酸相似性为90.55%~99.16%;与国外CPsV分离物的MP基因核苷酸序列相似性为80.78%~99.79%,其对应氨基酸序列相似性为89.71%~99.58%。CHN-1、CHN-2、CHN-3、CHN-HN和CHN-UN21之间的CP基因的核苷酸相似性为81.44%~99.02%,编码的氨基酸相似性为88.38%~99.32%;与国外CPsV分离物的CP基因核苷酸序列相似性为81.29%~100.00%,其对应氨基酸序列相似性为88.38%~100.00%。基于MP基因和CP基因的系统进化分析显示CHN-1、CHN-2、CHN-3和CHN-HN聚为一簇,CHN-UN21单独聚为一簇。通过序列分析发现CHN-3和CHN-UN21的序列存在较大差异,由于没有CHN-3和CHN-UN21单独侵染的柑橘苗木,为了验证二者是不是在症状上也存在差异,将CHN-3和CHN-UN21的MP基因24 k基因克隆至表达载体TRV中,侵染本氏烟观察症状差异。结果表明,二者在本氏烟上的侵染症状相似,均表现为叶片出现轻微皱缩症状。(本文来源于《西南大学》期刊2019-05-21）
刘山林[4]（2019）在《DNA条形码参考数据集构建和序列分析相关的新兴技术》一文中研究指出近年来DNA条形码技术迅速发展,产生的条形码的数量及其应用范围都呈指数性增长,现已广泛用于物种鉴定、食性分析、生物多样性评估等方面。本文重点总结并讨论了构建条形码参考数据库和序列聚类相关的信息分析的技术和方法,包括:基于高通量测序(high throughput sequencing, HTS)平台以高效并较低的成本获取条形码序列的方法;同时还介绍了从原始测序序列到分类操作单元(operational taxonomic units, OTUs)过程中的一些计算逻辑以及被广泛采用的软件和技术。这是一个较新并快速发展的领域,我们希望本文能为读者提供一个梗概,了解DNA条形码技术在生物多样性研究应用中的方法和手段。(本文来源于《生物多样性》期刊2019年05期）
杨静波,刘龙,王江峰[5]（2019）在《应用mtDNA序列分析技术鉴定嗜尸性蝇类种属的研究进展》一文中研究指出随着法医昆虫学的不断发展,应用嗜尸性昆虫的生长发育规律和尸体上昆虫演替规律推断死亡时间成为可能,但这要求快速、准确地鉴别嗜尸性昆虫的种属,然而,办案人员通常无法从形态上鉴别昆虫幼虫的种属,而对成虫的形态学种属鉴定知识也往往所知甚少,因此限制了相关技术在案件侦破中的广泛应用。自1994年sperling利用mtDNA序列分析方法进行种属鉴定以来,国内外许多研究者在此基础上进行了大量的尝试与探索,特别是近十几年,国内研究者在借鉴国外研究成果的基础上,在全国不同地域采集蝇类标本进行序列分析研究,在提取方法、基因片段种属鉴定效果、种属鉴定应用等方面取得了较大的研究成果。本文试图对国内近几年的研究进行总结,从而为后续研究提供参考。(本文来源于《刑事技术》期刊2019年01期）
张玉山,邱志涛[6]（2018）在《基于“操作序列分析”的湘西制陶技术研究》一文中研究指出新技术因素的引进削弱了湘西传统制陶过程中陶工们之间的关系,尤其是传统制陶术与现代技术的妥协与融合。本文采用人类学"操作序列分析"研究法来探究湘西陶工们采用和拒绝新的制陶技术的过程、方法和策略。从宏观和微观层面解释与湘西手工艺有关的制陶技术和知识,有助于我们对非遗手工艺的研究。(本文来源于《南京艺术学院学报(美术与设计)》期刊2018年03期）
陈海英[7]（2018）在《非线性时间序列分析的关键技术及其应用探讨》一文中研究指出在教学的过程中非线性时间序列问题一直是重中之重,作为近几年发展的主要趋势,非线性时间序列包括有地理、生物、医学以及经济等多个领域的内容,并有着十分广泛的发展前景,目前已经经过了很多实验与理论,能够证明非线性混沌的数据,本文就对非线性时间序列分析的关键技术及其应用进行分析。(本文来源于《环渤海经济了望》期刊2018年02期）
李亚萌[8]（2017）在《面向Android的YAFFS2数据恢复技术和时间序列分析的研究与实现》一文中研究指出随着当今移动技术的快速发展,智能终端在方便人们生活的同时也存在着一安全问题。一些不法分子开始利用智能终端传递信息进行违法犯罪,也因此对智能终端中数据的获取变得尤为重要。智能终端取证就是对智能终端中信息进行提取、分析、取证,进而获得数字证据的过程。而在智能终端取证过程中,对终端设备中的数据提取面临着很多问题和挑战,终端中的数据会被删除、修改,进而无法提取到有效的证据信息以及证据的时间序列,所以对智能终端中数据恢复技术和时间序列的研究很有必要。由于Android具有极大的市场占有率,其用户使用率很大,并且Android系统是开源的嵌入式操作系统这两个特点,所以选择Android系统作为研究的智能终端系统。而YAFFS2文件系统是当前Android系统中应用最为广泛的系统,所以本文以Android中的YAFFS2文件系统作为研究对象,研究对该文件系统下的数据恢复技术和时间序列分析方法。论文首先通过总结国内外对于数据恢复技术研究和时间序列分析方法的发展状况,分析当前Android取证技术和Android系统下不同类型文件系统的特点特别是YAFFS2文件系统。并依据YAFFS2文件系统的特点,提出了基于Hash链表对数据多版本恢复算法和基于时间戳的时间序列构建方法。同时,针对文件系统中存在缺失数据现象的问题进行分析,提出缺失有效的对象头块和数据块的恢复思路,并在Hash链表对数据多版本恢复算法基础上添加了对缺失数据的文件恢复算法。然后,论文通过对基于Hash链表和时间戳的数据多版本恢复算法和缺失数据的文件恢复算法分别进行两种类型的数据恢复实验,并通过和yaffs2img软件来对比数据的恢复效果,进而评估算法的有效性。最后,基于所研究的算法将其应用于实际,设计并实现了基于算法的Android镜像文件恢复和数据分析系统。并且总结了智能终端取证中的数据文件恢复技术和时间序列分析方法在后续研究中将要面对的机遇和挑战。(本文来源于《北京工业大学》期刊2017-06-01）
常伟[9]（2017）在《基于时间序列分析的行为识别技术研究》一文中研究指出当今人体行为识别的应用已经延伸到社会的各个方面,尤其是在运动分析、公共场所的安全监测、虚拟现实的实现等方面应用十分广泛,为很多行业的发展带来有利的契机。因此,人体行为识别技术的研究理所当然地活跃在科学研究领域,成为研究热点。尽管目前已经有多种多样的行为识别算法被提出,但是由于人体动作的复杂性,人体行为识别技术仍然存在不足。本文主要针对人体行为识别方法中时序信息缺失的问题,对基于视频序列的人体动作识别展开了研究,本文的主要内容包括:(1)为了克服外在因素对行为识别结果造成干扰,本文对提取到的特征进行了统一化。3D骨架坐标特征对行为识别起到了很重要的作用,但是原始的坐标数据对于行为识别不具有鲁棒性,很容易受到尺度、角度以及活动区域的影响,造成错误的识别。本文为解决这一问题,对坐标数据进行了中心点统一化、尺度统一化以及角度统一化的转变,使得坐标特征具有尺度不变性和旋转不变性,通过实验分析也证实了其具有更好的鲁棒性。(2)为了克服单一特征造成的识别局限性,本文采用多特征融合的方法。骨架特征有很多种,两点间距离、线线夹角、线面夹角、线线方向等等,过多的特征会造成冗余,但单一特征又不能很好地表达运动信息,所以正确的行为识别需要合理的特征融合。本文为解决这一问题,对多种骨架特征进行实验和分析,对能够更好表达运动信息的特征进行融合。(3)为了克服时间信息缺失的问题,本文采用了时序分析的稀疏表示算法作为多维时序建模方法。虽然现存的底层特征能够较好地表达人体动作信息,但对于视频中运动的人体来说,时间信息是具有区分力的很重要的信息,因为人体运动视频本身就是在时间轴上帧的改变和运动。本文为解决这一问题,对时序进行分析,采用加入监督时序混乱的正则项来抑制运动时间上的错误,使得传统的稀疏编码转变为能够处理包含运动信息的多维时序建模方法。通过实验验证了时序信息对稀疏系数重要的影响,以及对分类正确率的提高。(4)为了有效而简单地实现行为的正确分类识别,本文采用匹配误差最小策略。现存的行为分类方法有很多,比如支持向量机、K-近邻等等,但匹配误差最小策略原理较简单,实现较容易,且实验结果理想,因此本文采用此决策方法。实验运行的硬件设备和软件平台由中科院自动化所提供,实验进行于Linux操作系统和Matlab2015b开发平台下。通过在UTKinect和Florence3D这两个RGB-D行为识别数据库上,以及人为模拟数据集上的实验,证实了本文算法对于提高行为分类结果的有效性。(本文来源于《青岛科技大学》期刊2017-04-20）
吴双[10]（2017）在《基于时间序列分析的木马网络会话检测技术研究》一文中研究指出近年来,网络攻击急速增长,木马作为一种持续、隐蔽盗窃数据的恶意软件,在攻击者中收到了广泛欢迎。一旦在系统中完成安装,木马很难被发现。几乎每年都有隐蔽多年的新木马变种曝光。为了预防这种攻击,入侵检测系统和其改进版本被提出,但现有系统多使用基于特征的检测技术,恶意软件可以通过混淆、变形来规避检测。近年来,基于网络流量的分析技术显示出高效性和低占用率,机器学习的算法在其中发挥着重要的作用。然而针对木马网络行为识别这一应用,目前的研究较少考虑流量的时间序列性,且样本不平衡对分类有一定影响,对于木马的识别率较低,较少用于工业部署。本文从流量的时序进行分析,发现具有通用性的木马外部控制特性,从而据此提出基于时间序列分析的木马网络会话检测模型。通过时间聚合分离出应用程序的交互行为,将频繁序列挖掘算法应用于心跳检测,最后通过朴素贝叶斯分析验证交互序列是否属于木马或正常应用。该方法在一定的时间尺度内具有稳定性,可检测处于交互行为初期的木马。将该方法应用于现实网络数据集,可有效检测木马的外部控制行为,且具有较低的误报。本文完成的主要工作如下:首先,剖析木马的网络会话过程,分析了木马检测的研究现状,研究现有针对木马隐蔽特性的网络流量检测的方法,说明现阶段研究中主要使用的机器学习的方法的局限性。对于网络会话过程,重点研究交互操作阶段和连接维持阶段,从序列性角度直观说明木马与正常通信的区别。其次,提出基于时间序列切片的上传下载序列模式分析方法。将会话流按时间序列聚合切片,统计切片上传下载序列模式,统计结果随时间收敛。应用机器学习中的贝叶斯分析,切片序列的宏观特性可有效表征其外部控制特点。该方法充分考虑了流量的相关性和时间序列特性,具有时间稳定性,不需要采集完整流量,流量的截断对结果影响较小。然后,将频繁序列挖掘算法应用于心跳检测。在经过时间聚合切片处理的切片序列中搜索重复出现的包序列模式,可有效检测应用程序心跳。心跳机制是木马和正常应用程序都可能具有的网络行为。过滤流量序列中的心跳噪声,然后对所得序列切片进行贝叶斯分析,可有效区分木马通信和正常通信。最后,设计实现了木马网络会话行为检测系统,并测试了系统的准确性和时间稳定性。将系统应用于网络公开流量数据集,测试结果显示该系统可有效的检测出具有外部控制行为的木马,且具有较低误报。使用现实网络关口截获的流量数据进行测试,验证方法具有可行性,可确实捕获木马通信流量。所得数据可直观反映木马操作行为特征,实用性较好。(本文来源于《解放军信息工程大学》期刊2017-04-20）
序列分析技术论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
以转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和几丁质合成酶1(chitinase synthase 1,CHS1)为鉴定靶位,结合种系进化分析将2007年至2016年分离自头癣或面癣患儿的12株石膏样小孢子菌复合体成员(现被归入Nannizzia菌属)鉴定到种水平,其中5株为Nannizzia gypsea(Microsporum gypseum),另7株为Nannizzia incurvata(Microsporum incurvatum)。在此基础上,通过序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记进一步证实二者在DNA多位点存在扩增多态性。本研究证实在我国湖北地区存在Nannizzia incurvata,为我国开展Nannizzia菌属的分子流行病学研究提供了实验室依据和支持。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
序列分析技术论文参考文献
[1].张伟铮,关文苑,李松,赵婵静,邓光远.ITS序列分析与MALDI-TOFMS质谱技术在丝状真菌鉴定中的应用[J].菌物学报.2019
[2].董碧麟,刘伟,陈瑶,童中胜,李东升.ITS/CHS1靶位序列分析结合SRAP分子标记技术鉴定Nannizziaincurvata临床分离株[J].菌物学报.2019
[3].李敏.柑橘鳞皮病毒RT-LAMP检测技术研究及其全基因组序列分析[D].西南大学.2019
[4].刘山林.DNA条形码参考数据集构建和序列分析相关的新兴技术[J].生物多样性.2019
[5].杨静波,刘龙,王江峰.应用mtDNA序列分析技术鉴定嗜尸性蝇类种属的研究进展[J].刑事技术.2019
[6].张玉山,邱志涛.基于“操作序列分析”的湘西制陶技术研究[J].南京艺术学院学报(美术与设计).2018
[7].陈海英.非线性时间序列分析的关键技术及其应用探讨[J].环渤海经济了望.2018
[8].李亚萌.面向Android的YAFFS2数据恢复技术和时间序列分析的研究与实现[D].北京工业大学.2017
[9].常伟.基于时间序列分析的行为识别技术研究[D].青岛科技大学.2017
[10].吴双.基于时间序列分析的木马网络会话检测技术研究[D].解放军信息工程大学.2017
论文知识图
