中国CBAVD患者CFTR基因内含子10-11(TAAA)n短串联重复序列检测及意义

中国CBAVD患者CFTR基因内含子10-11(TAAA)n短串联重复序列检测及意义

论文摘要

目的囊性纤维化跨膜转导子基因(cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, CFTR, OMIM602421)突变可以导致先天性双侧输精管缺如(congenital bilateral absence of the vas deferens, CBAVD, OMIM 277180)的发生,既往研究证明:其内含子(IVS)10-11 (TAAA)n短串联重复序列(STR)是重要的顺式作用原件,可以与FOXI1转录因子结合,负向调节CFTR基因的表达,当其发生变异,尤其与启动子c.-165G>A联合时可以导致CBAVD的发生,IVS10-11 (TAAA)n STR在中国人群中的分布未见相关研究。本研究的目的是探讨中国CBAVD患者CFTR基因IVS10-11 (TAAA)n STR和启动子c.-165G>A的变异情况。方法对66例CBAVD患者CFTR基因IVS10-11 (TAAA)n STR行荧光标记引物PCR毛细管电泳检测及启动子ATG前方1.4kb序列进行测序,与60例正常人群及NCBI数据库CFTR基因序列在线比对。结果 66名CBAVD患者CFTR基因IVS10-11(TAAA)n基因型以(TAAA)9/(TAAA)10为主,约占50.00%(33/66),(TAAA)9/(TAAA)9基因型仅占21.21%(14/66),正常人群基因型则以(TAAA)9/(TAAA)9为主,约占78.33%(47/60),两组之间有显著的统计学差异(P<0.01);另外3种等位基因型(TAAA)10、(TAAA)11和(TAAA)12均只出现在CBAVD患者中。非条件logistic回归分析显示(TAAA)9/(TAAA)10基因型患CBAVD的风险是(TAAA)9/(TAAA)9基因型的9.22倍,如果出现(TAAA)10、(TAAA)11或(TAAA)12则患病风险会更高,CBAVD患者中均未发现启动子c.-165G>A变异。结论中国CBAVD患者CFTR基因IVS10-11(TAAA)n的基因型以(TAAA)9/(TAAA)10为主,与正常人群基因型(TAAA)9/(TAAA)9不同,且无与启动子c.-165G>A变异协同作用。

论文目录

  • 前言
  • 材料与方法
  •   一、标本收集
  •   二、外周血样本采集和DNA提取
  •   三、CFTR基因内含子10-11(TAAA)n荧光FAM标记引物,PCR扩增及PCR产物毛细管电泳法检测STR分子标记
  •   四、CFTR基因ATG转录起始前1.4kb启动子测序
  •   五、生物学信息来源和分析软件
  •   六、数据统计分析
  • 结果
  •   一、CFTR IVS10-11(TAAA)n,荧光FAM标记引物PCR毛细管电泳法检测结果
  •   二、IVS10-11(TAAA)n基因型的相对危险度
  • A变异结果'>  三、启动子c.-165G>A变异结果
  • 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 白松,吴斌

    关键词: 非编码区,内含子

    来源: 中国男科学杂志 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 泌尿科学

    单位: 中国医科大学附属盛京医院泌尿外科

    分类号: R697.25

    页码: 8-13

    总页数: 6

    文件大小: 1538K

    下载量: 55

    相关论文文献

    标签:;  ;  

    中国CBAVD患者CFTR基因内含子10-11(TAAA)n短串联重复序列检测及意义
    下载Doc文档

    猜你喜欢