鲫葡萄糖调节蛋白78基因部分序列的克隆、鉴定及功能预测

论文摘要

【目的】分析和预测鲫(Carassius auratus)葡萄糖调节蛋白78(Glucose regulated protein 78,GRP78)的功能,为研究GRP78在鱼类受细胞外刺激过程中的作用机制奠定基础。【方法】通过分子克隆技术获得鲫GRP78基因的部分序列,并利用生物信息学方法分析了该基因片段编码的蛋白质序列的二级结构、亲水性、可塑性、表面可及性和抗原表位。【结果】获得了长度为617bp的鲫GRP78基因片段序列,共编码113个氨基酸。这些氨基酸所构成序列的相对分子质量约为1.3kDa,等电点为5.82,无信号肽;可塑性区域位于第7～10位、第18～21位、第28～42位、第51～62位、第68～78位和第94～109位氨基酸残基;表面可及性区域位于第29～30位、第38～43位、第50～65位、第68～79位、第82～86位、第97～99位、第102～104位和第106～111位氨基酸残基;有1个B细胞抗原表位区域,位于第28～45位氨基酸残基。【结论】所获的鲫GRP78序列中含有ATPase保守结构域区段,该区段定位于内质网,具有较强亲水性。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料与试剂
•   1.2 基因组DNA的提取
•   1.3 GRP78基因片段的克隆和测序
•   1.4 生物信息学分析
• 2 结果
•   2.1 GRP78基因片段的特征分析
•   2.2 GRP78二级结构预测结果
•   2.3 GRP78亲水性、可塑性、表面可及性及抗原性预测结果
•   2.4 GRP78B细胞抗原表位的预测分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 刘小花,赵元莙,鄢彦杰,张金叶

关键词: 基因,生物信息学分析

来源: 重庆师范大学学报(自然科学版) 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 重庆师范大学生命科学学院动物生物学重庆市重点实验室

基金: 国家自然科学基金(No.31672280,No.31471980,No.31601845),重庆市基础与前沿研究项目(No.cstc2014jcyjA00006),重庆市教育委员会科学技术研究项目(No.KJ1400515)

分类号: Q78

页码: 19-24+2

总页数: 7

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