导读:本文包含了分子动力学模拟论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:动力学,分子,电场,糠醛,吡咯,力场,水溶液。
分子动力学模拟论文文献综述
梁栋,付中玉,孙康,徐震[1]（2019）在《水溶液中超高速纳米齿轮的分子动力学模拟》一文中研究指出本文根据在旋转电场的诱导下,悬浮于水溶液中的碳纳米管可以借助于水偶极子方向能够发生旋转这一原理提出一种超高速、易组装、摩擦力小的T型纳米马达转子,并在纳米马达转子的基础上设计出新型纳米齿轮传动系统。该纳米齿轮传动系统可应用于全部为水溶液或者部分为水溶液的工作环境。通过Gromacs软件仿真结果发现,调整旋转电场转速或者改变旋转电场场强可以减小纳米马达转子与水分子偶极之间的滞后角,使得纳米马达转子在最短时间内与旋转电场步调保持一致。该模拟仿真结果对于纳米齿轮的应用以及复杂机构纳米旋转设备的设计有着重要参考价值。(本文来源于《软件》期刊2019年12期）
付中玉,孙康,梁栋,徐震[2]（2019）在《水溶液中颗粒输送器的分子动力学模拟》一文中研究指出由于许多实际纳米颗粒的电荷和极性十分微弱甚至可以忽略不计,这阻碍了电场产生直接驱动纳米颗粒。基于在梯度电场诱导下的纳米颗粒可自发从电场强度高的位置迅速移动到电场强度低的位置这一原理,本课题使用不同斜率的垂直梯度电场驱动控制水溶液中纳米颗粒,实现纳米颗粒定向运动。根据分子动力学模拟结果得出当梯度电场斜率合适并且颗粒的大小与输送颗粒管道直径相匹配时,纳米颗粒可以达到较好的输送效果。该结果对于水溶液中分子马达、分子水泵、分子筛以及分子开关的设计有着重要的参考价值。(本文来源于《软件》期刊2019年12期）
马莹,王恬,张恒[3]（2019）在《氧化石墨烯吸附亚甲基蓝的分子动力学模拟》一文中研究指出采用分子动力学方法研究了亚甲基蓝在不同氧化度的氧化石墨烯表面的吸附行为及其动力学性质,从微观角度讨论了亚甲基蓝由体相到氧化石墨烯表面的吸附过程及主要作用机制,并通过亚甲基蓝分子动力学性质解释了氧化石墨烯的氧化度和含氧官能团类型对吸附行为的影响.结果表明,吸附过程中,亚甲基蓝主要受氧化石墨烯表面含氧官能团的静电作用,以近似垂直氧化石墨烯表面的方向进入,并以平行的方式吸附于氧化石墨烯表面;亚甲基蓝不易脱离高氧化度氧化石墨烯的吸附位点;吸附平衡过程中,相对于低氧化度的氧化石墨烯,高氧化度氧化石墨烯对亚甲基蓝的束缚性更强,同时与亚甲基蓝间相互作用更强;含氧官能团中的环氧基与亚甲基蓝间的作用势能更强,且羟基能够与亚甲基蓝间形成氢键结构,共同保障了亚甲基蓝吸附层的稳定性.(本文来源于《高等学校化学学报》期刊2019年12期）
冯炜,高红凤,刘婷,马琼,周慧[4]（2019）在《吡咯和吡啶燃烧的反应分子动力学模拟》一文中研究指出采用基于反应力场的分子动力学方法(ReaxFF)研究了吡咯和吡啶的燃烧反应机理。重点考察了不同温度下吡咯和吡啶的燃烧过程中反应物、产物和主要反应中间体的分子数量变化规律,基于动力学轨迹可视化地观察获得了吡咯和吡啶的燃烧反应机理。结果表明,温度是影响芳香氮化物燃烧的重要因素。在燃烧过程中,随着温度的升高,CO_2、H_2O和氮氧化物(NO_x)的生成速率逐渐加快,数量增多。随着反应的进行,CO_2和H_2O的生成量会逐渐趋于平衡,且达到平衡的时间随温度的升高而加快。吡咯和吡啶的分解速率都随着温度的升高不断增大。但在相同温度下,吡啶的分解时间比吡咯要长,分解速率比吡咯要低。两者燃烧产物、氧化过程中的含氮中间体相同,但热解开环方式、烃类自由基裂解路径明显不同。(本文来源于《石油学报(石油加工)》期刊2019年06期）
孔令云,罗万力[5]（2019）在《基于分子动力学模拟的乳化剂结构对乳化剂/集料表面传质的影响》一文中研究指出采用分子动力学方法研究了阴离子表面活性剂十二烷基苯磺酸钠(SDBS)及其4种异构体在集料主要化学成分碳酸钙固体表面的传质情况。模拟发现传质过程中十二烷基苯磺酸钠及其异构体能在短时间内吸附到CaCO_3表面,并逐渐形成聚集结构,该过程中Na离子在乳化剂极性头周围无聚集现象;计算得到的界面相互作(本文来源于《第十届国际（中国）功能材料及其应用学术会议、第六届国际多功能材料与结构学术大会、首届国际新材料前沿发展大会摘要集》期刊2019-11-23）
裴宏杰,陈钰荧,付坤鹏,刘成石,王贵成[6]（2019）在《油酸与亚油酸在Fe(110)面上吸附和剪切的分子动力学模拟》一文中研究指出为了揭示植物油主要成分油酸和亚油酸对润滑作用的影响,采用分子动力学模拟的方法,对不同比例油酸和亚油酸在Fe(110)面上进行吸附和剪切计算。构建油酸、亚油酸和Fe模型,并对所构建模型进行几何优化,选择Fe(110)面为吸附面,定义了结合能,进行吸附计算得到不同比例油酸和亚油酸的结合能。构建四层的剪切模型,加载COMPASS力场,采用Forcite-Confined Shear模块进行剪切模拟,得到摩擦表面3个方向的力,进而计算出摩擦因数。结果表明:金属基底对油酸的吸附能比亚油酸大,剪切性比亚油酸好;虽然油酸比亚油酸的吸附性和剪切性更好,但吸附能和剪切性能并不是随着油酸含量的增加而增加,而是在油酸和亚油酸的体积比为3∶1时吸附能最大,剪切性能最好。(本文来源于《润滑与密封》期刊2019年11期）
潘振,朱孟兆,叶文郁,王伟龙,马骁壮[7]（2019）在《植物油中水分对糠醛扩散作用影响的分子动力学模拟》一文中研究指出糠醛含量是反映电力变压器油纸绝缘老化程度的重要参数,水分则是影响糠醛分子在油纸绝缘系统中扩散行为的重要因素,然而糠醛分子在不同含水量的植物油变压器中的微观扩散机理规律尚未明确。本文利用分子动力学方法,分别构建糠醛在无水、1%、3%、5%水分含量下的植物油模型并进行动力学模拟,研究分析糠醛的动力学轨迹、与介质的相互作用能和自由体积等参数,并与矿物油系统进行对比。结果表明:糠醛分子的动力学轨迹随着水分含量的增加表现出明显的空间松散性。植物油模型中,水分优先与植物油产生氢键,而糠醛与植物油之间氢键的含量较少。随着水分含量的增加,油纸绝缘系统中糠醛的扩散行为逐渐加强。(本文来源于《绝缘材料》期刊2019年11期）
崔晓林,陆峰[8]（2019）在《表面增强拉曼光谱法联合分子动力学模拟研究小分子及其适配体间的相互作用》一文中研究指出表面增强拉曼光谱法(SERS)因其快速、灵敏度高等优点近年来受到了人们的广泛关注。作为一种振动光谱技术,它能够提供待测物质详细的指纹图谱。其独特的纳米等离子体共振效应可以使检测到的信号增强10~6倍以上,为生物医药领域内检测核酸、蛋白质、药物分子等提供了强有力的工具,也成为研究分子间相互作用的热门选择。虽然分子间相互作用可以通过传统的SERS技术直接进行检测,分子发生作用前后的变化可以直接体现在SERS谱图上,但一般很难对图谱发生变化的分子机制进行解释。分子动力学(MD)模拟的引入可以弥补这方面的不足。它主要是利用计算机软件,依靠牛顿力学的基本原理,模拟分子间的相互作用和运动变化。它可以准确预测分子间的结合模式和结合能力,直观地展现分子发生相互作用的动态过程。通过MD模拟观察分子发生改变的位点,结合SERS谱图变化,对分子相互作用进行解释。本实验以小分子茶碱和其适配体RNA相互作用为例,验证该联合方法的可靠性。我们将适配体RNA以静电吸附的作用(I~--Mg~(2+)-PO_2~-)固定在银胶表面,然后引入茶碱,可以观察适配体RNA结合茶碱前后SERS谱图变化。同时,我们利用MD模拟茶碱和适配体RNA结合的过程,准确预测出结合茶碱前后,适配体RNA碱基C9、A10、G11、C20、C21、C22、U23、U24、G25构象发生了改变,这就解释了SERS谱图变化,并对茶碱和其适配体RNA结合分子机制进行解释。最后我们通过阴性对照实验以及生物膜干涉技术(BLI)验证了茶碱与其适配体RNA之间确实存在较高的亲和力。本文首次提出SERS+MD的模式来研究小分子和其适配体间的相互作用,为后续探索分子间相互作用提供新的思路。(本文来源于《第二十届全国光散射学术会议（CNCLS 20）论文摘要集》期刊2019-11-03）
曹茂启,王珏,罗骏,刘德见[9]（2019）在《基于蒙特卡洛分子动力学模拟的算法在天然产物小分子与蛋白质相互作用中的应用》一文中研究指出天然产物小分子与蛋白质相互作用的研究对于天然产物的功能研究有着非常重要的意义。作为一种快速而低成本的手段,基于分子动力学模拟的方法正在受到越来越多的重视,而基于蒙特卡洛分子动力学模拟的算法是其典型的代表。本文详细的阐述了基于蒙特卡洛分子动力学模拟的算法在天然产物小分子与蛋白质相互作用中的应用。(本文来源于《广东化工》期刊2019年20期）
郭梦茜,方泽辉,曹颖,李全利[10]（2019）在《仿生釉原蛋白和非釉原蛋白的多肽设计及其分子动力学模拟》一文中研究指出目的:釉原蛋白与非釉原蛋白在牙釉质发育过程中发挥调控作用,本研究设计改性富亮氨酸釉原蛋白多肽(LRAP)仿生釉原蛋白,酸性小分子多肽仿生非釉原蛋白,采用分子动力学模拟两者的相互作用及结合方式,以期阐明两者结合机理。材料和方法:首先设计仿生多肽,富亮氨酸釉原蛋白多肽(Leu-(本文来源于《2019年中华口腔医学会口腔材料专业委员会第十四次全国口腔材料学术年会论文集》期刊2019-10-29）
分子动力学模拟论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
由于许多实际纳米颗粒的电荷和极性十分微弱甚至可以忽略不计,这阻碍了电场产生直接驱动纳米颗粒。基于在梯度电场诱导下的纳米颗粒可自发从电场强度高的位置迅速移动到电场强度低的位置这一原理,本课题使用不同斜率的垂直梯度电场驱动控制水溶液中纳米颗粒,实现纳米颗粒定向运动。根据分子动力学模拟结果得出当梯度电场斜率合适并且颗粒的大小与输送颗粒管道直径相匹配时,纳米颗粒可以达到较好的输送效果。该结果对于水溶液中分子马达、分子水泵、分子筛以及分子开关的设计有着重要的参考价值。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
分子动力学模拟论文参考文献
[1].梁栋,付中玉,孙康,徐震.水溶液中超高速纳米齿轮的分子动力学模拟[J].软件.2019
[2].付中玉,孙康,梁栋,徐震.水溶液中颗粒输送器的分子动力学模拟[J].软件.2019
[3].马莹,王恬,张恒.氧化石墨烯吸附亚甲基蓝的分子动力学模拟[J].高等学校化学学报.2019
[4].冯炜,高红凤,刘婷,马琼,周慧.吡咯和吡啶燃烧的反应分子动力学模拟[J].石油学报(石油加工).2019
[5].孔令云,罗万力.基于分子动力学模拟的乳化剂结构对乳化剂/集料表面传质的影响[C].第十届国际（中国）功能材料及其应用学术会议、第六届国际多功能材料与结构学术大会、首届国际新材料前沿发展大会摘要集.2019
[6].裴宏杰,陈钰荧,付坤鹏,刘成石,王贵成.油酸与亚油酸在Fe(110)面上吸附和剪切的分子动力学模拟[J].润滑与密封.2019
[7].潘振,朱孟兆,叶文郁,王伟龙,马骁壮.植物油中水分对糠醛扩散作用影响的分子动力学模拟[J].绝缘材料.2019
[8].崔晓林,陆峰.表面增强拉曼光谱法联合分子动力学模拟研究小分子及其适配体间的相互作用[C].第二十届全国光散射学术会议（CNCLS20）论文摘要集.2019
[9].曹茂启,王珏,罗骏,刘德见.基于蒙特卡洛分子动力学模拟的算法在天然产物小分子与蛋白质相互作用中的应用[J].广东化工.2019
[10].郭梦茜,方泽辉,曹颖,李全利.仿生釉原蛋白和非釉原蛋白的多肽设计及其分子动力学模拟[C].2019年中华口腔医学会口腔材料专业委员会第十四次全国口腔材料学术年会论文集.2019
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