黄海西部海域沉积物细菌群落及其对环境因子的响应

论文摘要

黄海是西太平重要的边缘海。微生物群落在有机污染物生物地球化学循环中起着十分关键的作用,它们的群落结构、多样性及变化一定程度上反映了沉积物质量的变化。宏基因组学能够在整体水平解析微生物群落结构,真实地揭示原位环境中微生物群落的复杂性和多样性。2016年10月对黄海西部海域19个监测站位的微生物群落及环境因子开展了深入调查。应用Illumina MiSeq宏基因组高通量测序技术,共鉴定海域沉积物中微生物41门266属,变形菌门为明显的优势门类,其相对丰度占总数的47%。其他较为丰富的门类包括酸杆菌门(Acidobacteria),放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes),浮霉菌门(Planctomycetes)和沈微菌门(Verrucomicrobia)。各站位细菌多样性非常高,但站位间差异较大。其中Chaol指数均值为7 365.3;Shannon指数平均为9.65;Simpson指数平均为0.995。应用Past软件,采用CCA分析法研究细菌群落与环境因子的相关性,结果显示总磷和沉积物粒径对微生物门水平的群落分布具有显著性影响。计算细菌与环境因子间Pearson相关系数并绘制热图分析,发现酸杆菌、衣原体(Chlamydiae)和硝化螺旋菌(Nitrospirae)与总磷呈较明显的负相关。

论文目录

• 1 研究方法
•   1.1 样品采集
•   1.2 总DNA提取、测序及序列分析
•   1.3 海域底质生态环境监测
• 2 结果与讨论
•   2.1 海域环境因子
•   2.2 海域沉积物微生物群落
•     2.2.1 序列统计
•     2.2.2 微生物种类组成
•     2.2.3 微生物多样性
•   2.3 对环境因子的响应
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 黄备,邵君波,母清林

关键词: 宏基因组,高通量测序,海洋沉积物,微生物群落,黄海西部

来源: 生态环境学报 2019年07期

年度: 2019

分类: 农业科技,工程科技Ⅰ辑,基础科学

专业: 生物学,海洋学,环境科学与资源利用

单位: 浙江省舟山海洋生态环境监测站

基金: 国家重点研发计划项目(2016YFC1401603),国家自然科学基金面上项目(51678003),生态环境部项目任务(中韩黄海环境联合调查研究),浙江省环保厅科研项目(2018A022,2016A012,2013A020)

分类号: X55;X172

DOI: 10.16258/j.cnki.1674-5906.2019.07.016

页码: 1423-1433

总页数: 11

文件大小: 4186K

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