论文摘要
检测了不同浓度的Mn2+对偏肿革裥菌3个锰过氧化物酶（MnPs）基因Lg-mnp1、2、3在转录水平上的调控作用,为研究MnPs基因的表达调控机制奠定基础。用相关生物信息学方法对基因和蛋白序列进行比对与分析,用qPCR检测了在LNAS培养基内Mn2+4种不同浓度下（0,40,200,400μmol/L） 3个基因在转录水平上的相对表达量。结果表明:3个Lg-mnps在基因结构上不尽相同,既有较多的相似之处,也存在着差异。在外显子的长度和序列组成、内含子的位置上,Lg-mnp1与Lg-mnp2更一致,而Lg-mnp3与二者一些特征相似、一些不尽相同。系统发育分析表明,Lg-mnp1和Lg-mnp2比Lg-mnp3更接近。3个Lg-mnps基因在转录水平上都受不同浓度的Mn2+差异调控,在不同浓度的Mn2+和不同时间条件下的转录水平各不相同,Lg-mnp1的最高转录量是在11 d时200μmol/L Mn2+下,为0. 043; Lg-mnp2的转录变化曲线与Lg-mnp1相似,但最高转录量是在9 d时200μmol/L Mn2+下,为0. 929; Lg-mnp3与Lg-mnp1、2不尽相似,最高转录量是在11 d时40μmol/L Mn2+下,为0. 106。Lg-mnp2的转录水平5 d后几乎在所有浓度Mn2+条件下都远远高于Lg-mnp1和Lg-mnp3的转录水平。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 池玉杰,吴书景,于存
关键词: 锰过氧化物酶基因,生物信息学比对,锰离子,转录调控,荧光定量
来源: 吉林农业大学学报 2019年05期
年度: 2019
分类: 农业科技,基础科学
专业: 生物学
单位: 东北林业大学林学院,广西斯道拉恩索林业有限公司,贵州大学林学院
基金: 黑龙江省自然科学基金项目(C2016006),中央高校基本科研业务费科技平台持续发展专项资金项目(2572018CP05),2018外国文教专家聘请计划高校重点项目(T2018013)
分类号: Q78
DOI: 10.13327/j.jjlau.2019.4508
页码: 540-552
总页数: 13
文件大小: 2534K
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标签：锰过氧化物酶基因论文; 生物信息学比对论文; 锰离子论文; 转录调控论文; 荧光定量论文;