5种楠木木材DNA的提取与条形码鉴定

论文摘要

以楠属的闽楠、桢楠、紫楠和润楠属的建润楠、刨花润楠为研究对象,分别采用Qiagen试剂盒法、CTAB法和SDS-CTAB法提取木材总DNA,对比不同DNA提取方法的提取效果,探索适合楠木木材DNA提取的方法,尝试用DNA条形码的手段识别几种木材。结果表明:3种方法均可提取出质量较好的新鲜木材的DNA。其中,试剂盒提取的DNA有少量蛋白残留,CTAB法和SDSCTAB法提取的DNA总体质量较好,有少量RNA存在,但二者提取效果差异不显著。将楠木木材分别经过30、70℃和103℃干燥后进行DNA提取,发现干燥后的DNA提取量明显下降,其中103℃干燥后仅提取出微量DNA,但仍可以满足PCR扩增的需求。综合来看,CTAB法是楠木木材DNA提取的最优方法。在此基础上,分别对5个树种matK、trnL-trnF、trnL-intron和rpoB的4段DNA条形码序列进行PCR扩增,并对PCR产物进行测序和序列比对分析。4段DNA条形码均不能完全区分5个树种。其中,测序所得5个树种的trnL-intron序列共有5个多态性位点,根据其差异可将楠属和润楠属区分开来,建润楠和刨花润楠也能区分开,但是楠属的3个树种之间不能区分。5个树种的matK序列共有3个多态性位点,可将楠属和润楠属区分,建润楠和刨花润楠也能区分开,但是楠属的3个树种之间不能区分。rpoB和trnL-trnF两段序列的比对结果都显示有2个多态性位点,可以将2个属区分开来,属内种间难以区分。总之,从trnL-intron序列构建的系统发育树来看,几个树种基本可以正确聚类。

论文目录

• 1材料与方法
•   1.1实验材料
•   1.2实验方法
•     1.2.1木材样品的处理及DNA提取
•     1.2.2 PCR扩增、产物纯化及测序
•     1.2.3序列分析及系统发育树的构建
• 2结果与分析
•   2.1不同提取方法的DNA提取结果
•   2.2 PCR扩增结果
•   2.3 PCR产物测序与序列分析
•   2.4系统发育树的构建
• 3结论与讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 乔梦吉,陈柏旭,符韵林

关键词: 提取,条形码,楠属,润楠属,木材识别

来源: 西南林业大学学报(自然科学) 2019年03期

年度: 2019

分类: 农业科技,工程科技Ⅰ辑

专业: 轻工业手工业,林业

单位: 广西大学林学院,广西高校林业科学与工程重点实验室,广西壮族自治区木材产品质量监督检验站

基金: 广西自然科学基金项目(2015GXNSFBA139056)资助,广西林业科技项目(桂林科研[2015]第48号)资助,广西高校林业科学与工程重点实验室支持

分类号: S781.1

页码: 141-148

总页数: 8

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