体重差异双胎新生儿粪便样本DNA提取的优化及分析

论文摘要

目的优化新生儿粪便样本DNA提取方法,提取及分析体重差异双胎新生儿粪便样本DNA。方法从7种DNA提取试剂盒方法中选择对成人粪便样本DNA提取效果最佳的QIAamp DNA Stool Mini Kit法为基准方法,通过钢珠打断前处理、DNA吸附柱收集全部裂解液上清和洗脱液重复洗脱的优化,建立了用于新生儿粪便样本DNA的提取方法。结果该优化方法用于婴儿（出生1个月）粪便样本,结果显示DNA提取浓度平均提高了2.4倍。用于48对双胞胎新生儿出生第1天和第3天粪便样本DNA的提取,经酶标仪及PCR扩增检测,结果显示出生第1天粪便样本DNA提取率为32%,出生3天提取率达83%。RT-PCR显示新生儿第1天到第3天肠道微生物量呈现增长趋势。结论优化的QIAamp DNA Stool Mini Kit法适用于新生儿粪便样本DNA的快速提取,为后续扩增子高通量测序和研究体重差异双胎新生儿肠道菌群构成规律奠定基础。

论文目录

• 1 对象与方法
•   1.1 研究对象
•   1.2 仪器与试剂
•   1.3 方法
•     1.3.1 成人粪便样本DNA的提取
•     1.3.2 粪便样本DNA提取方法的优化
•     1.3.3 96份双胞胎胎儿粪便样本DNA提取及检测
•     1.3.4 数据处理
• 2 结 果
•   2.1 7种方法提取成人粪便样本DNA的比较
•   2.2 QIAamp DNA Stool Mini Kit法优化后DNA提取效果
•   2.3 48对双胎新生儿粪便样本DNA提取
• 3 讨 论
•   3.1 研究意义
•   3.2 新生儿粪便样本DNA提取方法的优化
•   3.3 展望

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张欣,杨静,程坤,冯慧军,崔香香,姚粟

关键词: 提取,粪便,体重差异双胎新生儿

来源: 中国微生态学杂志 2019年12期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 儿科学

单位: 中国食品发酵工业研究院有限公司中国工业微生物菌种保藏管理中心,北京大学第三医院

基金: 国家科技基础条件平台项目(NIMR-2018-4)

分类号: R722.1

DOI: 10.13381/j.cnki.cjm.201912002

页码: 1372-1377

总页数: 6

文件大小: 1090K

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