牦牛MDHI基因的克隆及组织表达分析

论文摘要

苹果酸脱氢酶具有氧化还原活性,主要控制动物机体的能量代谢。旨在克隆牦牛MDHI基因,结合生物信息学和组织表达分析,为研究牦牛MDHI基因的理化性质及功能奠定基础。结果显示,该基因的cDNA序列长1 169 bp,CDS区全长1 005 bp,编码334个氨基酸,编码的蛋白为亲水性稳定蛋白;属于保守结构域家族;有两个跨膜区,分别是6-22位和34-54位;存在26个磷酸化位点,其中有11个Ser磷酸化位点、11个Thr磷酸化位点、4个Tyr磷酸化位点;二级结构主要由α-螺旋（152个,占45.51%）,无规卷曲（110个,占32.93%）组成;三级结构与猪细胞质苹果酸脱氢酶、α-酮丙二酸和四氢NAD的三元复合物的晶体结构具有98.50%的相似性;亚细胞定位分析得到在内质网中分布最多,在高尔基体和细胞核中分布最少;同源性及系统进化树分析表明牦牛该基因与普通牛的同源性最高,推测牦牛MDHI基因在进化水平上较为保守;组织表达分析表明该基因在臀脂中表达量最高,在臀肌中表达量较低,说明该基因参与机体脂肪沉积的调控。成功克隆了MDHI基因CDS区、并进行了生物信息学及组织表达分析。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料
•   1.2 方法
•     1.2.1 总RNA的提取及反转录
•     1.2.2 引物设计及PCR扩增
•     1.2.4 组织表达分析
•     1.2.5 生物信息学在线分析
• 2 结果
•   2.1 牦牛MDHI基因克隆
•   2.2 MDHI蛋白的理化性质预测
•   2.3 牦牛MDHI蛋白的亲水性/疏水性预测与分析
•   2.4 牦牛MDHI基因编码蛋白跨膜区与信号肽分析
•   2.5 牦牛MDHI基因编码蛋白结构域与蛋白功能位点预测
•   2.6 牦牛MDHI基因编码蛋白的高级结构预测
•   2.7 亚细胞定位
•   2.8 同源性、系统进化树分析
•   2.9 组织表达分析
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 陈露露,王会,柴志欣,钟金城,王吉坤,陈智华,姬秋梅,信金伟

关键词: 牦牛,基因,克隆,生物信息学分析,组织表达

来源: 生物技术通报 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,西南民族大学青藏高原研究院,西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

基金: 西南民族大学硕士研究生创新课题重点项目(CX2018SZ102),国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37)

分类号: S823.85;Q78

DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-0712

页码: 129-136

总页数: 8

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