基于全基因组关联分析研究粪肠球菌发酵食品分离株的耐药性

论文摘要

【目的】研究15株分离自自然发酵食品的粪肠球菌（Enterococcus faecalis）和1株粪肠球菌模式株对15种（1种β-内酰胺类和14种非β-内酰胺类）抗生素的耐药性,并通过菌株耐药表型与基因型的关联分析找到粪肠球菌潜在的耐药基因。【方法】利用微量肉汤稀释法检测试验菌株对15种抗生素的耐药性,运用Scoary软件进行表型与基因型的关联分析。【结果】16株粪肠球菌对卡那霉素、万古霉素、利奈唑胺和红霉素100%敏感;对其余11种抗生素均表现出不同程度的耐药,其中对克林霉素为100%耐药。基因组关联分析发现了9个功能基因与5种抗生素（氯霉素、环丙沙星、甲氧苄啶、新霉素和四环素）存在显著相关关系,其中基因FAM000296和FAM005768与氯霉素、甲氧苄啶和环丙沙星的耐药性有关。进一步分析发现基因FAM000296和FAM005768同被注释为Sec G,但基因FAM005768与基因FAM000296相比在3′端丢失了21个碱基。【结论】分离自自然发酵食品的粪肠球菌对多种抗生素具有耐药性,其基因组中携带有潜在的耐药基因。因此,对分离自自然发酵食品的粪肠球菌需要进行全面的安全性评估后方可考虑应用。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 菌株来源
•   1.2 粪肠球菌最小抑菌浓度的测定
•     1.2.1 抗生素制备:粪肠球菌耐药性测定所用的抗生素浓度及其测定范围参考文献[6]。选购的抗
•     1.2.2 菌液的制备:
•     1.2.3 菌液与抗生素溶液的混合:
•     1.2.4 耐药性评价:
•     1.2.5 耐药率的获取:
•   1.3 全基因组关联分析
• 2 结果和分析
•   2.1 粪肠球菌耐药性结果
•   2.2 与耐药性相关的基因
•   2.3 基因Sec G的缺失与菌株的耐药性
• 3 讨论
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 孙雅如,李伟程,余中节,王旭,李敏,王佼,张和平,钟智

关键词: 粪肠球菌,抗生素耐药性,关联分析,发酵食品

来源: 微生物学报 2019年01期

年度: 2019

分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

专业: 生物学,轻工业手工业

单位: 内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业农村部奶制品加工重点实验室

基金: 国家自然科学基金(31601451,31622043)~~

分类号: TS201.3

DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20180080

页码: 113-122

总页数: 10

文件大小: 387K

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