8个茶树WRKY转录因子基因的克隆与表达分析

论文摘要

目的克隆茶树WRKY转录因子（Cs WRKYs）家族中的8个成员,并对其进行生物信息学和非生物胁迫下的表达分析。方法采用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术从"铁观音"茶树品种中克隆8个WRKY基因,运用生物信息学的方法对8个WRKY基因编码的蛋白进行理化性质分析,同时通过与拟南芥同源基因的比较进行进化树的构建、多序列比对及保守基序分析。采用qRT-PCR方法检测8个WRKY基因在低温、干旱和脱落酸（abscisicacid,ABA）胁迫处理下的表达量。结果 8个WRKY转录因子基因开放阅读框（ORF）长度分别为1 407、2 208、1 302、849、978、879、1 443和810 bp,分别编码468、735、433、282、325、292、480和269个氨基酸,GenBank登录号分别为MG298951、MG298952、MG298955、MG298956、MG298957、MG298959、MG298960和MG298963。系统进化树及序列比对分析显示,8个CsWRKYs可以分成了2个大组;除CsWRKY39缺少锌指结构外,其他CsWRKYs均含有WRKYGQK保守七肽结构域及锌指结构组成的WRKY结构域。非生物胁迫下的表达模式显示,CsWRKYs基因在低温、干旱和ABA胁迫处理下均有表达且表达受到不同程度的诱导;CsWRKY2、CsWRKY21、CsWRKY23、CsWRKY44和CsWRKY65基因在低温处理后表达量上调超过2,显著响应低温胁迫;CsWRKY21、CsWRKY23、CsWRKY39和CsWRKY65在干旱胁迫处理12 h及ABA处理6 h时均上调表达。结论克隆获得来自不同组的8个茶树WRKY基因,推测与茶树抗逆密切相关。

论文目录

• 1 材料与仪器
•   1.1 材料与试剂
•   1.2 仪器
• 2 方法
•   2.1 样品处理
•   2.2 总RNA提取及cDNA合成
•   2.3 Cs WRKY基因的克隆
•   2.4 CsWRKYs的生物信息学分析
•   2.5 Cs WRKYs基因非生物胁迫表达分析
• 3 结果与分析
•   3.1 茶树8个WRKY基因的克隆及序列分析
•   3.2 茶树8个WRKY蛋白的生物信息学分析
•   3.3 茶树WRKY蛋白的系统进化树分析
•   3.4 茶树8个WRKY蛋白的结构域分析
•   3.5 茶树8个WRKY蛋白的保守基序分析
•   3.6 茶树8个WRKY基因的非生物胁迫分析
•     3.6.1 Cs WRKYs应答低温胁迫表达模式
•     3.6.2 CsWRKYs应答干旱胁迫表达模式
•     3.6.3 CsWRKYs应答ABA胁迫表达模式
• 4 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王鹏杰,陈笛,林浥,郑知临,郑玉成,杨江帆,岳川,叶乃兴

关键词: 茶树,转录因子,克隆,生物信息学,非生物胁迫

来源: 中草药 2019年03期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学,农业科技

专业: 生物学,农作物

单位: 福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室

基金: 国家自然科学基金项目(31600555),福建省“2011协同创新中心”中国乌龙茶产业协同创新中心专项(闽教科[2015]75号),福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2017181)

分类号: Q943.2;S571.1

页码: 685-693

总页数: 9

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