禽致病性大肠杆菌phoP/Q基因缺失对雏鸡脾脏microRNAs功能的影响

论文摘要

从microRNA（miRNA）水平探究禽致病性大肠杆菌（APEC）phoP/Q基因缺失对雏鸡脾脏功能表达的影响,为APEC的防制提供参考资料。用禽致病性大肠杆菌和其phoP/Q基因的缺失株分别攻毒14日龄雏鸡,采集其脾脏组织为材料进行高通量测序获得miRNA表达谱,选择差异倍数大于8的miRNA进行Real-time PCR,对差异表达的miRNA进行靶基因预测以及GO、KEGG富集分析。测序结果获得10个差异表达的miRNA,其中1个miRNA表达量下调,9个miRNA表达量上调,Real-time PCR结果表明,miRNA变化趋势与测序结果一致,GO分析结果表明,差异表达基因主要富集在能量代谢、免疫系统、细胞生长与凋亡、糖合成与代谢等生物学过程。KEGG分析结果显示预测靶基因参与MAPK信号通路、糖代谢通路、Wnt信号通路等重要通路。本试验分析禽致病性大肠杆菌phoP/Q基因缺失后感染雏鸡脾脏miRNA的表达差异,从miRNA水平探讨了phoP/Q基因缺失对APEC致病性的影响,为APEC的防治提供参考资料。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 实验动物与样品采集
•   1.2 试验方法
•     1.2.1 总RNA的提取
•     1.2.2 miRNA文库的构建及高通量测序
•     1.2.3 差异表达miRNA测序及分析
•     1.2.4 Real-time PCR验证部分差异表达基因
•     1.2.5 miRNA靶基因和生物信息学功能预测
• 2 结 果
•   2.1 脾脏组织中miRNA测序结果
•   2.2 miRNA的靶基因分析
•   2.3 差异表达miRNA的Real-time PCR验证结果
•   2.4 miRNA靶基因的GO和KEGG富集网络图
• 3 讨 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 宋祥军,程悦,邱明宇,薛媚,涂健,邵颖,祁克宗

关键词: 禽致病性大肠杆菌,脾脏,差异表达

来源: 江苏农业学报 2019年05期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 安徽农业大学兽医病理生物学与疫病防控安徽省重点实验室

基金: 国家自然科学基金项目(31802161,31772707),安徽农业大学引进与稳定人才项目(yj2017-31),安徽农业大学青年科学基金重点项目(2017zd01)

分类号: S852.61

页码: 1167-1174

总页数: 8

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