生化遗传论文_宁静,刘振,杨拥军,杨阳,沈程文

导读:本文包含了生化遗传论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:生化,种质,标记,近交系,核型,表型,成分。

生化遗传论文文献综述

宁静,刘振,杨拥军,杨阳,沈程文[1](2019)在《城步峒茶资源主要生化成分遗传多样性分析》一文中研究指出为了深入研究湖南四大地方茶树群体资源之一的城步峒茶,从原产地收集筛选了17份有代表性的资源进行生化成分评价鉴定和遗传多样性分析。结果表明:17份资源生化成分存在丰富的多样性和变异,平均遗传多样性指数达2.34,平均变异系数达24.43%;多变量主成分分析,前4个主成分代表了17份资源生化成分多样性85.197%的信息;对17份资源15个生化成分进行聚类,可分为3大类群,第1大类群为红绿茶兼制的资源,第2大类群也是红绿茶兼制的资源,第3大类群为适制红茶的资源;并从中初步筛选出一批生化成分特异的资源,其中高茶多酚资源17份,高咖啡碱资源2份,高酯型儿茶素资源2份。(本文来源于《茶叶通讯》期刊2019年03期)

覃辉艳,陈华凤,王芳,杨慧,李彬[2](2019)在《微卫星与生化位点法对BALB/c小鼠遗传检测比较分析》一文中研究指出目的应用微卫星DNA标记检测BALB/c小鼠的遗传质量,并与现行国家标准生化标记法进行比较,探讨其在近交系小鼠遗传监测中的应用,为建立微卫星DNA检测方法奠定基础。方法采用20个微卫星基因位点和毛细管电泳技术对BALB/c小鼠进行遗传质量检测,同时采用现行国家标准生化标记法进行检测比较分析。结果各样品20个微卫星基因位点DNA片段大小相同,没有新的等位基因出现;生化标记检测结果亦显示Akp1等14个生化标记基因均为纯合,个体间生化标记表型均一致,根据国家标准符合品系特征。微卫星DNA标记检测结果与生化标记检测结果一致。结论微卫星DNA标记可准确可靠、方便快捷地检测近交系小鼠遗传质量,本研究所选的20个微卫星基因位点可用于BALB/c小鼠遗传质量监测。(本文来源于《实验动物科学》期刊2019年04期)

王烽[3](2019)在《四种SPF猪群体血液生理生化及遗传特征分析》一文中研究指出近几年来,我国的养猪业进入一个快速发展的阶段,随之而来的是猪群健康的恶化和疾病的增加,严重影响了养猪业的健康发展。为了进行疾病和防治药物的研究,首先要建立动物疾病模型。无特定病原体(SPF,Specific Pathogen Free)猪,不携带主要的潜在感染和对科学实验干扰大的病原,更适用于动物疾病模型的建立。生物学特征包括生理、生化、遗传等多个方面。血液生理和生化指标既是猪群体生理健康状态最直观的反映,也是兽医临床诊断疾病、防治疾病不可或缺的重要依据。线粒体DNA具有母系遗传的特点,在遗传和育种方面有广泛的应用;猪白细胞抗原(Swine Leukocyte Antigen,SLA)基因具有高度多态性,分析其遗传背景,对于品种繁殖与育种具有重要的作用。本研究针对四种SPF猪开展了生物学特征研究,为疾病诊断、药物治疗、药物和疫苗研发等奠定基础。首先对SPF猪的血液生理和血液生化特征进行研究。采集200头SPF猪的血液,其中包括大白猪、长白猪、大白长白杂交猪以及长白大白杂交猪各50头。利用五分类血细胞分析仪对23项血液生理指标进行测定;应用全自动生化分析仪对19项血液生化指标进行测定;采用SPSS软件对测定数据进行分析。并一步开展了线粒体DNA及SLA-1基因特征研究。采集40头SPF猪的耳组织,其中包括大白猪、长白猪、大白长白杂交猪以及长白大白杂交猪各10头,进行基因组DNA的提取。应用primer 5.0软件对线粒体DNA D-loop环高变区和SLA-1基因第二外显子和第叁外显子进行引物设计,采用PCR扩增技术对目的片段扩增,扩增产物经1%的聚丙烯酰胺凝胶电泳,观察条带大小,并将PCR产物送往上海生物工程公司测序,将测序结果应用Chromas 2.3软件、MEGA 5.0软件、Clustal X软件以及Dnasp 4.10软件进行数据编辑和统计,分析线粒体DNA D-loop环高变区遗传多样性和SLA-1等位基因的多态性。具体研究结果如下:(1)通过四种SPF猪血液生理和血液生化指标的统计和分析,建立了四种SPF猪的血液生理置信区间和血液生化置信区间,并对其进行了分析。结果表明,长白猪的红细胞数目相对于其他叁种猪,有着更广的置信区间;长白猪的血红蛋白比大白猪有更高的置信区间;大白猪的谷丙转氨酶的置信区间高于长白猪和长白大白杂交猪;长白大白杂交猪的葡萄糖比其他叁种猪有更高的置信区间。虽然四种SPF猪血液生理生化指标的置信区间存在差异,但是差异并不明显。(2)线粒体DNA D-loop环高变区的遗传多样性研究结果表明,在全长为435 bp的核苷酸序列中共检测到13个差异位点,界定了10个单倍型,共享单倍型都存在于杂交猪与其母本之间。对四种猪群差异位点及核苷酸多样度进行分析,结果说明杂交后代发生了新的变异,进而提高了群体的多样性。对获得的D-loop序列进行核苷酸多态性统计分析表明,碱基变异数(S)和核苷酸多样性(Pi)的峰值均出现在第220个碱基附近,该区域较容易发生变异,而在第180 bp到第200 bp、第310 bp到第340 bp则非常保守,不存在变异。最后建立进化树,对其分析表明分为两大类,分别是以杂交猪及其母本为一组,体现了D-loop在遗传上的稳定。(3)SLA-1等位基因多态性的研究结果表明,在SLA-1基因第二外显子和第叁外显子序列中共得到9个等位基因,碱基变异数分布主要集中在151-275 bp和451-575 bp两个碱基区域,变异次数均在20次以上,最高峰值达到32次。大白猪中频率最高的为SLA-1*08:11,频率为55%;长白猪中频率最高的为SLA-1*14:01,频率为35%;大白长白杂交猪中频率最高的为SLA-1*08:11,频率为40%;长白大白杂交猪中频率最高的为SLA-1*12:01,频率为35%。将四种猪所具有的9个SLA-1等位基因所编码的氨基酸与人的HLA-A基因氨基酸序列进行比对,发现高度相似,只有第二外显子的第87-91位有连续的多个氨基酸差异,其他位点均比较相似。最后通过进化树分析得出,为获得更多的遗传优势,可利用等位基因分布较多的雌猪作为母本与雄猪杂交。综上所述,本研究建立了四种一月龄SPF猪的血液生理置信区间和血液生化置信区间。对线粒体DNA D-loop环高变区序列的多态性分析结果表明,高变区序列中存在13个差异位点,界定了10个单倍型,并且共享单倍型都存在于杂交猪与其母本之间,体现了D-loop在遗传上的稳定。对白细胞抗原等位基因的多态性分析时发现核苷酸多样度变化趋势与碱基变异数分布趋势整体上基本一致,将分析得到的9个SLA-1等位基因所编码的氨基酸与人HLA-A基因氨基酸序列进行比对,结果高度相似。(本文来源于《东北农业大学》期刊2019-06-01)

丁帅涛,程晓梅,张亚,万斌,任华江[4](2019)在《基于表型性状和生化成分的陕西茶树种质资源遗传多样性研究》一文中研究指出基于表型性状和生化成分对陕西茶树种质资源遗传多样性进行研究,以期为优异茶树种质资源选育提供信息和科学依据,并加快利用和丰富陕西茶树种质资源种类。利用统计分析、主成分分析和聚类分析方法,对陕西茶树种质资源表型性状和生化成分遗传多样性进行研究,并评价其遗传多样性。陕西茶树种质资源表型性状变异较丰富,不同表型性状变异系数和遗传多样性指数差异较大,变异系数为19.88%~55.96%,平均变异系数31.84%,遗传多样性指数为0.691 8~2.003 0,平均遗传多样性指数1.105 9;陕西茶树种质资源内含物质成分较丰富,基于生化成分的变异系数为10.89%~30.03%,平均变异系数21.78%,遗传多样性指数为1.770 1~2.049 2,平均遗传多样性指数1.890 0;基于表型性状和生化成分的聚类分析结果不一致,表明聚类分析结果与茶树种质资源表型性状、生化成分、DNA分子的遗传多样性和地域分布关系密切,单一依据表型性状或生化成分进行茶树种质资源聚类分析具有一定的局限性。研究结果表明,陕西茶树种质资源遗传多样性较丰富,优异资源筛选潜力较大,具有独特地域性,但属于江北茶区的陕南茶树种质资源遗传多样性丰富程度稍低于南方茶区的四川、广西、贵州等地。基于生化成分初步筛选出高水浸出物(>50%)茶树种质资源3份,高茶多酚(>20%)茶树种质资源4份,高氨基酸(>3%)茶树种质资源4份,低咖啡碱(<1.6%)茶树种质资源4份。(本文来源于《西北农业学报》期刊2019年04期)

郑雄杰[5](2018)在《柑橘果皮红色性状形成的生化基础及遗传机制》一文中研究指出类胡萝卜素组分和含量的变异是导致柑橘果实色泽多样性的主要原因。红色果皮的柑橘品种因其“喜庆”的艳丽色泽一直深受消费者的喜爱,因此也是柑橘果实外观品质遗传改良的一个重要育种目标。但是柑橘新品种的常规选育过程存在成本高,效率低,周期长等诸多限制,因此阐明柑橘果皮类胡萝卜素多态性及色泽形成的遗传机制,并鉴定出与果皮红色性状紧密连锁的分子标记进行辅助育种显得尤为重要。基于此,本研究结合遗传学、多组学、自然群体关联分析、代谢研究和转基因功能验证等多种方法鉴定了柑橘果皮红色性状形成的主效基因及其关键遗传变异位点,并解析了柑橘红色果皮中C_(30)脱辅基类胡萝卜素种属特异演化的分子进化机制。主要研究结果如下:1.基于SLAF简化基因组测序的红橘×枳高密度遗传图谱的构建利用简化基因组测序SLAF-seq技术对红橘和枳F_1双假测交杂交群体的94个杂交子代和亲本进行深度测序,开发了3,817个高质量的SLAF分子标记,并构建了红橘(Citrus reticulata)x枳(Poncirus trifoliata)杂交群体9个连锁群的双亲整合高密度遗传图谱。该遗传图谱分子标记在染色体上分布较均匀,且基因组覆盖度较完整,总图距1,502.44 cM,平均图距为0.42cM。本研究构建的红橘×枳杂交群体高密度遗传图谱将为后续红橘优良的果实品质性状(如红色果皮性状)和枳的优良砧木性状的QTL定位和遗传育种研究奠定重要的基础。2.果皮红色性状形成的类胡萝卜素代谢基础本研究结合半制备液相分离纯化和质谱鉴定了红色果皮中含量较高的C_(30)脱辅基类胡萝卜素β-柠乌素(m/z 433.3[M+H]~+,C_(30)H_(40)O_2)和β-citraurinene(m/z 419.3[M+H]~+,C_(30)H_(42)O)。利用红橘×枳杂交群体和柑橘自然群体进行果皮色差值和类胡萝卜素组分含量的关联分析,发现C_(30)脱辅基类胡萝卜素占总类胡萝卜素的比例与柑橘果皮红色性状正相关系数最高(r>0.9,P-value=2.2E-16)。此外与柑橘果皮红色性状负相关系数最高的为叶黄素和玉米黄质。这些结果说明柑橘果皮是一个由多种类胡萝卜素组分共同影响的复杂性状,而其中C_(30)脱辅基类胡萝卜素对果皮红色性状的影响最大。3.柑橘果皮红色性状的BSA分析,精细定位和候选基因的锁定本研究首先利用红橘(红皮果)和枳(黄皮果)杂交子代混池RNA-seq测序产生的SNP进行BSA分析,将果皮红色性状定位在第8号染色体。再用CAPs标记、SLAF-seq开发的SNP标记和交换单株进行精细定位,将区段缩小到了约1.3Mb的区间(Chr 8:16707807~18021439)。该区间包含CCD4b基因座。红黄果皮混池RNA-seq分析表明CCD4b在红果皮子代混池中的表达量是黄果皮的30多倍。实时荧光定量结果也证实了红皮杂交子代果皮CCD4b基因表达量都高于黄果皮杂交子代。其中亲本红橘的CCD4b基因启动子序列距离起始密码子1537bp处有一个Harbinger类型158bp MITE转座子的插入,且MITE序列上的SNP1~G和SNP2~G与杂交子代红色果皮性状共分离,表明CCD4b很可能是红橘×枳杂交群体果皮红色性状形成的候选基因。4.果皮类胡萝卜素含量的QTL定位本研究通过构建的红橘×枳高密度遗传图谱,对群体12个类胡萝卜素性状进行代谢物mQTL定位。两年的QTL定位共有19个重迭的mQTL位点。其中8个QTL在第八号连锁群的56.2~89.0 CM的区间重迭。这个区间能够解释β-柠乌素,β-citraurinene,玉米黄质,叶黄素,黄体黄质,八氢番茄红素,六氢番茄红素和C_(30)脱辅基类胡萝卜素在杂交群体中的变异。这些性状中C_(30)脱辅基类胡萝卜素与总类胡萝卜素的比例在这个区间具有最高的LOD值(LOD≈36)和表型贡献率(PVE≈91%)。这个区间在克里曼丁基因组中的物理位置为Chr 8:17664105...18572910,与上述红黄果皮性状精细定位的区间Chr 8:16707807~18021439重迭,且重迭区域包含果皮红色性状的候选基因CCD4b,表明CCD4b位点可能是控制群体中C_(30)脱辅基类胡萝卜素和部分C_(40)类胡萝卜素含量变异,进而导致红/黄果皮性状多态性的关键遗传因素。5.候选基因CCD4b的功能验证本研究利用原核表达证实了柑橘CCD4b能够降解玉米黄质产生红色的C_(30)脱辅基类胡萝卜素β-柠乌素。此外利用多基因代谢工程愈伤证实了超表达CCD4b能够在愈伤中产生果皮特有的C_(30)脱辅基类胡萝卜素β-citraurinene,说明CCD4b是控制C_(30)脱辅基类胡萝卜素生物合成的关键基因。超量表达CCD4b也会导致β-胡萝卜素、叶黄素、紫黄质和玉米黄质含量显着下降。这些结果能够与上述类胡萝卜素mQTL结果相互印证,说明CCD4b不仅是C_(30)脱辅基类胡萝卜素变异的主效基因,同时也是杂交群体中C_(40)类胡萝卜素多态性的关键遗传因子。本研究通过原生质体共转化实验证实了CCD4b和拟南芥FBN1a基因共定位,说明CCD4b可能定位在质体小球中,其降解功能可能也发生在质体小球中。与之相互印证的是,超表达CCD4b的愈伤导致质体小球的数量和总面积显着增加,说明转基因愈伤中类胡萝卜素组分和含量的剧烈变化也引起了细胞亚细胞器的适应性重构。6.CCD4b基因表达的等位多态性的分子机理红橘×枳杂交群体和柑橘自然群体中,CCD4b的表达量在与红色性状高度关联。通过杂交群体表达量的eQTL分析表明,CCD4b基因的一个顺式eQTL位点与杂交子代果皮红色性状共分离。自然群体115份材料关联分析结果也表明CCD4b启动子区域MITE转座子序列中的SNP2~G(CAACTG)的G碱基与红色果皮性状紧密连锁,并与CCD4b的高表达量和C_(30)脱辅基类胡萝卜素的含量高度正相关。高分辨率熔解曲线(HRM)实验和等位基因cDNA的PCR产物测序结果表明CCD4b基因的表达存在等位差异,其中在MITE转座子序列中含有SNP2~G(CAACTG)的等位基因对应的CCD4b表达量高于其它等位基因。此外烟草瞬时表达双荧光素酶和GUS酶活性检测实验也证实SNP2~G(CAACTG)能够增强启动子活性。7.柑橘红色果皮中C_(30)脱辅基类胡萝卜素种属特异演化的分子机理CCD4b启动子序列的进化树分析表明CCD4b启动子区域的MITE插入事件和MITE序列中SNP2~G的形成发生在宽皮橘这个种形成之后,与之相对应的是,只有红色果皮的宽皮橘及其杂交种的CCD4b基因高表达,且积累大量C_(30)的脱辅基类胡萝卜素。柑橘有五个CCD4亚家族成员,其中大部分成员都与具有可以降解类胡萝卜素产生C_(27)脱辅基类胡萝卜素功能的其它植物CCD4基因聚在一起,但是CCD4b却与它们处在不同的进化枝中,暗示CCD4b基因是在柑橘CCD4基因亚家族复制进化的事件中产生了功能分化。此外栽培、野生和原始柑橘的CCD4b关键功能域的氨基酸序列很保守,说明CCD4b基因的功能分化事件可能发生在柑橘形成早期,而宽皮橘形成之后,顺式调控区序列的变异导致了CCD4b表达量在红色果皮的宽皮橘中急剧提高,进而导致了C_(30)脱辅基类胡萝卜素仅在红色果皮的宽皮橘及其杂交种中大量积累的种属特异演化。(本文来源于《华中农业大学》期刊2018-12-01)

王鹤[6](2018)在《基于数字微流控生化检验操作调度的混合遗传算法研究》一文中研究指出在生化检验中,多种因素影响生物样本使其难以在数字微流控芯片上保持长时间的最佳实验环境。因此,最小化生化检验完成时间是确保检验结果完整性的关键措施之一。将数字微流控生化检验液滴操作调度问题按多模式资源源约束项目调度问题来处理,提出了利用双层混合遗传算法来优化液滴操作的时序调度;将关键链技术引入遗传算法中,以第一层算法确定液滴调度次序为基础,将关键链技术与第二层遗传算法相结合,对芯片资源进行优化配置。以多元体液体外检验为例,完成了算法的实现。仿真结果表明:双层混合遗传算法提高了解的质量,缩短了生化检验的完成时间,而且减少了计算时间。(本文来源于《制造业自动化》期刊2018年09期)

刘东[7](2018)在《GhKNL1转基因棉花后代株系的遗传及生化分析》一文中研究指出棉花作为世界上最重要的经济作物之一,因为其生长环境要求温度较高,所以热带和亚热带地区种植较多。棉花纤维是纺织、造纸等工业原料,具有很高的经济价值。棉花纤维是由外表皮单细胞突起高度增长和增厚的结果,成熟的棉纤维纤维素含量高达90%以上。因此,棉纤维是一种研究细胞伸长、次生壁合成的模式系统。棉纤维发育分为四个阶段,影响棉纤维密度的起始阶段,影响棉纤维长度的伸长阶段,影响棉纤维强度的次生壁加厚阶段以及脱水成熟阶段。本实验室在棉花基因组中分离克隆了一个Ⅱ类KNOX基因GhKNL1,之前的实验表明该基因在棉纤维次生壁时期高度表达,影响棉纤维细胞次生壁发育,但是该基因具体是怎样发挥作用的尚不清楚。本研究进一步探索GhKNL1对下游靶基因的调控作用,揭示该转录因子的调控机理,为棉纤维品质改良和产量提高提供理论依据。主要研究结果如下:1、GhKNL1转基因棉花后代株系(T2和T3代)表型分析对GhKNL1 RNA干扰(RNAi)和显性抑制(DR)转基因棉花T2代和T3代株系进行表型观察和遗传分析,发现GhKNL1 RNAi转基因棉花成熟纤维长度较野生型(WT)有显着增长,而显性抑制转基因棉花成熟纤维长度较WT明显变短。取开花后18天(Day post anthesis,DPA)、27天、30天、33天棉纤维进行LR White树脂包埋以及石蜡包埋切片,观察纤维细胞横切面的形状、大小以及纤维素含量和次生壁厚度,结果表明,与WT相比,GhKNL1 RNAi转基因棉花纤维细胞壁厚度增加,而GhKNL1 DR转基因棉花纤维次生壁厚度变薄。开花后18天的转基因棉花纤维细胞形态发生皱缩畸形等表型。上述结果表明,GhKNL1转录因子在棉纤维发育过程中发挥负调控作用。2、GhKNL1 RNAi转基因棉纤维细胞壁中纤维素的沉积由于切片观察到GhKNL1转基因棉纤维细胞壁厚度发生改变,而成熟棉纤维次生壁组分90%以上为纤维素,其余是含量很少的半纤维素和木质素等,因此我们利用硫酸蒽酮法提取测定成熟棉纤维中的纤维素,结果发现,与野生型相比,GhKNL1 RNAi转基因棉花纤维中的纤维素含量明显提高。用乙酰溴法提取成熟棉纤维的木质素,发现转基因棉花与野生型相比没有显着变化。扫描电镜观察成熟棉纤维的表面结构,发现RNAi转基因棉花成熟棉纤维更加扭曲,微纤丝的排列方向更加倾斜。3、GhKNL1 RNAi转基因棉花纤维的转录组比较分析为揭示GhKNL1对棉纤维细胞伸长和次生壁合成的调控机制,利用转录组测序技术比较分析了开花后18天的GhKNL1 RNAi转基因棉花与野生型棉花纤维中的差异表达基因。在阈值为pval(本文来源于《华中师范大学》期刊2018-05-01)

邝浩发[8](2018)在《基于GWAS数据研究防城港男性健康队列27项临床生化指标关系模块的分析及遗传信息的挖掘》一文中研究指出目的:全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)是指在人类全基因组范围内找出存在的遗传变异,即单核苷酸多态性(SNP),从中筛选出与疾病或复杂性状相关的SNP位点。临床生化指标为人体生命机能的重要衡量指标,其失调将引起疾病的发生,因此了解这些指标之间的相关性以及遗传背景对研究疾病的发生具有重要的参考价值。本研究通过一系列的实验以及生物信息学方法研究防城港男性健康队列的27项临床生化指标间的关系模块,从表型与表型之间的关系到蛋白与蛋白互作的关系再到全基因组水平的连锁不平衡研究27项临床生化指标之间的相关性,以找出新的临床生化指标之间的关系,进一步通过遗传信息的挖掘找出影响临床数量性状相关模块的关键基因和位点。方法:1.实验方法:(1)对1999例受试者的血清中27项临床生化指标进行生理值测定。(2)血液DNA提取并进行全基因组的基因分型。2.统计方法:(1)对27个临床生化指标之间的相关性研究通过以下叁种方法:第一,基于斯皮尔曼等级相关系数研究临床生化指标之间的相关性。第二,基于改进的杰卡德系数研究临床生化指标之间的相关性。第叁,基于连锁不平衡评分回归研究临床生化指标之间的相关性。(2)遗传信息挖掘:第一,使用Cytoscape对通过BioGRID数据库搜索之后纳入的基因进行基因网络互作图的构建及网络图的分析。第二,所有临床生化指标重要共享位点挖掘。第叁,重要共享位点通过HaploReg数据库等进行注释和分析。结果:1.我们对防城港男性健康队列的1999例血液样本的27个临床生化指标的生理值测定之后进行了平均值和95%置信区间的计算,发现这些指标的生理值均符合正常标准;通过斯皮尔曼相关系数的统计分析,发现这27个临床生化指标之间的相关性可以聚成3个关系模块,模块内大部分的斯皮尔曼相关系数r值均大于0.3;通过相关位点所在基因的蛋白质与蛋白质的互作关系,改进的杰卡德相关系数统计分析之后发现这27个临床生化指标之间的相关性可以聚成4个模块,比斯皮尔曼相关系数统计分析增加了一个相关性模块,并且新发现了免疫球蛋白A(IgA)和睾酮(TE)(J=0.29)、前列腺特异性抗原(PSA)(J=0.28)有着重要的相关关系;基于连锁不平衡评分回归(LDSC)统计方法的重要性,我们对全基因组位点进行了临床生化指标相关性分析,发现这些临床生化指标之间的相关性聚成了5个模块,相对已有文献报道,连锁不平衡评分回归比斯皮尔曼相关系数统计分析和杰卡德相关系数统计分析新发现了骨钙素(osteocalcin)与胆固醇(Cholesterol)(rg=-0.65,P=0.0142)、低密度脂蛋白(LDL)(rg=-0.70,P-0.0483)有着重要的相关关系,肌酐(Creatinine)与促卵泡激素(FSH)(rg=-0.85,P=0.0309)、癌胚蛋白(CEA)(rg=-0.87,P=0.0265)有着重要的相关关系;2.基因多效性,释为单一基因所产生的多重效应。同时影响多个表型的基因或位点对疾病的影响是很重要的,表明这些基因或位点是体内的hub基因或位点。首先我们通过构建基因互作图的“degree”值较高的基因和影响多个临床生化指标的基因进行交集处理,我们找到了183个重要基因。第二,我们对P<10~(-3)的位点进行多个临床生化指标的交集处理,并通过HaploReg数据库和SNP FUNCTION PREDICTION数据库进行注释,找到81个重要位点,对这些重要位点的所在基因与上一步得到的183个重要基因进行交集处理,发现HLA-B、UBASH3B、POU5F1、AMFR、ANXA7和PHB等6个基因是这些方法的交集基因,有5个位点在这些基因上,它们分别是rs7744057(HLA-B)、rs10790521(UBASH3B)、rs9263800(POU5F1)、rs731119(AMFR)、rs7074613(AMFR)和rs2671662(ANXA7)。结论:我们通过1999人的全基因组水平上的分析与27个临床生化指标进行系统的生物信息学分析及数据挖掘,并结合多种已有算法及改进的算法,找到27个临床常用生化指标之间的相关性。另外进一步挖掘到影响这些临床生化指标相关性的遗传信息,文献挖掘表明我们找到的基因HLA-B、UBASH3B、POU5F1、AMFR、ANXA7和PHB与人类疾病有着重要关系,rs7744057、rs10790521、rs9263800、rs731119、rs7074613和rs2671662的HaploReg注释结果表明这些位点具有非常重要的作用及极大的可研究性,本研究为复杂临床生化指标及疾病的遗传研究提供了系统而重要的理论依据。(本文来源于《广西医科大学》期刊2018-05-01)

张林,周剑光,张涛,何力[9](2018)在《长江水系细鳞斜颌鲴形态特征及生化遗传特性分析》一文中研究指出为丰富长江水系细鳞斜颌鲴(Xenocygris microlepis)的遗传特性资料,本研究采用传统的形态学测量方法对30尾长江水系细鳞斜颌鲴的生物学性状进行描述,采用植物血球凝集素(PHA)和秋水仙素腹腔注射、肾细胞直接制片法及同工酶电泳等分子生物学方法,开展长江水系细鳞斜颌鲴的细胞遗传特性及生化遗传特性研究。结果表明:长江水系的细鳞斜颌鲴的8个可数性状依次为侧线鳞数(73.37±2.08)、侧线上鳞数(13.63±0.55)、侧线下鳞数(7.60±0.41)、左侧第一鳃弓外侧鳃耙数(36.50±1.18)、背鳍不分支鳍条数(3.00±0.00)、背鳍分支鳍条数(7.00±0.00)、臀鳍不分支鳍条数(3.00±0.00)、臀鳍分支鳍条数(11.37±0.25);其体细胞染色体数为2N=48,核型公式为20M+24SM+4ST,臂数(NF)为92,未发现性染色体;其肾脏和肌肉组织乳酸脱氢酶(LDH)各有5条同工酶谱带,由Ldh-A、Ldh-B两个基因编码,且肾脏LDH1~LDH2表达丰度略高于肌肉组织。本研究中长江水系的细鳞斜颌鲴的形态特征与长江中游的梁子湖细鳞斜颌鲴群体生物学性状吻合,与淮河水系淮河细鳞斜颌鲴生物学性状不一致,存在着群体差异性。本研究可为细鳞斜颌鲴种质评估、种质标准制定、种质保护及利用提供理论参考。(本文来源于《中国渔业质量与标准》期刊2018年02期)

李迎,陈振文,马兰芝,尚世臣,尚玉璞[10](2017)在《近交系长爪沙鼠生化标记遗传监测方法的建立及其应用》一文中研究指出目的建立近交系长爪沙鼠生化标记遗传检测方法,开展对长爪沙鼠脑缺血模型CMU/1和CMU/2近交系的纯合度进行分析,为判定其遗传状况提供依据。方法采用醋酸纤维板电泳法,选26个生化标记进行近交系长爪沙鼠各组织器官样品电泳,参考前期方法优化最佳电泳条件,并对样品处理和染色的方法进行一定的改良后;针对F21~23代77只CMU/1和44只CMU/2近交系动物26个生化标记的纯合度进行检测。结果在2个近交系长爪沙鼠共121只动物中均能成功检测到26个生化标记。其中有24个位点在CMU/1和CMU/2品系内和品系间均显示单态性,但是Es-3和Es-4位点在2个品系间有差异。结论建立了长爪沙鼠近交系生化标记遗传检测方法;确定近交系CMU/1和CMU/2动物26个生化标记,其纯合度达到100%,说明2个近交系品系符合近交系动物的标准(GB14923-2010)。(本文来源于《实验动物与比较医学》期刊2017年06期)

生化遗传论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的应用微卫星DNA标记检测BALB/c小鼠的遗传质量,并与现行国家标准生化标记法进行比较,探讨其在近交系小鼠遗传监测中的应用,为建立微卫星DNA检测方法奠定基础。方法采用20个微卫星基因位点和毛细管电泳技术对BALB/c小鼠进行遗传质量检测,同时采用现行国家标准生化标记法进行检测比较分析。结果各样品20个微卫星基因位点DNA片段大小相同,没有新的等位基因出现;生化标记检测结果亦显示Akp1等14个生化标记基因均为纯合,个体间生化标记表型均一致,根据国家标准符合品系特征。微卫星DNA标记检测结果与生化标记检测结果一致。结论微卫星DNA标记可准确可靠、方便快捷地检测近交系小鼠遗传质量,本研究所选的20个微卫星基因位点可用于BALB/c小鼠遗传质量监测。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

生化遗传论文参考文献

[1].宁静,刘振,杨拥军,杨阳,沈程文.城步峒茶资源主要生化成分遗传多样性分析[J].茶叶通讯.2019

[2].覃辉艳,陈华凤,王芳,杨慧,李彬.微卫星与生化位点法对BALB/c小鼠遗传检测比较分析[J].实验动物科学.2019

[3].王烽.四种SPF猪群体血液生理生化及遗传特征分析[D].东北农业大学.2019

[4].丁帅涛,程晓梅,张亚,万斌,任华江.基于表型性状和生化成分的陕西茶树种质资源遗传多样性研究[J].西北农业学报.2019

[5].郑雄杰.柑橘果皮红色性状形成的生化基础及遗传机制[D].华中农业大学.2018

[6].王鹤.基于数字微流控生化检验操作调度的混合遗传算法研究[J].制造业自动化.2018

[7].刘东.GhKNL1转基因棉花后代株系的遗传及生化分析[D].华中师范大学.2018

[8].邝浩发.基于GWAS数据研究防城港男性健康队列27项临床生化指标关系模块的分析及遗传信息的挖掘[D].广西医科大学.2018

[9].张林,周剑光,张涛,何力.长江水系细鳞斜颌鲴形态特征及生化遗传特性分析[J].中国渔业质量与标准.2018

[10].李迎,陈振文,马兰芝,尚世臣,尚玉璞.近交系长爪沙鼠生化标记遗传监测方法的建立及其应用[J].实验动物与比较医学.2017

论文知识图

醋纤膜法分析东方田鼠生化遗传位...真核生物基因表达过程示意图九个群体的采样分布点美国红鱼14种同工酶的电泳图谱一4海州湾群体的EST图谱普通红鲫(W1-W6)和实验红鲫C1HD系(H1...

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