豫北塞尼卡谷病毒VP1基因的扩增和序列分析

论文摘要

塞尼卡谷病毒（Seneca Valley virus,SVV）是一种新发的猪病毒病,在我国猪群中已形成一定的流行性。本文首先对豫北一猪场发生水泡症状的猪进行病料采集,然后提取病毒RNA,通过反转录和PCR扩增到SVV的VP1基因,并对其进行测序。通过MegAlign软件对VP1基因序列进行遗传进化分析,利用在线生物信息学软件预测VP1蛋白的信号肽、核定位信号和B细胞表位。结果表明:豫北毒株与一株美国毒株USAIA44952（登录号为KU954090.1）的核苷酸同源性最高,与SVV-001毒株核苷酸同源性最低（登录号为DQ641257.1）,VP1蛋白没有信号肽序列,没有核定位信号,有8个B细胞线性抗原表位。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 病料
•   1.2 主要试剂
•   1.3 VP1基因的扩增与测序
•   1.4 序列分析
• 2 结果
•   2.1 VP1基因的扩增
•   2.2 遗传进化分析
•   2.3 VP1蛋白序列分析
• 3 结语

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 周玲玲,林正丹,时志琪,马园园,张慢

关键词: 塞尼卡谷病毒,蛋白,遗传进化分析

来源: 今日畜牧兽医 2019年10期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 安阳工学院生物与食品工程学院,河南省动物疫病防控与营养免疫院士工作站,河南省兽用生物制品研发与应用国际联合实验室

基金: 安阳工学院青年科研基金项目(QJJ2018007)

分类号: S852.651

页码: 8+2

总页数: 2

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