一株从红藻中分离出的产芳基硫酸酯酶的海单胞菌FW-1的全基因组测序及结果分析（英文）

论文摘要

【目的】海单胞菌Marinomonas sp. FW-1是1株经验证可以获得高活性芳基硫酸酯酶的菌株。为深入研究FW-1菌株产芳基硫酸酯酶机制,进一步筛选高活性的芳基硫酸酯酶基因片段,有必要解析FW-1菌株的全基因组序列信息。【方法】本研究采用高通量测序技术对FW-1进行全基因组测序,使用相关软件对测序数据进行基因组装、基因预测与功能注释、COG聚类分析等。结合异源表达的方法对其不同基因片段所产生的芳基硫酸酯酶活性进行分析。【结果】全基因组测序结果表明该基因组大小为3964876 bp,GC含量为44.03%,编码3590个蛋白基因,含有78个tRNA和25个rRNA操纵子。从全基因组测序结果中找到22个可能具有芳基硫酸酯酶活性的基因,对其中4个进一步异源表达后发现FW-1中至少含有的3个具有芳基硫酸酯酶活性的基因,其均含有芳基硫酸酯酶的特异性氨基酸基团C-X-P-X-R基团。【结论】本研究首次报道了1株含有多个芳基硫酸酯酶基因序列的菌株FW-1的全基因组序列,分析了基因组的基本特征,为芳基硫酸酯酶的进一步应用提供了思路。

论文目录

• 1 Materials and methods
•   1.1 Materials
•     1.1.1 Buffer solution:
•     1.1.2 Culture medium （g/L） :
•   1.2 Validation of Marinomonas sp.FW-1activity and bacterial analysis
•   1.3 Growth and arylsulfatase production curve of Marinomonas sp.FW-1
•   1.4 Culture of strain FW-1 and extraction of genomic DNA
•   1.5 Complete genome analysis of Marinomonas sp.FW-1
•   1.6 Activity analysis of expressed product
• 2 Results
•   2.1 Analysis of Marinomonas sp.FW-1
•   2.2 The growth curve and arylsulfatase production curve of Marinomonas sp.FW-1
•   2.3 Complete genome analysis method of Marinomonas sp.FW-1
•   2.4 Activity analysis of expressed product
• 3 Discussion
• 4 Nucleotide sequence accession number

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王嫱,付晓婷,毛相朝,许加超,高昕

关键词: 海单胞菌,全基因组测序,芳基硫酸酯酶

来源: 微生物学报 2019年04期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 中国海洋大学食品科学与工程学院

基金: Supported by the Grant of Shandong Provincial Key Research and Development Project(2016GSF121034),by the Grant of Public Science and Technology Research Funds Projects of Ocean(201405040)~~

分类号: Q933

DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20180289

页码: 744-752

总页数: 9

文件大小: 3347K

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