论文摘要
目的对衢州市2017年1例曾有孟加拉国旅行史的发热患者血清标本进行基孔肯雅病毒（CHIKV）全基因组序列测定及遗传进化分析。方法无菌采集患者血液,分离血清后采用实时荧光定量PCR检测CHIKV和登革热病毒核酸,反转录PCR扩增CHIKV全基因组靶向基因片段并测序,采用生物信息学软件（Contig Express、SeqMan、Clustalx V2.0、BioEdit V7.0、GENEDOC和MEGA X）分析全基因序列。结果患者血清为CHIKV核酸阳性。测序数据拼接处理后获得CHIKV全基因组序列（QZ0823株）,包含11 787 bp核苷酸,非结构蛋白主要结构位点未发现变异,结构蛋白缺乏E1中的适应性突变A226V和E2中可能影响CHIKV神经毒力的新取代K252Q突变,不存在增强埃及伊蚊的适应性突变E1:K211E和E2:V264A。全基因组序列进化分析显示,QZ0823与孟加拉国、印度、巴基斯坦流行株彼此紧密聚集,具有密切的进化相关性。结论衢州市输入性基孔肯雅病毒QZ0823全基因组和结构基因C-E3-E2-6K-E1核苷酸序列均符合CHIKV特征,与孟加拉国流行株同属东中南非洲遗传谱系（ECSA）。
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 王晓光,杨瑞军,黄世腾,曹国平,雷永良,叶灵
关键词: 基孔肯雅病毒,全基因组,序列测定,进化分析
来源: 中国媒介生物学及控制杂志 2019年06期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技,基础科学
专业: 生物学,基础医学
单位: 丽水市疾病预防控制中心微生物检验科,衢州市疾病预防控制中心
基金: 2019年浙江省医药卫生科技面上项目计划(2019KY237)~~
分类号: R373.9
页码: 621-625
总页数: 5
文件大小: 1561K
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