论文摘要
CueR被证实在细菌中参与抗铜组分的转录调控,但在西瓜食酸菌（Acidovorax citrulli）中还未见报道。通过生物信息学手段对西瓜食酸菌及其他菌中的CueR蛋白进行类比分析,为进一步验证西瓜食酸菌CueR蛋白在铜稳态机制中的功能提供参考。本研究以已经鉴定的大肠杆菌等4个模式细菌中的CueR为参照,对西瓜食酸菌的CueR （AcCueR）与大肠杆菌的EcCueR、铜绿假单胞菌的PaCueR、沙门氏菌的SeCueR、霍乱弧菌的VcCueR蛋白进行一级结构、聚类分析、氨基酸理化性质、亚细胞定位、铜离子结合位点、保守结构域、二级及三级结构等特征分析。研究结果显示:5种蛋白一级结构序列、铜离子结合位点、二级结构百分比、三级结构等相似但并不完全相同;西瓜食酸菌的AcCueR与霍乱弧菌的亲缘关系较近;5种蛋白均为亲水性的、细胞内任何位置定位的、不稳定蛋白质,且N端均含有蛋氨酸残基;除EcCueR为酸性蛋白外,AcCueR等其他蛋白均为碱性蛋白;5种蛋白均属于HTHMerR-SF超家族,三级结构主要由α-螺旋和无规则线圈构成;AcCueR可以与西瓜食酸菌中CopA产生互作,且在copA基因上游存在一个copA启动子序列。对西瓜食酸菌CueR蛋白的生物信息学分析表明:推测AcCueR蛋白与已鉴定的大肠杆菌等菌中的CueR具有相似的结构与功能,显示西瓜食酸菌中可能存在类CueR蛋白。
论文目录
文章来源
类型: 国内会议
作者: 颉兵兵,刘君
关键词: 西瓜食酸菌,蛋白,生物信息学,类比分析
来源: 中国植物病理学会2019年学术年会 2019-07-20
年度: 2019
分类: 基础科学,农业科技
专业: 生物学,农业基础科学,植物保护
单位: 新疆农业大学农学院新疆农业大学林学与园艺学院
分类号: S432.42
DOI: 10.26914/c.cnkihy.2019.020382
页码: 367
总页数: 1
文件大小: 40k
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