屠宰猪猪肺炎支原体P36、P46、P97 R1、P146氨基酸序列的差异分析

论文摘要

为了解猪肺炎支原体流行菌株遗传变异情况,选取2014-2017年不同时间、地点收集的17头猪肺炎支原体阳性屠宰猪肺脏灌洗液DNA为模板,进行猪肺炎支原体P36（编码具有强免疫原性的胞浆蛋白）、P46（编码具有强免疫原性的表面蛋白）、P97 R1区、P146高变区（猪肺炎支原体黏附气管纤毛细胞的重要功能区域）基因的PCR扩增、测序。结合GenBank登录的猪肺炎支原体相关序列进行氨基酸序列的比对分析。结果表明,比对的序列之间,P36、P46蛋白氨基酸序列同源性均在98.9%以上,但P97功能区R1区、P146多变区在菌株间存在较大差异。11个屠宰猪样本和5个GenBank登录菌株P97 R1区重复氨基酸序列数量达到14个以上,而GenBank登录的3个疫苗相关菌株（168株、168-L株、J株）及另外4个菌株、4个屠宰猪样本重复序列为9～11个不等;P146高变区氨基酸序列的差异主要集中在2个重复氨基酸序列区（R1、R2）,GenBank登录的168株、168-L株、J株以及另外2个菌株,1个屠宰猪样本在R1区出现较多氨基酸缺失。168株、168-L株,6个屠宰猪样本及另外3个GenBank登录菌株在R2区出现了3～9个不等的氨基酸缺失。利用DNAStar进行抗原表位预测发现,菌株间P97 R1、P146 R1、P146 R2区氨基酸序列的差异,导致了抗原表位出现明显的变化。提示开展P97、P146等黏附因子的筛选和研究或许能进一步提升疫苗阻止猪肺炎支原体黏附气管纤毛细胞的作用,从而进一步改善疫苗的免疫效果。

论文目录

• 1 材料和方法
•   1.1 主要试剂
•   1.2 猪肺炎支原体阳性样本DNA模板
•   1.3 猪肺炎支原体P36、P46、P97 R1、P146基因PCR扩增引物的设计与合成
•   1.4 不同基因片段的PCR扩增与测序
•   1.5 不同基因片段所编码氨基酸序列的比对分析
• 2 结果与分析
•   2.1 P36、P46、P97 R1、P146基因PCR扩增结果
•   2.2 P36、P46、P97 R1、P146基因测序结果
•   2.3 P36氨基酸序列比对分析结果
•   2.4 P46氨基酸序列比对分析结果
•   2.5 P97 R1区氨基酸序列比对分析结果
•   2.6 P146多变区氨基酸序列比对分析结果
• 3 结论与讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李润成,方超,卿任科,葛猛,赵墩,胡玉立,余兴龙

关键词: 猪肺炎支原体,差异分析

来源: 华北农学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 湖南农业大学动物医学院

基金: 国家重点研发项目(2017YFD0500102)

分类号: S852.62

页码: 212-220

总页数: 9

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