导读:本文包含了卡特利链霉菌论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:卡特,霉菌,霉素,缓冲剂,质体,质粒,白蛋白。
卡特利链霉菌论文文献综述
李鹏[1]（2017）在《卡特利链霉菌线性质粒复制机制及Ⅱ型毒素—抗毒素系统的研究》一文中研究指出卡特利链霉菌(Streptomyces cattleya)是研究硫霉素和含氟化合物生物合成的模式细菌。利用脉冲场凝胶电泳,发现卡特利链霉菌DSM46488可能包含两个巨型的线性复制子(>1.6 Mb)。这种两个巨型复制子的结构在链霉菌基因组中罕见。本论文利用基因组学、生物信息学和分子遗传学等方法来验证这两个新颖的复制子,重点研究巨型线性质粒的复制机制,以探讨两个复制子的进化关系。首先,本论文通过基因组测序和分析确定了卡特利链霉菌DSM46488中的两个复制子结构(对应第叁章)。454焦磷酸测序获得的全基因组数据与脉冲场凝胶电泳结果一致,表明该菌株包含两个巨型的线性复制子,一个为6.28 Mb,另一个为1.81 Mb。基因组分析结果支持了本论文将1.8 Mb的复制子称为质粒的假设,包括:(i)该复制子没有编码rRNA或tRNA,只编码1,747个与初级代谢关系不大的蛋白质,如抗生素生物合成相关蛋白;(ii)在该复制子上没有发现已测序链霉菌染色体核心区中的保守基因;(iii)对与分配系统相关的Par蛋白进行系统发生分析,该复制子Par蛋白(SCATT_p08020和SCATT_p08030)与其他链霉菌质粒Par蛋白聚在一个分支中;而染色体Par蛋白(SCATT_31180)与其他链霉菌染色体Par蛋白聚在另一分支中。因此,本论文将1.8 Mb的复制子确定为巨型线性质粒pSCATT。而另一方面,巨型质粒与染色体之间存在交互作用;例如,含氟化合物的生物合成必需基因散落在这两个线性复制子中。此外,本文在卡特利链霉菌DSM46488染色体中识别到一个放线菌型整合型接合元件(AICE)ICEScaDSM46488-1。初步实验表明,在TSBY、YEME及MM培养基中正常培养时,该AICE能从染色体上发生环出。其次,本论文分析线性质粒pSCATT的端粒-末端蛋白系统,以研究巨型线性质粒pSCATT的复制机制(对应第四章)。链霉菌全基因组测序时,末端序列中存在的二级结构可能导致454焦磷酸测序无法获得完整的末端序列。因此,本文首先单独对这两个复制子的端粒进行了克隆和测序,获得了非典型的端粒序列,包括巨型质粒的两个端粒(cpTelo与pTelo)及染色体的两个端粒(cpTelo与cTelo);其中,cpTelo是巨型质粒和染色体共有的端粒。这些端粒和链霉菌典型端粒的核苷酸序列相似性很低;但和链霉菌典型端粒相似,在大肠杆菌中均表现出启动子活性。据此,本论文推测卡特利链霉菌包含新型的端粒系统。在pSCATT中,本论文预测和鉴定了两套末端蛋白-端粒相关蛋白编码基因,分别是tap1-tpg1(SCATT_p17400-SCATT_p17410)和 tap2-tpg2(SCA TT_p03430-SCA TT_p03440-SCATT_p03450)。它们分别与pSCATT的两个端粒pTelo及cpTelo的复制有关。tap2-tpg2有别于已知的末端蛋白系统,末端蛋白基因位于端粒相关蛋白基因的上游。另外,tap2-tpg2中除了末端蛋白基因和端粒相关蛋白,还有一个SCATT p03430基因,其功能有待深入分析。此外,本论文预测和初步鉴定了巨型质粒pSCATT的复制起始区(对应第四章)。该复制起始区大小约2 kb,位于pSCATT的中心,在分离系统ParAB编码基因上游;携带该DNA片段的重组质粒在变铅青链霉菌能自主复制。该区包括SCATT_p08010及其上游非编码区。尽管该复制起始区与已知复制区的序列相似性很低,但具有复制起始区的普遍特征:(Ⅰ)复制起始蛋白SCATT_p080101含有一个HTH结构域,EMSA实验显示该蛋白与其上游非编码序列存在明显的相互作用;(Ⅱ)非编码序列包含两对长度为13 bp的正向重复序列和两对长度为10 bp的反向重复序列。然而,这个2 kb的DNA片段只能赋予pSCATT在链霉菌中进行环形方式的复制,而不能进行线性方式的复制;本论文推测pSCATT以该复制起始区进行线性复制尚需其他基因的辅助,或者pSCATT依赖其他的复制起始区进行线性复制。最后,本论文还分析了卡特利链霉菌DSM46488基因组中的毒素-抗毒素系统(对应第五章)。Ⅱ型TA系统(Toxin-antitoxin system,TA system)常由一对毒素和抗毒素基因组成一个操纵子,广泛存在于细菌中,与质粒的遗传稳定性及持留细胞形成重要生理过程相关,但在链霉菌中却鲜有相关报道。本论文在DSM46488基因组中预测到了33对Ⅱ型TA系统,包括rel5E、vapBC、phd-doc等家族。在E.coli中检测毒素功能时,发现RelBE家族的RelBE2sca(SCATT_39270-SCATT_39280)表现出TA系统的典型功能。在高渗透压等压力条件下,卡特利链霉菌编码的蛋白酶复合物ClpPX能降解抗毒素RelB2sca,导致毒素RelE2sca从TA复合物中释放,最终激活RelBE2sca的功能。值得关注的是,卡特利链霉菌毒素RelE2sca能被大肠杆菌抗毒素RelBeco中和,表明不同种属的RelBE系统之间存在互作。然而,野生型的抗毒素RelB2sca并不能中和大肠杆菌毒素RelEeco的毒性,但是RelB2sca的Asn61Val及Met68Leu的双突变体却可以中和RelEeco的毒性。此外,relBE2sca在变铅青链霉菌、阿维链霉菌及链霉菌FR008中无同源基因,在这些常用的链霉菌异源表达宿主中也都表现出TA系统的典型功能,表明它具有被开发成一种链霉菌通用的遗传筛选标记的潜能。总之,本论文确定了卡特利链霉菌的两个巨型复制子结构。在巨型线性质粒中发现了两套新的端粒系统,鉴定了一个中心复制起始区。此外,发现了链霉菌中的首例链霉菌中的RelBE家族毒素-抗毒素系统。这些工作将有助于卡特利链霉菌及其他重要链霉菌基因组的进化研究。(本文来源于《上海交通大学》期刊2017-05-01）
崔大鹏,石莲英[2]（1999）在《一种改进卡特利链霉菌358原生质体再生的方法》一文中研究指出以卡特利链霉菌（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓｃａｔｌｅｙａ）３５８为原始菌株，研究了影响原生质体形成和再生的各种因素，证实了再生培养基中含ＨＥＰＥＳ缓冲剂以及Ｐ缓冲液中加入１％的牛血清白蛋白（ＢＳＡ）后能有效地促进再生，在ＳＲ再生培养基上原生质体再生率由０．１％提高到２９．５％。(本文来源于《中国抗生素杂志》期刊1999年04期）
向隆宽,王以光,戴剑漉[3]（1998）在《硫霉素产生菌卡特利链霉菌A520基因文库的构建》一文中研究指出以大肠杆菌／链霉菌穿梭柯斯质粒ｐＫＣ５０５为载体，构建了卡特利链霉菌（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓｃａｔｌｅｙａ）Ａ５２０在大肠杆菌ＤＨ１的基因文库，重组质粒插入外源片段的概率在９５％以上，插入外源片段的大小为２０～３０ｋｂ。以链霉菌染色体分子量为１０４ｋｂ计算，由４０００个转化子构成的基因文库可以概括卡特利链霉菌Ａ５２０约９９％的基因组。用已经克隆的硫霉素环化酶基因上游的１．５ｋｂＤＮＡ片段作为探针杂交，从基因文库得到３２个阳性克隆。用利波曼链霉菌（Ｓ．ｌｉｐｍａｎｉ）中的ＩＰＮＳ基因作为探针杂交，从基因文库得到１个阳性克隆ｐＫＷ２０１／ＤＨ１，并为Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交进一步证实杂交片段在ＢａｍＨⅠ２．７ｋｂ片段上。用来自带小棒链霉菌（Ｓ．ｃｌａｖｕｌｉｇｅｒｕｓ）的克拉维酸生物合成途径中的环化酶基因ｃｓ２作为探针杂交进行筛选，得到１个阳性克隆ｐＫＷ３０１／ＤＨ１，说明所构建的基因文库比较完整，并为进一步研究硫霉素产生菌卡特利链霉菌Ａ５２０中抗生素生物合成基因打下了良好基础(本文来源于《中国抗生素杂志》期刊1998年03期）
向隆宽[4]（1998）在《卡特利链霉菌A520基因文库的构建以及硫霉素生物合成基因的初步研究》一文中研究指出用大肠杆菌／链霉菌穿梭载体pKC505在大肠杆菌DH1中构建了卡特利链霉菌A520的基因文库，基因文库由4000个转化子组成，插入的外~1源DNA片段的大小为20—30kb，所含重组质粒的频率很高，基因组的覆盖率在99％以上，基因文库中的重组质粒在—70℃保存两年后检测重组，酶切带型没有变化，重组质粒DNA没有发生重排，基因文库稳定。 根据基因同源性不同杂交严谨度要求不同的条件，应用叁个来源的DNA探针杂交筛选基因文库，筛选进行了在不同的严谨度下首在不同的严谨度下先进行了预实验，用卡特利链霉菌A520硫霉素环化酶基因tcs上游1.5kb片段杂交筛选基因文库，得到32个阳性克隆(pKW101—pKW132)，用利波曼链霉菌的IPNS基因杂交筛选得到一个阳性克隆pKW201，用带小棒链霉菌的cs2基因为探针杂交筛选得到一个阳性克隆pKW301。 转化阳性克隆的重组质粒到变铅青链霉菌TK24中，转化子在不同的培养基发酵，以对青霉素G不敏感的沙雷氏菌AG4410为指示菌，进行了活性物质的检测，从4000个转化子中得到变铅青链霉菌转化子(pKW102)和(pKW105)产生对指示菌有抑制作用的活性物质，重组质粒pKW102和pKW105中插入的外源DNA片段为25.3kb和29kb，提示该外源DNA片段可能成在编码硫霉素生物合成基因。 通过Southern杂交分析表明质粒pKW201含有与利波曼链霉菌的IPNS基因、与卡特利链霉菌A520硫霉素tcs基因和与带小棒链霉菌中克拉维酸中cs2基因同源的DNA片段，它们分别位于pKW201／BamHI 2.7kb，4.3kb，和1.9kb的DNA片段上。因此，对pKW201进行了深入的研究。绘制了pKW201限制性酶切图谱并将其BamHI酶切后的外源DNA片段亚克隆到pUC18中，得到pKWG1，pKWG2，pKWG3，pKWG4，pKWG5，pKWG6，pKWG7，pKWG8重组质粒，pKW201含有22.9kb的DNA片段，与IPNS基因同源的DNA片段位于pKWG4上，与tcs基因同源的DNA片段位于pKWG3上，与：cs2基因同源的DNA片段位于pKWG6上。tcs基因紧位于IPNS基因上游，与带小棒链霉菌cs2同源的DNA片段位于IPNS基因下游的2.0kb处。 测序分析结果证实，与利波曼链霉菌IPNS基因同源片段为IPNS基因，其转录方向也与其它β—内酰胺产生菌中的IPNS的转录方向和终止位置一致。 用染色体步移法，以IPNS基因为中心，对位于其上游的tcs基因上游的1.5kb的DNA片段进行了测序，序列测得1097bp个核苷酸，DNA序列分析和编码的氨基酸序列同源性比较表明G+C％为75.3，符合链霉菌GC含量高的特点，由其编码的氨基酸序列和tcs编码的一起与点黄青霉菌的(本文来源于《中国协和医科大学》期刊1998-05-01）
卡特利链霉菌论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
以卡特利链霉菌（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓｃａｔｌｅｙａ）３５８为原始菌株，研究了影响原生质体形成和再生的各种因素，证实了再生培养基中含ＨＥＰＥＳ缓冲剂以及Ｐ缓冲液中加入１％的牛血清白蛋白（ＢＳＡ）后能有效地促进再生，在ＳＲ再生培养基上原生质体再生率由０．１％提高到２９．５％。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
卡特利链霉菌论文参考文献
[1].李鹏.卡特利链霉菌线性质粒复制机制及Ⅱ型毒素—抗毒素系统的研究[D].上海交通大学.2017
[2].崔大鹏,石莲英.一种改进卡特利链霉菌358原生质体再生的方法[J].中国抗生素杂志.1999
[3].向隆宽,王以光,戴剑漉.硫霉素产生菌卡特利链霉菌A520基因文库的构建[J].中国抗生素杂志.1998
[4].向隆宽.卡特利链霉菌A520基因文库的构建以及硫霉素生物合成基因的初步研究[D].中国协和医科大学.1998
论文知识图
